Rchr
J-GLOBAL ID:201701001764521487
Update date: Feb. 06, 2025 Niide Teppei
ニイデ テッペイ | Niide Teppei
Affiliation and department: Job title:
助教
Homepage URL (1): http://www-shimizu.ist.osaka-u.ac.jp/hp/index.html Research field (2):
Applied biofunctional and bioprocess engineering
, Molecular biology
Research keywords (3):
合成生物学
, 代謝工学
, タンパク質工学
Research theme for competitive and other funds (11): - 2024 - 2029 A Study of Science and Process Construction of Microbial Gas-phase Reaction
- 2024 - 2028 海洋微生物への非光合成炭酸固定経路設計
- 2023 - 2028 配列・機能相関学習による酵素育種
- 2024 - 2027 In-cell enzyme optimization cycle with evolutionary information and CRISPR base editor
- 2022 - 2025 進化情報を構造シミュレーションに組み入れた合理的酵素設計とそのプロセス化
- 2021 - 2024 微細藻類の変動光に対する光化学系と代謝のシステム解析
- 2020 - 2022 Requirment driven protein design for nano targeting drug production
- 2020 - 2022 構造情報に基づいたin silico酵素改変が先導するスマート代謝経路設計
- 2018 - 2021 Bottom-up design of anti-material bispecific antibodies for the formation of hetero-nanocomposite materials
- 2016 - 2019 Application of hybrid nano-assembly for in-vitro synthetic biology tool
- 2012 - 2013 金属ナノ粒子-タンパク質複合体の生体内一段階調製プロセスの開発
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Papers (25): -
Hiroki Nishiguchi, Teppei Niide, Yoshihiro Toya, Hiroshi Shimizu. Modification of intracellular metabolism by expression of a C-terminal variant of phosphoribulokinase from Synechocystis sp. PCC 6803. Bioscience, biotechnology, and biochemistry. 2025
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Chinatsu Matsuyama, Taisuke Seike, Nobuyuki Okahashi, Teppei Niide, Kiyotaka Y Hara, Yoko Hirono-Hara, Jun Ishii, Hiroshi Shimizu, Yoshihiro Toya, Fumio Matsuda. Metabolome analysis of metabolic burden in Escherichia coli caused by overexpression of green fluorescent protein and delta-rhodopsin. Journal of bioscience and bioengineering. 2024. 137. 3. 187-194
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Kenta Miyoshi, Ryutaro Kawai, Teppei Niide, Yoshihiro Toya, Hiroshi Shimizu. Functional evaluation of non-oxidative glycolysis in Escherichia coli in the stationary phase under microaerobic conditions. JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING. 2023. 135. 4. 291-297
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Sou Sugiki, Teppei Niide, Yoshihiro Toya, Hiroshi Shimizu. Logistic Regression-Guided Identification of Cofactor Specificity-Contributing Residues in Enzyme with Sequence Datasets Partitioned by Catalytic Properties. ACS SYNTHETIC BIOLOGY. 2022. 11. 12. 3973-3985
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Ryutaro Kawai, Yoshihiro Toya, Kenta Miyoshi, Manami Murakami, Teppei Niide, Takaaki Horinouchi, Tomoya Maeda, Atsushi Shibai, Chikara Furusawa, Hiroshi Shimizu. Acceleration of target production in co-culture by enhancing intermediate consumption through adaptive laboratory evolution. BIOTECHNOLOGY AND BIOENGINEERING. 2022. 119. 3. 936-945
more... MISC (71): -
二井手 哲平. Interview 1. 生物工学会誌. 2024. 102. 3. 134-135
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寺木遥, 今田辰海, 三吉健太, 二井手哲平, 清水浩, 戸谷吉博. Evaluation of the reverse glyoxylate shunt in engineered Escherichia coli strains based on 13 C labeling experiments. 日本生物工学会大会講演要旨集. 2024. 76th
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三吉健太, 今田辰海, 寺木遥, 二井手哲平, 戸谷吉博, 清水浩. 13C-glucose labeling method for metabolic flux analysis of non-oxidative glycolysis in Escherichia coli. 日本生物工学会大会講演要旨集. 2024. 76th
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二井手哲平. バイオものづくりにおけるデータ駆動酵素工学. Molecular Electronics and Bioelectronics (Web). 2024. 35. 1
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二井手哲平, 杉木創, 森聖也, 戸谷吉博, 清水浩. Application of Logistic Regression Models for Identification of Residues Determining Substrate Specificity in Enzymes. 日本生物工学会大会講演要旨集. 2023. 75th
more... Patents (6): Lectures and oral presentations (18): -
大規模配列情報で実現する探索規模を制限した酵素改変
(第75回構造生物応用研究会 2024)
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バイオモノづくりにおけるデータ駆動酵素工学
(応用物理学会 M&BE未来技術研究会 2024 2024)
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機械学習を活用した酵素の分子認識特性の変換
(化学工学会第54回秋季大会)
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モデル基盤代謝デザインと指向性進化による微生物創製
(化学工学会第54回秋季大会)
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機械学習を用いた代謝酵素の基質特異性決定残基の推定と変換
(第75回日本生物工学会大会)
more... Committee career (3): - 2023/01 - 現在 生物工学会誌バイオミディア委員
- 2024/09 - 化学工学会 第55回秋季大会 バイオ部会ポスターセッション オーガナイザー
- 2021/01 - 2022/12 化学工学会誌トピックス委員
Awards (1): Association Membership(s) (3): Return to Previous Page