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J-GLOBAL ID：201801017585517168   Update date: Aug. 24, 2023

Masahiko Okuda

オクダ マサヒコ | Masahiko Okuda
Clips
Affiliation and department：
横浜市立大学 生命医科学研究科

About 横浜市立大学 生命医科学研究科


Job title： 特任准教授
Research field  (1)： Structural biochemistry
Research theme for competitive and other funds  (6)：
  • 2021 - 2023 ヒトRNAポリメラーゼと基本転写因子TFIIHとの複合体の構造モデルの構築
  • 2016 - 2019 ヒトRNAポリメラーゼIIと基本転写因子TFIIHのNMR法による複合体構
  • 2011 - 2014 ヒト基本転写因子TFIIEのNMR法による全長構造の解明
  • 2009 - 2011 ヒト基本転写因子TFIIEの完全長複合体のNMR法による立体構造解析
  • 2007 - 2009 ヒト基本転写因子TFIIEの全体構造解明に向けたNMRによるドメイン構造解析
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Papers (21)：
  • Yoshifumi Nishimura, Masahiko Okuda. Structural polymorphism of the PH domain in TFIIH. Bioscience Reports. 2023. 43. 7. BSR20230846
  • Masahiko Okuda, Yasuo Tsunaka, Yoshifumi Nishimura. Dynamic structures of intrinsically disordered proteins related to the general transcription factor TFIIH, nucleosomes, and histone chaperones. Biophysical Reviews. 2022. 14. 6. 1449-1472
  • Masahiko Okuda, Tetsufumi Suwa, Hidefumi Suzuki, Yuki Yamaguchi, Yoshifumi Nishimura. Three human RNA polymerases interact with TFIIH via a common RPB6 subunit. Nucleic acids research. 2022. 50. 1. 1-16
  • Masahiko Okuda, Toru Ekimoto, Jun-ichi Kurita, Mitsunori Ikeguchi, Yoshifumi Nishimura. Structural and dynamical insights into the PH domain of p62 in human TFIIH. Nucleic Acid Research. 2021. 49. 5. 2916-2930
  • Masahiko Okuda, Yoshifumi Nishimura. The Eaf3 chromodomain acts as a pH sensor for gene expression by altering its binding affinity for histone methylated-lysine residues. Bioscience reports. 2020. 40. 2. BSR20191958
ｍore...
MISC (2)：
  • Masahiko Okuda, Yoshifumi Nishimura. Structural biology of a general transcription factor, TFIIE and its interaction mode with TFIIH. Seikagaku. 2008. 80. 6. 501-510
  • OKUDA M., WATANABE Y., HANAOKA F., OHKUMA Y., NISHIMURA Y. Structulral analysiIs of the general transcription factor TFIIE β subunit. 1998. 21. 279-279
Patents (2)：
  • 出芽酵母CHD1クロモドメインの製造方法及びその核磁気共鳴スペクトルの利用
  • ヒトTFIIEαの新規な亜鉛結合ドメインの構造的特徴および機能
Books (5)：
  • 細胞
    北隆館 2019
  • NMR分光法
    講談社 2016
  • 生化学
    日本生化学学会 2008
  • 構造プロテオミクス: 蛋白質ネットワークの構造生物学
    共立出版 2003
  • 生物の科学 遺伝
    裳華房 1993
Lectures and oral presentations  (3)：
  • NMRによるTFIIHの機能構造解析
    (BINDS-NMR報告会 2021)
  • 転写因子やDNA修復因子の構造機能解析
    (創薬等先端技術支援基盤プラットフォーム 2018)
  • タンパク質のリン酸化反応とタンパク質間相互作用変化のNMR法によるリアルタイムモニタリング
    (よこはまNMR研究会 第55回ワークショップ 2016)
Professional career (1)：
  • 理学
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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