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J-GLOBAL ID:202001004502844255   Update date: Oct. 17, 2024

Komaki Shohei

Komaki Shohei
Research field  (4): Ecology and environmental science ,  Biodiversity and systematics ,  Evolutionary biology ,  Genomics
Research keywords  (6): Biogeography ,  Molecular phylogeny ,  Hybridization ,  Introgression ,  DNA methylation ,  Gene expression
Research theme for competitive and other funds  (6):
  • 2023 - 2028 Usefulness of metabolite biomarker as a common pathway for the prevention of non-communicable diseases and frailty
  • 2022 - 2025 The process of expanding the distribution of domestically introduced species revealed by Genome-Wide Association Study
  • 2021 - 2024 周産期のストレス曝露に起因する児の知能・精神発達遅滞のバイオマーカー確立
  • 2018 - 2021 Ecology and evolution of hot-spring frogs
  • 2015 - 2016 リュウキュウカジカガエルの火山島への漂流分散と高温耐性の関連
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Papers (51):
  • Masatoshi Nagata, Shohei Komaki, Yuichiro Nishida, Hideki Ohmomo, Megumi Hara, Keitaro Tanaka, Atsushi Shimizu. Influence of physical activity on the epigenetic clock: evidence from a Japanese cross-sectional study. Clinical epigenetics. 2024. 16. 1. 142-142
  • Yoichi Sutoh, Tsuyoshi Hachiya, Yayoi Otsuka-Yamasaki, Shohei Komaki, Shiori Minabe, Hideki Ohmomo, Makoto Sasaki, Atsushi Shimizu. Healthy lifestyle practice correlates with decreased obesity prevalence in individuals with high polygenic risk: TMM CommCohort study. Journal of human genetics. 2024
  • MINABE Shiori, KOMAKI Shohei, OHMOMO Hideki, SHIMIZU Atsushi. DNA Methylation Study in DOHaD Theory: A Perspective from the Tohoku Medical Megabank (TMM) Project. Developmental Origins of Health and Disease Research. 2024. 12. 1. 5-10
  • Shu Tadaka, Junko Kawashima, Eiji Hishinuma, Sakae Saito, Yasunobu Okamura, Akihito Otsuki, Kaname Kojima, Shohei Komaki, Yuichi Aoki, Takanari Kanno, et al. jMorp: Japanese Multi-Omics Reference Panel update report 2023. Nucleic acids research. 2023
  • Y-h. Taguchi, Shohei Komaki, Yoichi Sutoh, Hideki Ohmomo, Yayoi Otsuka-Yamasaki, Atsushi Shimizu. Integrated analysis of human DNA methylation, gene expression, and genomic variation in iMETHYL database using kernel tensor decomposition-based unsupervised feature extraction. PLOS ONE. 2023. 18. 8. e0289029-e0289029
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MISC (7):
  • 小巻 翔平, 清水 厚志. 【ゲノム医療におけるデータベース-使い方とコツ】一般集団・多因子疾患関連バリアントのデータベース iMETHYL. 遺伝子医学. 2022. 12. 1. 20-23
  • 藤岡 周助, 岡 香織, 河村 佳見, 菰原 義弘, 中條 岳志, 山村 祐紀, 大岩 祐基, 須藤 洋一, 小巻 翔平, 大豆生田 夏子, et al. ハダカデバネズミの炎症応答の減弱は発がん耐性に寄与している. 日本薬学会年会要旨集. 2021. 141年会. 29V08-am11S
  • 小野加奈子, 大桃秀樹, 福本健太郎, 小巻翔平, 事崎由佳, 八谷剛史, 大友亮, 篠崎夏子, 志波優, 古川亮平, et al. Exploratory studies for depression indicators by DNA-methylation capture sequencing. 日本遺伝子診療学会大会プログラム・抄録集. 2019. 26th
  • 小巻翔平, 井川武, 住田正幸. リュウキュウカジカガエル幼生・幼体の色彩変異. 爬虫両生類学会報. 2014. 2014. 1. 17-18
  • 小巻翔平. 種子島におけるヌマガエル生息の報告. 爬虫両生類学会報. 2012. 2012. 1. 1-2
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Books (3):
  • バリアントデータ検索&活用 : 変異・多型情報を使いこなす達人レシピ
    羊土社 2020 ISBN:9784758122450
  • 遺伝子医学
    株式会社メディカルドゥ 2020
  • 次世代シークエンサーDRY解析教本
    学研メディカル秀潤社,学研プラス (発売) 2019 ISBN:9784780909838
Lectures and oral presentations  (1):
  • 疫学研究におけるDNAメチル化情報の活用
    (日本疫学会 第28回疫学セミナー 2021)
Education (3):
  • 2012 - 2015 広島大学大学院 理学研究科 博士課程後期
  • 2010 - 2012 広島大学大学院 理学研究科 博士課程前期
  • 2006 - 2010 信州大学 理学部 生物科学科
Work history (6):
  • 2023/04 - 現在 Iwate Medical University
  • 2022/10 - 2023/03 Iwate Medical University
  • 2018/01 - 2022/09 Iwate Medical University Iwate Tohoku Medical Megabank Organization
  • 2016/07 - 2017/12 岩手医科大学 いわて東北メディカル・メガバンク機構 特別研究員
  • 2015/04 - 2016/06 Hiroshima University
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Awards (3):
  • 2016/03 - Egami Award
  • 2013/09 - Zoological Science Award Distributional change and epidemic introgression in overlapping areas of Japanese pond frog species over 30 years
  • 2013/09 - Fujii Award Distributional change and epidemic introgression in overlapping areas of Japanese pond frog species over 30 years
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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