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J-GLOBAL ID：200901055328608810   Update date: Feb. 27, 2024

Ishihama Yasushi

イシハマ ヤスシ | Ishihama Yasushi
Affiliation and department：
Kyoto University Graduate School of Pharmaceutical Sciences

About Kyoto University Graduate School of Pharmaceutical Sciences


Job title： Professor
Research field  (1)： Pharmaceuticals - analytical and physicochemistry
Research keywords  (5)： Proteomics ,  Post-Translational Modification ,  Mass Spectrometry ,  Separation Science ,  HPLC
Research theme for competitive and other funds  (33)：
  • 2022 - 2026 Pathophysiological study of NMD-targeted transcripts by trans-omics analysis
  • 2022 - 2025 メタオミクスと質量分析イメージングによる根尖性歯周炎の再発マーカー因子探索
  • 2021 - 2024 Large-scale proteoform analysis for unveiling the entire view
  • 2020 - 2022 Spatio-temporal proteomics based on MS silencing
  • 2019 - 2022 Analysis of metabolic adaptation and three-dimensional structure changes caused by regenerative therapy with FGF-2.
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Papers (276)：
  • Taylor Battellino, Darien Yeung, Haley Neustaeter, Vic Spicer, Kosuke Ogata, Yasushi Ishihama, Oleg V Krokhin. Retention time prediction for post-translationally modified peptides: Ser, Thr, Tyr-phosphorylation. Journal of chromatography. A. 2024. 1718. 464714-464714
  • Ryota Tomioka, Ayana Tomioka, Kosuke Ogata, Hsin-Ju Chan, Li-Yu Chen, Ulises H Guzman, Yue Xuan, Jesper V Olsen, Yu-Ju Chen, Yasushi Ishihama. Extending the Coverage of Lys-C/Trypsin-Based Bottom-up Proteomics by Cysteine S-Aminoethylation. Journal of the American Society for Mass Spectrometry. 2024. 35. 2. 386-396
  • Hiroshi Nishida, Eisuke Kanao, Yasushi Ishihama. Centrifugal Gel Crushing Tips for Gel-Based Proteome Analysis. Analytical Chemistry. 2023
  • Kazuya Tsumagari, Yosuke Isobe, Yasushi Ishihama, Jun Seita, Makoto Arita, Koshi Imami. Application of Liquid-Liquid Extraction for N-terminal Myristoylation Proteomics. Molecular & cellular proteomics : MCP. 2023. 22. 12. 100677-100677
  • Tomoya Niinae, Naoyuki Sugiyama, Yasushi Ishihama. Validity of the cell-extracted proteome as a substrate pool for exploring phosphorylation motifs of kinases. Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms. 2023. 28. 10. 727-735
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MISC (601)：
  • 小形公亮, 石濱泰. 小さなセルの大きな世界-高感度分析技術が照らしだすシングルセルプロテオーム. 化学. 2022. 77. 5
  • 前田朝登, 小形公亮, 杉山直幸, 石濱泰. Sensing protein conformational changes by in vitro phosphorylation tagging. 日本薬学会年会要旨集(Web). 2022. 142nd
  • 森川和哉, 内山純貴, 西田紘士, 今見考志, 石濱泰. Proteome-wide analysis of N-terminal acetylation of nascent polypeptides. 日本薬学会年会要旨集(Web). 2022. 142nd
  • 花田毅己, 金尾英佑, 金尾英佑, 村岡賢, 李優嘉, 新苗智也, 今見考志, 杉山直幸, 足立淳, 足立淳, et al. Large-scale discovery of BRAF substrates by proteomic approaches. 日本薬学会年会要旨集(Web). 2022. 142nd
  • 工藤拓実, 山下蓮太郎, WU Pei-Shan, 杉山直幸, 石濱泰. High-speed taxonomy profiling by proteomics approaches. 日本薬学会年会要旨集(Web). 2022. 142nd
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Patents (51)：
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Books (3)：
  • 臨床プロテオミクス-バイオマーカー探索から個別化医療へ
    金原出版 2012
  • 疾患克服をめざしたケミカルバイオロジー
