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J-GLOBAL ID：201801011296786926
Update date: Jun. 21, 2024
Daisuke Takaya
Daisuke Takaya
Affiliation and department：
Other affiliations (1)：
Research keywords (9)：
創薬
, インシリコスクリーニング
, FMODB
, SBDD
, CADD
, LBDD
, 機械学習
, 生物分子設計
, フラグメント分子軌道法
Research theme for competitive and other funds (5)：
- 2023 - 2027 理論創薬研究における系統的前処理による確からしい生体現象予測と検証
- 2022 - AIとFMO法を融合したインシリコスクリーニングと分子間相互作用解析支援
- 2017 - 2022 構造インフォマティクスとFMO計算を融合したインシリコスクリーニング支援研究
- 2018 - 2021 Collection of inter- and intramolecular interactions data and applications of database to drug discovery based on fragment molecular orbital method
- 2014 - 2016 Prediction of Residues with Key Interactions with Ligands Based on Receptor Environmental Properties
Papers (28)：
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Yuya Seki, Chiduru Watanabe, Norihiko Tani, Kikuko Kamisaka, Tatsuya Ohyama, Daisuke Takaya, Teruki Honma. Structural Stability and Binding Ability of SARS-CoV-2 Main Protease with GC376: A Stereoisomeric Covalent Ligand Analysis by FMO calculation. Chem-Bio Informatics Journal. 2024. 24. 13-24
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Chiduru Watanabe, Shigenori Tanaka, Yoshio Okiyama, Hitomi Yuki, Tatsuya Ohyama, Kikuko Kamisaka, Daisuke Takaya, Kaori Fukuzawa, Teruki Honma. Quantum Chemical Interaction Analysis between SARS-CoV-2 Main Protease and Ensitrelvir Compared with Its Initial Screening Hit. The Journal of Physical Chemistry Letters. 2023. 3609-3620
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Nobuo Cho, Ko Kikuzato, Yushi Futamura, Takeshi Shimizu, Hiroki Hayase, Kikuko Kamisaka, Daisuke Takaya, Hitomi Yuki, Teruki Honma, Mamoru Niikura, et al. New antimalarials identified by a cell-based phenotypic approach: Structure-activity relationships of 2,3,4,9-tetrahydro-1H-β-carboline derivatives possessing a 2-((coumarin-5-yl)oxy)alkanoyl moiety. Bioorganic & medicinal chemistry. 2022. 66. 116830-116830
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Takaaki Tatsuguchi, Takehito Uruno, Yuki Sugiura, Kounosuke Oisaki, Daisuke Takaya, Daiji Sakata, Yoshihiro Izumi, Takaya Togo, Yuko Hattori, Kazufumi Kunimura, et al. Pharmacological intervention of cholesterol sulfate-mediated T cell exclusion promotes antitumor immunity. Biochemical and Biophysical Research Communications. 2022. 609. 183-188
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Kazue Inaba, Kana Ebihara, Miki Senda, Ryunosuke Yoshino, Chisako Sakuma, Kotaro Koiwai, Daisuke Takaya, Chiduru Watanabe, Akira Watanabe, Yusuke Kawashima, et al. Molecular action of larvicidal flavonoids on ecdysteroidogenic glutathione S-transferase Noppera-bo in Aedes aegypti. BMC Biology. 2022. 20. 43. 43-43
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MISC (22)：
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上村憲汰, 半田佑磨, 古石誉之, 米持悦生, 上村みどり, 遠藤真弓, 田雨時, 高谷大輔, 福澤薫, 福澤薫. FMO計算を用いたIL10-IL10受容体複合体間の相互作用解析. 日本薬学会関東支部大会講演要旨集. 2022. 66th (CD-ROM)
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渡邉千鶴, 田中成典, 沖山佳生, 大山達也, 神坂紀久子, 幸瞳, 高谷大輔, 福澤薫, 本間光貴. FMO法を用いたSARS-CoV-2メインプロテアーゼ-阻害薬S-217622結合メカニズムの解明. 構造活性相関シンポジウム講演要旨集. 2022. 50th (CD-ROM)
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海老原佳奈, 稲葉和恵, 千田美紀, 小祝孝太郎, 高谷大輔, 渡邉千鶴, 安孫子ユミ, 今村理世, 岡部隆義, 小島宏建, et al. ネッタイシマカの脱皮ホルモン生合成制御因子Noppera-boに対する阻害剤の作用機序に関する構造生物学的研究. 日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集. 2022. 22nd (Web)
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海老原佳奈, 稲葉和恵, 小祝孝太郎, 高谷大輔, 渡邉千鶴, 安孫子ユミ, 今村理世, 岡部隆義, 小島宏建, 佐久間知佐子, et al. Novel Insecticides Targeting the Molting Hormone Biosynthetic Pathway in Aedes aegypti. 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web). 2022. 2022
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Kaori Fukuzawa, Koichiro Kato, Chiduru Watanabe, Yusuke Kawashima, Yuma Handa, Ami Yamamoto, Kazuki Watanabe, Tatsuya Ohyama, Kikuko Kamisaka, Daisuke Takaya, et al. Special feature of COVID-19 in FMODB: Fragment molecular orbital calculations and interaction energy analysis of SARS-CoV-2 related proteins. 2021
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Books (7)：
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タンパク質の構造解析手法と In silicoスクリーニングへの応用事例
2023 ISBN:9784861049712
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口頭発表 O6 「計算化学(分子認識)/ 構造相関解析 / 量子構造生命科学」
CBI学会誌第10巻第4号 2022
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TS-02 第 29 回 FMO 研究会 「FMO データベースの実践チュートリアル - 生体高分子の認識機構解析: MD 連携、核酸分子解析 -」報告書
2022
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チュートリアル「第24回FMO研究会 FMOデータベースの最新機能紹介と実践チュートリアル-COVID-19関連タンパク質の分子認識機構解析-」報告書
CBI学会誌 第9巻第4号 2021
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SAR News No.40; 理論創薬及び関連分野における SARS-CoV-2 研究動向 2020~2021/3
日本薬学会 構造活性相関部会 2021
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Lectures and oral presentations (42)：
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インシリコスクリーニング(LBDD)のための最近のフィンガープリントの性能検討
(第50回構造活性相関シンポジウム 2022)
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Constructing QSAR models for c-Met inhibitors
(CBI 2022 年大会 2022)
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Recent Progress in the Development of FMODB: A Database of QM-based Interaction Data of Biomolecules for Drug Discovery and Protein Functional Analysis
(Biologics By Design Asia 2022 2022)
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Development of small chemical compounds that specifically inhibit the deubiquitinating enzyme USP15
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VISCANA による SARS-CoV-2 main protease とリガンドの網羅的相互作用解析
(第49回構造活性相関シンポジウム プログラム 2021)
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Works (4)：
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FMODB: The database of quantum mechanical data based on the FMO method
2019 - 現在
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FMODBチュートリアル資料2021
高谷大輔 2021 -
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Cover art, Journal of Chemical Information and Modeling, Volume 61, Issue 2
2021 -
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公開用githubリポジトリ
Work history (2)：
- 2022/06 - 現在 RIKEN
- 2020/10 - 2022/05 RIKEN
Committee career (7)：
Awards (1)：
- 2022/12 - 日本薬学会 構造活性相関部会 SAR Presentation Award(第50回構造活性相関シンポジウム) インシリコスクリーニング(LBDD)のための最近のフィンガープリントの性能検討
Association Membership(s) (1)：
THE PHARMACEUTICAL SOCIETY OF JAPAN
