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J-GLOBAL ID：201702246745196528   整理番号：17A0530198

雲南省における の5つの種の18S RDNA遺伝子の配列解析と系統発生を研究した。【JST・京大機械翻訳】

Sequencing and Phylogenetic Tree Construction of 18S Ribosomal DNA from Five Species of Plasmodium from Yunnan Border between China and Myanmar and Other Areas

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著者 (9件)： Chen Muxin (fu dan university...) ,  Chen Jiaxu (National Institute of Parasitic Diseases, Chinese Center for Disease Control and Prevention; WHO Collaborating Centre for Tropical Diseases; National Center for International Research on Tropical Diseases, Ministry of Science and Technology; Key Laboratory...) ,  Liu Wei (National Institute of Parasitic Diseases, Chinese Center for Disease Control and Prevention; WHO Collaborating Centre for Tropical Diseases; National Center for International Research on Tropical Diseases, Ministry of Science and Technology; Key Laboratory...) ,  Feng Xinyu (National Institute of Parasitic Diseases, Chinese Center for Disease Control and Prevention; WHO Collaborating Centre for Tropical Diseases; National Center for International Research on Tropical Diseases, Ministry of Science and Technology; Key Laboratory...) ,  Chen Shenbo (fu dan university...) ,  Chen Shaohong (National Institute of Parasitic Diseases, Chinese Center for Disease Control and Prevention; WHO Collaborating Centre for Tropical Diseases; National Center for International Research on Tropical Diseases, Ministry of Science and Technology; Key Laboratory...) ,  Cai Yuchun (fu dan university...) ,  Xu Bin (National Institute of Parasitic Diseases, Chinese Center for Disease Control and Prevention; WHO Collaborating Centre for Tropical Diseases; National Center for International Research on Tropical Diseases, Ministry of Science and Technology; Key Laboratory...) ,  Hu Wei (fu dan university...)
資料名： Zhongguo Jishengchongxue yu Jishengchongbing Zazhi  (Zhongguo Jishengchongxue yu Jishengchongbing Zazhi)
巻： 34  号： 6  ページ： 493-499  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2242A  ISSN： 1000-7423  CODEN： ZJYZET  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 【目的】中国雲南省における5つのマラリア原虫の18SrDNA遺伝子の遺伝的差異と系統発生を分析する。【方法】20年から2015年までの中国の雲南省からのマラリア患者の血液サンプル(またはマラリア原虫DNA)を収集し,血液サンプル中のマラリア原虫DNAを抽出し,それらの18SrDNA遺伝子を増幅し,配列決定した。GenBankにおけるマラリア原虫の対応する配列と比較した。隣接法(neighborimpjoing,,NJ),最尤法(maximumvulglikelihood,QM/ML)と最大簡約法(maximumvulgparsimony,blaMP)を用いて系統樹を構築した。結果:94例のマラリア患者の血液サンプル或いはDNAを収集し、すべてのサンプルにおいて18SrDNA遺伝子の配列を増幅した。配列比較分析は,以下を示した。マラリア原虫(Plasmodiumfalciparum,日間マラリア原虫(P.falvivax),三日マラリア原虫(P.malariae),卵形マラリア原虫(P.falovale),およびノシジウム原虫(P.aureknowlesi)の種内差異はそれぞれ0~0.2%,0~0.1%であった。0~0.1%,0。系統発生関係の分析により、NJ、MPとML法で構築した系統樹のトポロジー構造はほぼ一致していることが示された。本研究のマラリア原虫は5つの大きな分枝を形成する。悪性マラリア原虫は一つの分枝を形成し、GenBankにおけるカムロン(KC428741、KC428742)、ブラジル(KC906718)とマレーシア(HQ283221)の分離株と集まっている。それらの間で,大部分のサンプルは,Maxiong(HF945443),インド(HM014361,JQ627158)およびコロンビア(U83877)から分離された。小部分のサンプル(Pv11、Pv18とPv21)はより小さい分枝を形成した後に、カニクイザル(P.falcynomolgi)(L07559)と結合し、小さい分枝を形成した。三日マラリア原虫は一つの分枝を形成し、雲南からの三日マラリア原虫Pm1、Pm3とPm4は一つの小分枝内に集まり、日本由来の分離株(AB250682)と集まり、海南由来の分離株Pm5と相次いで、地域差異性を示した。卵形マラリア原虫は一つの分枝を形成し、ベトナム由来の分離株(EU935736、AF387038)と一緒に集まる。ノリマラリア原虫は一つの分岐を形成し,ミャンマー由来の分離株(GU816250,GU816246)と一緒に集まっている。【結論】中国の雲南省における5つのマラリア原虫の18SrDNA遺伝子には,明らかな種内差異が全くなかった。系統発生関係の分析により、NJ、MPとML法で構築した系統樹のトポロジー構造はほぼ一致していることが示された。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ベトナム社会主義共和国 ,  系統樹 ,  *系統発生 ,  インド ,  ブラジル連邦共和国 ,  *DNA【核酸】 ,  原生動物 ,  マレーシア ,  マラリア ,  最尤法 ,  患者 ,  分離株 ,  遺伝子配列 ,  *雲南省 ,  プラスモジウム属 ,  微生物 ,  胞子虫類
準シソーラス用語： マラリア原虫 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Plasmodium spp. ,  18S rDNA ,  Sequence analysis ,  Phylogenetic construction

分類 (2件)： 微生物形態学・分類学  (EG03030Y) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (7件)： 雲南省 ,  種 ,  rDNA ,  遺伝子 ,  配列解析 ,  系統発生 ,  研究