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J-GLOBAL ID：201702291982272233   整理番号：17A0702208

エボラウイルスの抗インターフェロンシグナル伝達の全原子分子動力学研究:カリオフェリンα5へEBOV VP24結合の相互作用機構【Powered by NICT】

An all-atom molecular dynamics study of the anti-interferon signaling of Ebola virus: interaction mechanisms of EBOV VP24 binding to Karyopherin alpha5

著者 (6件)： Ding Jing-Na (National Synchrotron Radiation Laboratory, University of Science and Technology of China, Hefei 230029, People’s Republic of China. [e-mail]) ,  Zhang Yan-Jun ,  Zhong Hui ,  Ao Cheng-Cheng ,  Li Jing ,  Han Ju-Guang
資料名： Molecular BioSystems  (Molecular BioSystems)
巻： 13  号： 5  ページ： 1031-1045  発行年： 2017年 
JST資料番号： W2331A  ISSN： 1742-206X  CODEN： MBOIBW  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： エボラウイルス(EBOV)はウイルスのコードする免疫きっ抗薬により高度に致死的である,カリオフェリンα(KPNA)EBOV VP24の組み合わせは,抗インターフェロン(IFN)シグナル伝達を誘発するであろう。VP24KPNA5の結晶構造は最近の研究で提案されているが,正確な結合機構は不明である。VP24KPNA5蛋白質結合機構を調べるために,分子動力学(MD)シミュレーション及び分子力学一般化Born表面積(MM GB/SA)エネルギー計算を行った。得られた結果は,KPNA5に結合するEBOV VP24はそれらの結合面を堅くし,両蛋白質は結合中の圧縮であることを示した。WTと八変異体システムの結合自由エネルギーの解析によると,MUT3は相互作用する最も効果的な寄与をするMUT4,R398Aと二重変異体は二番目に効果的な影響を与えた。水素結合解析は水素結合D480T138,E483 R137とD205R396の形成を妨害する阻害剤はどのように抗IFN効果を防止することを示した。一方,結合自由エネルギー(DC)の分解を組み合わせた計算機的アラニン置換(CAS)の結果により,VP24残基R137とT138はEBOV VP24阻害剤の潜在的標的であるであろうことを示し,KPNA5残基R396,R398,R480,Y477とF484はVP24にKPNA5結合を防止するために潜在的標的,最終的に抗IFNシグナル伝達を阻害するであろう。VP24KPNA5の結合様式を理解するための理論的データを提供した。錯体の正確な結合機構はEBOV感染に対する潜在的な新規阻害剤の開発に光を当てるであろう。Copyright 2017 Royal Society of Chemistry All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST【Powered by NICT】

シソーラス用語： タンパク質 ,  分子内力学 ,  結晶構造 ,  *相互作用 ,  タンパク質結合 ,  *インターフェロン ,  エネルギー計算 ,  *ウイルス ,  水素結合 ,  *分子動力学 ,  結合自由エネルギー ,  *カリオフェリン類 ,  *エボラウイルス ,  *微生物 ,  アミノ酸 ,  脂肪族アミン ,  脂肪族カルボン酸 ,  第一アミン
準シソーラス用語： 阻害剤 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  分子構造  (EB03020Y)

物質索引 (1件)： アラニン

タイトルに関連する用語 (8件)： エボラウイルス ,  インターフェロン ,  シグナル伝達 ,  原子分子 ,  動力学 ,  研究 ,  カリオフェリン ,  相互作用