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J-GLOBAL ID:201801004787840012   Update date: Mar. 21, 2025

Shimizu Takayuki

シミズ タカユキ | Shimizu Takayuki
Clips
Affiliation and department:
Research field  (5): Molecular biology ,  Functional biochemistry ,  Cell biology ,  Plants: molecular biology and physiology ,  Applied microbiology
Research keywords  (8): シグナル伝達 ,  硫化水素/ポリファルファー ,  システイン修飾 ,  レドックス制御 ,  環境応答 ,  紅色細菌/光合成細菌 ,  植物 ,  藻類
Research theme for competitive and other funds  (23):
  • 2024 - 2029 超硫黄分子を考慮したレドックス制御から生理機能を理解する
  • 2023 - 2027 環状化硫黄S8による超硫黄分子シグナル伝達の制御機構
  • 2025 - 2027 超硫⻩分子によるレドックス代謝制御
  • 2025 - 2026 植物の葉緑体形成を制御する超硫黄分子シグナル伝達機構の解明
  • 2025 - 2026 光合成細菌の超硫黄分子代謝を利用した生物脱硫装置の開発
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Papers (18):
  • Kentaro P. Iwata, Takayuki Shimizu, Yuuki Sakai, Tomoyuki Furuya, Hinatamaru Fukumura, Yuki Kondo, Tatsuru Masuda, Kimitsune Ishizaki, Hidehiro Fukaki. Evolutionary conserved RLF, a plant cytochromeb5-like heme-binding protein, is essential for organ development inMarchantia polymorpha. 2024
  • Yingxi Chen, Kohji Nishimura, Mutsutomo Tokizawa, Yoshiharu Y Yamamoto, Yoshito Oka, Tomonao Matsushita, Kousuke Hanada, Kazumasa Shirai, Shoji Mano, Takayuki Shimizu, et al. Alternative localization of HEME OXYGENASE 1 in plant cells regulates cytosolic heme catabolism. Plant Physiology. 2024
  • Tomo Kondo, Takayuki Shimizu. TED: Enhancing Translation Efficiency in Bacterial Expression Systems. Methods in molecular biology (Clifton, N.J.). 2024. 2844. 211-218
  • Tomo Kondo, Takayuki Shimizu. Translation Enhancement by a Short Nucleotide Insertion at 5′UTR: Application to an In Vitro Cell-Free System and a Photosynthetic Bacterium. Applied Microbiology. 2023
  • Takayuki Shimizu, Masaru Hashimoto, Tatsuru Masuda. Thioredoxin-2 Regulates SqrR-Mediated Polysulfide-Responsive Transcription via Reduction of a Polysulfide Link in SqrR. Antioxidants. 2023
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MISC (9):
  • 清水隆之. 細菌における超硫黄分子センシング機構と金属の関係性. 月間「アグリバイオ」. 2022. 6. 4. 58-62
  • 清水隆之. 細菌における活性硫黄種センシング機構と金属の関係性. 月刊「細胞」. 2022. 54. 3. 26-28
  • 清水隆之, 増田真二. 硫化水素・超硫黄分子のセンシング機構. 生化学. 2021. 93. 5. 637-642
  • Tetrapyrrole- and GUN1-Dependent Plastid Signaling on Chloroplast Biogenesis. 2021. 31. 1. 50-62
  • 清水隆之. 細菌性ウイルス様粒子GTAによる環境適応機構の分子基盤. Institute for Fermentation, Osaka. Research Communications. 2021. 35
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Patents (1):
Books (1):
  • 基礎生命科学実験 = Introductory course in life science experiments
    東京大学出版会 2021 ISBN:9784130622271
Lectures and oral presentations  (72):
  • ポリスルフィドがシロイヌナズナの光形態形成におよぼす影響の解析
    (第66回日本植物生理学会 2025)
  • Analysis of transcriptional regulatory mechanisms in response to polysulfide and reactive oxygen species in purple photosynthetic bacterium
    (2025)
  • 紅色光合成細菌における硫黄顆粒の代謝・排出に関わるトランスポーターおよび関連因子の解析
    (第66回日本植物生理学会 2025)
  • シロイヌナズナのヘム特異的トランスポーター四重変異株の作出と表現型解析
    (第66回日本植物生理学会 2025)
  • 進化的に保存されたシトクロムb5様ヘム結合タンパク質であるRLFはゼニゴケにおける適切な器官発生に必要である
    (第66回日本植物生理学会 2025)
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Education (3):
  • 2013 - 2017 Tokyo Institute of Technology Graduate School of Bioscience and Biotechnology
  • 2011 - 2013 Tokyo Metropolitan University
  • 2007 - 2011 Tokyo Metropolitan University Faculty of Urban Liberal Arts Faculty of Urban Liberal Arts
Professional career (1):
  • 博士(理学) (東京工業大学)
Work history (2):
  • 2023 - 現在 Nara Women's University
  • 2017 - 2023 The University of Tokyo Graduate School of Arts and Sciences Department of Multi-Disciplinary Sciences,General Systems Sciences
Committee career (2):
  • 2025/03 - 現在 日本植物学会 ダイバーシティ推進委員
  • 2018/03 - 2021/03 日本光合成学会若手の会 会長
Awards (6):
  • 2024/11 - 日本生化学会 2024年度日本生化学会奨励賞
  • 2024/11 - 化学情報協会 2024年度JAICI賞
  • 2024/08 - 公益財団法人 クリタ水・環境科学振興財団 2023年度 クリタ水・環境科学研究優秀賞
  • 2017/04 - 日本科学協会 2016年度笹川科学研究奨励賞
  • 2017/03 - 東京工業大学 第22回赤池ジャーナル賞
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Association Membership(s) (4):
THE BOTANICAL SOCIETY OF JAPAN ,  THE JAPANESE SOCIETY OF PLANT PHYSIOLOGISTS ,  THE JAPANESE SOCIETY OF PHOTOSYNTHESIS RESEARCH ,  日本生化学会
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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