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J-GLOBAL ID：201702246745196528   整理番号：17A0530198

雲南省における の5つの種の18S RDNA遺伝子の配列解析と系統発生を研究した。【JST・京大機械翻訳】

Sequencing and Phylogenetic Tree Construction of 18S Ribosomal DNA from Five Species of Plasmodium from Yunnan Border between China and Myanmar and Other Areas

著者 (9件)： Chen Muxin (fu dan university...) ,  Chen Jiaxu (National Institute of Parasitic Diseases, Chinese Center for Disease Control and Prevention; WHO Collaborating Centre for Tropical Diseases; National Center for International Research on Tropical Diseases, Ministry of Science and Technology; Key Laboratory...) ,  Liu Wei (National Institute of Parasitic Diseases, Chinese Center for Disease Control and Prevention; WHO Collaborating Centre for Tropical Diseases; National Center for International Research on Tropical Diseases, Ministry of Science and Technology; Key Laboratory...) ,  Feng Xinyu (National Institute of Parasitic Diseases, Chinese Center for Disease Control and Prevention; WHO Collaborating Centre for Tropical Diseases; National Center for International Research on Tropical Diseases, Ministry of Science and Technology; Key Laboratory...) ,  Chen Shenbo (fu dan university...) ,  Chen Shaohong (National Institute of Parasitic Diseases, Chinese Center for Disease Control and Prevention; WHO Collaborating Centre for Tropical Diseases; National Center for International Research on Tropical Diseases, Ministry of Science and Technology; Key Laboratory...) ,  Cai Yuchun (fu dan university...) ,  Xu Bin (National Institute of Parasitic Diseases, Chinese Center for Disease Control and Prevention; WHO Collaborating Centre for Tropical Diseases; National Center for International Research on Tropical Diseases, Ministry of Science and Technology; Key Laboratory...) ,  Hu Wei (fu dan university...)
資料名： Zhongguo Jishengchongxue yu Jishengchongbing Zazhi  (Zhongguo Jishengchongxue yu Jishengchongbing Zazhi)
巻： 34  号： 6  ページ： 493-499  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2242A  ISSN： 1000-7423  CODEN： ZJYZET  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 【目的】中国雲南省における5つのマラリア原虫の18SrDNA遺伝子の遺伝的差異と系統発生を分析する。【方法】20年から2015年までの中国の雲南省からのマラリア患者の血液サンプル(またはマラリア原虫DNA)を収集し,血液サンプル中のマラリア原虫DNAを抽出し,それらの18SrDNA遺伝子を増幅し,配列決定した。GenBankにおけるマラリア原虫の対応する配列と比較した。隣接法(neighborimpjoing,,NJ),最尤法(maximumvulglikelihood,QM/ML)と最大簡約法(maximumvulgparsimony,blaMP)を用いて系統樹を構築した。結果:94例のマラリア患者の血液サンプル或いはDNAを収集し、すべてのサンプルにおいて18SrDNA遺伝子の配列を増幅した。配列比較分析は,以下を示した。マラリア原虫(Plasmodiumfalciparum,日間マラリア原虫(P.falvivax),三日マラリア原虫(P.malariae),卵形マラリア原虫(P.falovale),およびノシジウム原虫(P.aureknowlesi)の種内差異はそれぞれ0~0.2%,0~0.1%であった。0~0.1%,0。系統発生関係の分析により、NJ、MPとML法で構築した系統樹のトポロジー構造はほぼ一致していることが示された。本研究のマラリア原虫は5つの大きな分枝を形成する。悪性マラリア原虫は一つの分枝を形成し、GenBankにおけるカムロン(KC428741、KC428742)、ブラジル(KC906718)とマレーシア(HQ283221)の分離株と集まっている。それらの間で,大部分のサンプルは,Maxiong(HF945443),インド(HM014361,JQ627158)およびコロンビア(U83877)から分離された。小部分のサンプル(Pv11、Pv18とPv21)はより小さい分枝を形成した後に、カニクイザル(P.falcynomolgi)(L07559)と結合し、小さい分枝を形成した。三日マラリア原虫は一つの分枝を形成し、雲南からの三日マラリア原虫Pm1、Pm3とPm4は一つの小分枝内に集まり、日本由来の分離株(AB250682)と集まり、海南由来の分離株Pm5と相次いで、地域差異性を示した。卵形マラリア原虫は一つの分枝を形成し、ベトナム由来の分離株(EU935736、AF387038)と一緒に集まる。ノリマラリア原虫は一つの分岐を形成し,ミャンマー由来の分離株(GU816250,GU816246)と一緒に集まっている。【結論】中国の雲南省における5つのマラリア原虫の18SrDNA遺伝子には,明らかな種内差異が全くなかった。系統発生関係の分析により、NJ、MPとML法で構築した系統樹のトポロジー構造はほぼ一致していることが示された。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ベトナム社会主義共和国 ,  系統樹 ,  *系統発生 ,  インド ,  ブラジル連邦共和国 ,  *DNA【核酸】 ,  原生動物 ,  マラリア原虫 ,  マレーシア ,  マラリア ,  最尤法 ,  患者
準シソーラス用語： 分離株 ,  遺伝子配列 ,  *雲南省 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Plasmodium spp. ,  18S rDNA ,  Sequence analysis ,  Phylogenetic construction

分類 (2件)： 微生物形態学・分類学  (EG03030Y) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (7件)： 雲南省 ,  種 ,  rDNA ,  遺伝子 ,  配列解析 ,  系統発生 ,  研究