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J-GLOBAL ID：201801011296786926 Update date: Nov. 21, 2024

Daisuke Takaya

Affiliation and department：
Other affiliations (1)：

Research keywords (9)：創薬 , インシリコスクリーニング , FMODB , SBDD , CADD , LBDD , 機械学習 , 生物分子設計 , フラグメント分子軌道法

Research theme for competitive and other funds (5)：

2023 - 2027 理論創薬研究における系統的前処理による確からしい生体現象予測と検証
2022 - AIとFMO法を融合したインシリコスクリーニングと分子間相互作用解析支援
2017 - 2022 構造インフォマティクスとFMO計算を融合したインシリコスクリーニング支援研究
2018 - 2021 Collection of inter- and intramolecular interactions data and applications of database to drug discovery based on fragment molecular orbital method
2014 - 2016 Prediction of Residues with Key Interactions with Ligands Based on Receptor Environmental Properties

Papers (32)：

Daisuke Takaya, Shu Ohno, Toma Miyagishi, Sota Tanaka, Koji Okuwaki, Chiduru Watanabe, Koichiro Kato, Yu-Shi Tian, Kaori Fukuzawa. Quantum chemical calculation dataset for representative protein folds by the fragment molecular orbital method. Scientific Data. 2024
Daisuke Takaya. Computer-Aided Drug Design Using the Fragment Molecular Orbital Method: Current Status and Future Applications for SBDD. Chemical and Pharmaceutical Bulletin. 2024. 72. 9. 781-786
Yudai Kudo, Kana Nakamura, Honoka Tsuzuki, Kotaro Hirota, Mina Kawai, Daisuke Takaya, Kaori Fukuzawa, Teruki Honma, Yuta Yoshino, Mitsuhiro Nakamura, et al. Docosahexaenoic acid enhances the treatment efficacy for castration-resistant prostate cancer by inhibiting autophagy through Atg4B inhibition. Archives of biochemistry and biophysics. 2024. 760. 110135-110135
Kikuko Kamisaka, Shunpei Nagase, Chiduru Watanabe, Daisuke Takaya, Hitomi Yuki, Teruki Honma. Statistical analysis of interactions among amino acid residues in apo structures using fragment molecular orbital method. Chem-Bio Informatics Journal. 2024. 24. 25-47
Yuya Seki, Chiduru Watanabe, Norihiko Tani, Kikuko Kamisaka, Tatsuya Ohyama, Daisuke Takaya, Teruki Honma. Structural Stability and Binding Ability of SARS-CoV-2 Main Protease with GC376: A Stereoisomeric Covalent Ligand Analysis by FMO calculation. Chem-Bio Informatics Journal. 2024. 24. 13-24

MISC (33)：

福澤薫, 福澤薫, 白井智子, 武部克希, 高谷大輔, 飯島洋, 飯島洋. COMT-Ligand Molecular Interactions Based on Crystal Structures and Quantum Chemical Calculations. 日本薬学会年会要旨集(Web). 2024. 144th
TIAN Yu-Shi, MARTIN, MARTIN, NASUTION Mochammad Arfin Fardiansyah, 高谷大輔, 水口賢司, 水口賢司, 福澤薫. Interaction Analysis Between Xanthine Oxidoreductase and Inhibitors Using the Fragment Molecular Orbital Calculation. 日本薬学会年会要旨集(Web). 2024. 144th
小田島大貴, 宮川柊兵, 半田佑磨, 古石誉之, 米持悦生, 佐藤朋広, 幸瞳, 本間光貴, 高谷大輔, 上村みどり, et al. Study of novel inhibitors of m-Glu5 using fragment molecular orbital method. 日本薬学会年会要旨集(Web). 2024. 144th
上村憲汰, 半田佑磨, 半田佑磨, 宮岸澄真, 古石誉之, 米持悦生, 遠藤真弓, 上村みどり, TIAN Yushi, 高谷大輔, et al. Molecular design based on interaction analysis between IL-10 receptor complexes using FMO calculations. 日本薬学会年会要旨集(Web). 2024. 144th
OHNO Shu, FUJIWARA Aina, KAWAI Gota, NAKATANI Kazuhiko, HANDA Yuma, HANDA Yuma, TIAN Yu-Shi, TAKAYA Daisuke, FUKUZAWA Kaori. Structure and interaction analysis of complexes between BzDANP and bulged RNAs using NMR and dynamical FMO calculation. CBI学会大会(CD-ROM). 2023. 2023

Books (7)：

タンパク質の構造解析手法と In silicoスクリーニングへの応用事例
2023 ISBN:9784861049712
口頭発表 O6 「計算化学(分子認識)/ 構造相関解析 / 量子構造生命科学」
CBI学会誌第10巻第4号 2022
TS-02 第 29 回 FMO 研究会「FMO データベースの実践チュートリアル - 生体高分子の認識機構解析: MD 連携、核酸分子解析 -」報告書
2022
チュートリアル「第24回FMO研究会 FMOデータベースの最新機能紹介と実践チュートリアル-COVID-19関連タンパク質の分子認識機構解析-」報告書
CBI学会誌第9巻第4号 2021
SAR News No.40; 理論創薬及び関連分野における SARS-CoV-2 研究動向 2020~2021/3
日本薬学会構造活性相関部会 2021

Lectures and oral presentations (44)：

FMODBにおける生体高分子の量子化学的相互作用データ収集及び活用の試み
(CBI学会2024年大会 2024)
Collection of quantum chemical calculation data covering the basic folds of proteins and the development of methodologies
(第24回日本蛋白質科学会 2024)
インシリコスクリーニング(LBDD)のための最近のフィンガープリントの性能検討
(第50回構造活性相関シンポジウム 2022)
Constructing QSAR models for c-Met inhibitors
(CBI 2022 年大会 2022)
Recent Progress in the Development of FMODB: A Database of QM-based Interaction Data of Biomolecules for Drug Discovery and Protein Functional Analysis
(Biologics By Design Asia 2022 2022)

Works (4)：

FMODB: The database of quantum mechanical data based on the FMO method
2019 - 現在
FMODBチュートリアル資料2021
高谷大輔 2021 -
Cover art, Journal of Chemical Information and Modeling, Volume 61, Issue 2
2021 -
公開用githubリポジトリ

Work history (2)：

Committee career (7)：

Show all

Awards (1)：

2022/12 - 日本薬学会構造活性相関部会 SAR Presentation Award(第50回構造活性相関シンポジウム) インシリコスクリーニング(LBDD)のための最近のフィンガープリントの性能検討

Association Membership(s) (2)：

THE PHARMACEUTICAL SOCIETY OF JAPAN , 日本蛋白質科学会

※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.


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