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J-GLOBAL ID:201701001764521487   Update date: Feb. 06, 2025

Niide Teppei

ニイデ テッペイ | Niide Teppei
Affiliation and department:
Job title: 助教
Homepage URL  (1): http://www-shimizu.ist.osaka-u.ac.jp/hp/index.html
Research field  (2): Applied biofunctional and bioprocess engineering ,  Molecular biology
Research keywords  (3): 合成生物学 ,  代謝工学 ,  タンパク質工学
Research theme for competitive and other funds  (11):
  • 2024 - 2029 A Study of Science and Process Construction of Microbial Gas-phase Reaction
  • 2024 - 2028 海洋微生物への非光合成炭酸固定経路設計
  • 2023 - 2028 配列・機能相関学習による酵素育種
  • 2024 - 2027 In-cell enzyme optimization cycle with evolutionary information and CRISPR base editor
  • 2022 - 2025 進化情報を構造シミュレーションに組み入れた合理的酵素設計とそのプロセス化
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Papers (25):
  • Hiroki Nishiguchi, Teppei Niide, Yoshihiro Toya, Hiroshi Shimizu. Modification of intracellular metabolism by expression of a C-terminal variant of phosphoribulokinase from Synechocystis sp. PCC 6803. Bioscience, biotechnology, and biochemistry. 2025
  • Chinatsu Matsuyama, Taisuke Seike, Nobuyuki Okahashi, Teppei Niide, Kiyotaka Y Hara, Yoko Hirono-Hara, Jun Ishii, Hiroshi Shimizu, Yoshihiro Toya, Fumio Matsuda. Metabolome analysis of metabolic burden in Escherichia coli caused by overexpression of green fluorescent protein and delta-rhodopsin. Journal of bioscience and bioengineering. 2024. 137. 3. 187-194
  • Kenta Miyoshi, Ryutaro Kawai, Teppei Niide, Yoshihiro Toya, Hiroshi Shimizu. Functional evaluation of non-oxidative glycolysis in Escherichia coli in the stationary phase under microaerobic conditions. JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING. 2023. 135. 4. 291-297
  • Sou Sugiki, Teppei Niide, Yoshihiro Toya, Hiroshi Shimizu. Logistic Regression-Guided Identification of Cofactor Specificity-Contributing Residues in Enzyme with Sequence Datasets Partitioned by Catalytic Properties. ACS SYNTHETIC BIOLOGY. 2022. 11. 12. 3973-3985
  • Ryutaro Kawai, Yoshihiro Toya, Kenta Miyoshi, Manami Murakami, Teppei Niide, Takaaki Horinouchi, Tomoya Maeda, Atsushi Shibai, Chikara Furusawa, Hiroshi Shimizu. Acceleration of target production in co-culture by enhancing intermediate consumption through adaptive laboratory evolution. BIOTECHNOLOGY AND BIOENGINEERING. 2022. 119. 3. 936-945
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MISC (71):
  • 二井手 哲平. Interview 1. 生物工学会誌. 2024. 102. 3. 134-135
  • 寺木遥, 今田辰海, 三吉健太, 二井手哲平, 清水浩, 戸谷吉博. Evaluation of the reverse glyoxylate shunt in engineered Escherichia coli strains based on 13 C labeling experiments. 日本生物工学会大会講演要旨集. 2024. 76th
  • 三吉健太, 今田辰海, 寺木遥, 二井手哲平, 戸谷吉博, 清水浩. 13C-glucose labeling method for metabolic flux analysis of non-oxidative glycolysis in Escherichia coli. 日本生物工学会大会講演要旨集. 2024. 76th
  • 二井手哲平. バイオものづくりにおけるデータ駆動酵素工学. Molecular Electronics and Bioelectronics (Web). 2024. 35. 1
  • 二井手哲平, 杉木創, 森聖也, 戸谷吉博, 清水浩. Application of Logistic Regression Models for Identification of Residues Determining Substrate Specificity in Enzymes. 日本生物工学会大会講演要旨集. 2023. 75th
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Patents (6):
Lectures and oral presentations  (18):
  • 大規模配列情報で実現する探索規模を制限した酵素改変
    (第75回構造生物応用研究会 2024)
  • バイオモノづくりにおけるデータ駆動酵素工学
    (応用物理学会 M&BE未来技術研究会 2024 2024)
  • 機械学習を活用した酵素の分子認識特性の変換
    (化学工学会第54回秋季大会)
  • モデル基盤代謝デザインと指向性進化による微生物創製
    (化学工学会第54回秋季大会)
  • 機械学習を用いた代謝酵素の基質特異性決定残基の推定と変換
    (第75回日本生物工学会大会)
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Committee career (3):
  • 2023/01 - 現在 生物工学会誌バイオミディア委員
  • 2024/09 - 化学工学会 第55回秋季大会 バイオ部会ポスターセッション オーガナイザー
  • 2021/01 - 2022/12 化学工学会誌トピックス委員
Awards (1):
  • 日本生物工学会 第32回生物工学論文賞
Association Membership(s) (3):
日本化学会 ,  日本生物工学会 ,  化学工学会
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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