    羊土社 2012
  • 「特集」プロテオミクスが解き明かす情報伝達ネットワーク : タンパク質リン酸化の全体像の解析から病態機構の理解分子標的薬評価の応用まで
    羊土社 2009 ISBN:9784758100526
Lectures and oral presentations  (84)：
  • Peptide Chromatographic Approaches for Illuminating Human Proteome
    (18th KHUPO Annual International Proteomics Conference 2018)
  • ショットガンプロテオミクスにおける計測と情報の新展開
    (第15回北里疾患プロテオーム研究会 2018)
  • Proteomic Data Integration and Sharing by jPOST Repository/Database
    (International Life Science Integration Workshop 2018)
  • Kinome activity profiling based on large-scale kinase-substrate relationships
    (AOMSC 2017 2017)
  • プロテオミクスを用いて暗黒キノーム世界を照らす
    (キャピラリー電気泳動シンポジウム講演要旨集 2017)
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Works (5)：
  • 理研・植物科学研究センターでの招待講演「進化するプロテオミクス質量分析」
    2006 -
  • 2006年サーモエレクトロンユーザーズフォーラムでの招待講演「プロテオミクス質量分析の挑戦」
    2006 -
  • 第9回ヒューマンサイエンス総合研究ワークショップでの招待講演「定量的プロテオミクスの展開」
    2006 -
  • 第222回東北大学薬学研究科セミナーでの招待講演「定量的プロテオミクスの展開」
    2006 -
  • 第54回質量分析総合討論会、企業セミナー(日本ダイオネクス主催)での招待講演「定量的組織プロテオーム解析法の開発とその応用」
    2006 -
Education (2)：
  • - 1992 Kyoto University
  • - 1990 Kyoto University Faculty of Engineering School of Industrial Chemistry
Professional career (1)：
  • Ph. D. (Kyoto University)
Work history (5)：
  • 2010/10 - 現在 Kyoto University Graduate School of Pharmaceutical Sciences
  • 2006/04 - 2010/09 慶應義塾大学大学院政策・メディア研究科特別研究助教授
  • 2006/10 - 2010/03 (独)科学技術振興機構さきがけ研究員(兼任)
  • 2004/04 - 2006/03 慶應義塾大学大学院政策・メディア研究科特別研究助教授(非常勤・兼任)
  • 2001/07 - 2003/07 南デンマーク大学生化学分子生物学科 客員研究員
Committee career (18)：
  • 2023/05 - 現在 Mass Spectrometry Society of Japan President
  • 2023/03 - 現在 Division of Physical Sciences, the Pharmaceutical Society of Japan VIce President
  • 2023/01 - 現在 Asia Oceania Human Proteome Organisation (AOHUPO) Vice President
  • 2022/11 - 現在 Journal of Pharmaceutical and Biomedical Analysis Open Journal of Pharmaceutical and Biomedical Analysis Open, Editorial Board
  • 2021/12 - 現在 DNA Research Editor
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Awards (8)：
  • 2022/07 - The Japanese Biochemical Society Journal of Biochemistry Award Quantitative nascent proteome profiling by dual-pulse labelling with O-propargyl-puromycin and stable isotope-labelled amino acids
  • 2022/06 - The Mass Spectrometry Society of Japan MSSJ AWARD for Excellent Paper Effect of Phosphorylation on the Collision Cross Sections of Peptide Ions in Ion Mobility Spectrometry
  • 2021/09 - The Japan Society for Analytical Chemistry JSAC Award
  • 2020/11 - The Terabe Shigeru Prize
  • 2018/11 - The Society for Chromatographic Sciences SCS Award
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Association Membership(s) (10)：
THE JAPAN SOCIETY FOR ANALYTICAL CHEMISTRY ,  American Society for Biochemistry and Molecular Biology ,  Human Proteome Organization ,  American Society for Mass Spectrometry ,  THE MOLECULAR BIOLOGY SOCIETY OF JAPAN ,  THE JAPANESE BIOCHEMICAL SOCIETY ,  THE PHARMACEUTICAL SOCIETY OF JAPAN ,  Society for Chromatographic Sciences ,  THE MASS SPECTROMETRY SOCIETY OF JAPAN ,  Japanese Proteomics Society
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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