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J-GLOBAL ID：202003004011812561

インフルエンザウイルス解析装置、インフルエンザウイルス解析方法及びインフルエンザウイルス解析プログラム

Inventor： 内田 裕子 ,  西藤 岳彦 ,  竹前 喜洋 ,  常國 良太 ,  金平 克史 ,  岡 岳彦 ,  中村 雄一郎 ,  川原 弘三
Applicant, Patent owner： 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構 ,  株式会社 ワールドフュージョン
Agent (4)： 三好 秀和 ,  高橋 俊一 ,  伊藤 正和 ,  高松 俊雄
Gazette classification：特許公報
Application number (International application number)：2016224126
Publication number (International publication number)：2017097873
Patent number：6624736
Application date： Nov. 17, 2016
Publication date： Jun. 01, 2017
Claim (excerpt)：

【請求項1】 参照用インフルエンザウイルスデータが入力されるリファレンスデータ入力部と、 前記リファレンスデータ入力部に入力された参照用インフルエンザウイルスデータの塩基配列を複数の分節に分類して分節毎にリファレンス配列を集積する分節分割部と、 検体の塩基配列が入力される検体データ入力部と、 前記分節毎に集積されたリファレンス配列に前記検体の塩基配列をマッピングするマッ ピング処理部と、 前記マッピング処理部によるマッピング結果からリファレンス配列の塩基長に対するマ ッピング済領域の塩基長の割合であるカバー率を算出するカバー率算出部と、 前記算出されたカバー率の最大の値又は上位3位までの高カバー率を有するリファレンス配列のマッピング結果に基づいて変異を反映したコンセンサス配列を分節毎に作成するコンセンサス配列作成部と、 分節毎に前記コンセンサス配列と前記集積されたリファレンス配列の相同性検索を実行し所定の類似度以上のリファレンス配列のうち最大の塩基長を有する1つの改定リファレンス配列を決定する相同性検索処理部とを備え、 前記マッピング処理部において改定リファレンス配列に前記検体の塩基配列をマッピングしてマッピング結果に基づいて変異を反映した改定コンセンサス配列を作成することを特徴とするインフルエンザウイルス解析装置。

IPC (4)：

G16H 50/80 ( 201 8.01) ,  G16B 30/10 ( 201 9.01) ,  C12N 15/09 ( 200 6.01) ,  C12Q 1/6869 ( 201 8.01)

FI (4)：

G16H 50/80 ,  G16B 30/10 ,  C12N 15/09 ZNA Z ,  C12Q 1/686 Z