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National Institute of Genetics
About National Institute of Genetics
Research theme for competitive and other funds (2)：
- 2024 - 2026 赤潮原因藻ヘテロシグマの赤潮形成期における増殖加速機構の解明を目指した研究
- ヒト薬物代謝関連遺伝子変異がタンパク質機能と構造に及ぼす影響の生命情報学解析
- Yuki Matsumoto, Claire Yik-Lok Chung, Sachiko Isobe, Mika Sakamoto, Xiao Lin, Ting-Fung Chan, Hideki Hirakawa, Genki Ishihara, Hon-Ming Lam, Shinobu Nakayama, et al. Chromosome-scale assembly with improved annotation provides insights into breed-wide genomic structure and diversity in domestic cats. Journal of advanced research. 2024
- Hiroto Toyoda, Akiyoshi Tani, Yuko Goto-Koshino, Tomoki Motegi, Mika Sakamoto, Takako Mochizuki, Kei Harada, Tetsuya Kobayashi, Asuka Setoguchi, Yohei Shizuta, et al. Gene expression profiles associated with early relapse during first remission induction in canine multicentric high-grade B-cell lymphoma. The Journal of veterinary medical science. 2023
- Takako Mochizuki, Mika Sakamoto, Yasuhiro Tanizawa, Takuro Nakayama, Goro Tanifuji, Ryoma Kamikawa, Yasukazu Nakamura. A practical assembly guideline for genomes with various levels of heterozygosity. Briefings in Bioinformatics. 2023. 24. 6
- Fumitaka Shitamori, Ayaka Nonogaki, Tomoki Motegi, Yuki Matsumoto, Mika Sakamoto, Yasuhiro Tanizawa, Yasukazu Nakamura, Tomohiro Yonezawa, Yasuyuki Momoi, Shingo Maeda. Large-scale epidemiological study on feline autosomal dominant polycystic kidney disease and identification of novel PKD1 gene variants. Journal of feline medicine and surgery. 2023. 25. 7. 1098612X231185393
- Masanori Yoshida, Kazuhiko Nakabayashi, Wentao Yang, Aiko Sato-Otsubo, Shin-Ichi Tsujimoto, Hiroko Ogata-Kawata, Tomoko Kawai, Keisuke Ishiwata, Mika Sakamoto, Kohji Okamura, et al. Prevalence of pathogenic variants in cancer-predisposing genes in second cancer after childhood solid cancers. Cancer medicine. 2023. 12. 10. 11264-11273
- 坂本美佳, 中村保一. 獣医療に役立つ高品質ゲノム配列と遺伝子情報. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2024. 47th
- 西山典秀, 望月孝子, 坂本美佳, 谷澤靖洋, 津田勝利, 佐藤(志水)佐江, 吉川貴徳, 中村保一, 豊田敦, 佐藤豊. Genome analysis of the highly salt-tolerant wild rice Oryza coarctata. 育種学研究. 2024. 26
- 神川龍馬, 坂本美佳, 中村保一. ヒト以外の遺伝子に関連する研究 光合成能喪失によるゲノム進化:従属栄養性珪藻を例に. 遺伝子医学. 2024. 14. 2
- 望月孝子, 坂本美佳, 谷澤靖洋, 中山卓郎, 谷藤吾朗, 神川龍馬, 中村保一. A Practical Guide to Genome Assembly with Varied Levels of Heterozygosity. 育種学研究. 2024. 26
- 坂本美佳, 松前ひろみ, 小木曽映里, 望月孝子, 谷澤靖洋, KRYUKOV Kirill, 今西規, 豊田敦, 亀井克彦, 細矢剛, et al. De novo gene annotation highlights differences in genomic compositions among Schizophyllum commune strains. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2023. 46th
- 実験医学別冊 改訂 独習Pythonバイオ情報解析 生成AI時代に活きるJupyter、NumPy、pandas、Matplotlib、Scanpyの基礎を身につけ、シングルセル、RNA-Seqデータ解析を自分の手で
羊土社 2025 ISBN:9784758122788 - 実験医学別冊 独習Pythonバイオ情報解析 : Jupyter、NumPy、pandas、Matplotlibを理解し、実装して学ぶシングルセル、RNA-Seqデータ解析
羊土社 2021 ISBN:9784758122498
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獣医療に役立つ高品質ゲノム配列と遺伝子情報
(第47回日本分子生物学会年会 2024) -
新規遺伝子アノテーションで明らかになるスエヒロタケ複数株におけるゲノム構成の違い
(第46回日本分子生物学会年会 2023) -
アノテーションソースの裏側(仮)
(遺伝研研究会「アノテーソン2023」 2023) -
細胞内共生画像におけるクロレラ検出 AI の構築
(第6回植物インフォマティクス研究会 2023) -
Development of a mammalian genome annotation database
(International Workshop on “Neotechnologies for ThermusQ initiative” 2023)
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DockerとRでMariaDBを使う
坂本美佳 2021 - 現在 -
Rで表形式データを扱ってみる
坂本美佳 2021 - 現在
- 2015 - 2019 Ochanomizu University Graduate School of Humanities and Sciences Life Sciences
- 2013 - 2015 The Open University of Japan School of Graduate Studies Graduate School of Arts and Sciences
- 1987 - 1991 Saitama University Faculty of Science
- Ph. D
- 2024/10 - 現在 Kochi University Faculty of Science and Technology Department of Information Science
- 2019/04 - 現在 National Institute of Genetics
- 2017/07 - 2019/03 National Centor of Child Health and Development Medical genome centor
- 2015/04 - 2017/06 Nihon BioData Corporation
- 2011/10 - 2015/03 Chuo University Faculty of Science and Engineering, Department of Biological Sciences
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- 2017 - 特定非営利活動法人 並列生物情報処理イニシアティブ 第4回IT創薬コンテスト学生奨励賞 「Sirt1阻害剤(候補)の探索」
日本バイオインフォマティクス学会
, SOCIETY OF EVOLUTIONARY STUDIES, JAPAN
, THE BIOPHYSICAL SOCIETY OF JAPAN
, THE MOLECULAR BIOLOGY SOCIETY OF JAPAN
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.
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