文献

J-GLOBAL ID：201702257705489365   整理番号：17A0278666

ヘテロコンピューティングプラットフォーム上での加速されたBWA MEM実現の電力効率解析【Powered by NICT】

Power-efficiency analysis of accelerated BWA-MEM implementations on heterogeneous computing platforms

著者 (5件)： Houtgast Ernst Joachim (Computer Engineering Lab, Delft University of Technology, Mekelweg 4, 2628 CD Delft, The Netherlands) ,  Sima Vlad-Mihai (Bluebee, Laan van Zuid-Hoorn 57, 2289 DC Rijswijk, The Netherlands) ,  Marchiori Giacomo (Bluebee, Laan van Zuid-Hoorn 57, 2289 DC Rijswijk, The Netherlands) ,  Bertels Koen (Computer Engineering Lab, Delft University of Technology, Mekelweg 4, 2628 CD Delft, The Netherlands) ,  Al-Ars Zaid (Computer Engineering Lab, Delft University of Technology, Mekelweg 4, 2628 CD Delft, The Netherlands)
資料名： IEEE Conference Proceedings  (IEEE Conference Proceedings)
巻： 2016  号： ReConFig  ページ： 1-8  発行年： 2016年 
JST資料番号： W2441A  資料種別： 会議録 (C)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 次世代配列決定技術は,逐次遺伝的材料のコスト,大量配列決定のデータを劇的に減少させた。このデータの処理は巨大な挑戦,性能の観点から,電力効率の観点からの両方をもたらす。不均一計算は両先端に,より高性能,より電力効率の良い解を可能にすることができる。本論文では,ゲノムデータマッピングのための一般的なツール,BWA MEMアルゴリズムの電力効率は,二つの異種アーキテクチャ上で研究した。アルファデータアドインカード上の単一Xilinx Virtex VII FPGAを用いたFPGAベース実装の性能と電力効率は,NVIDIA GeForce GTX970を用い,ソフトウェアベースラインシステムに対するGPUに基づく実装と比較した。加速器に及ぼす種子拡張相をオフロードすることにより,両実装はソフトウェア実装に比べて全体的なアプリケーションレベル性能の二倍の高速化を達成することができた。さらに,FPGAの高度にカスタマイズ可能な性質は,はるかに高い電力効率をもたらし,FPGAの消費電力は,GPUのそれの四分の1以下である。プラットフォームと工具不可知論的比較を容易にするために,ジュール単位当たりの塩基対は電力効率の尺度として導入した。ソフトウェアオンリーのベースラインと比較してFPGA設計であるジュール当たり44~千塩基対,電力効率の2.1倍の利得を位置づけることができた。Copyright 2017 The Institute of Electrical and Electronics Engineers, Inc. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST【Powered by NICT】

シソーラス用語： アルゴリズム ,  利得 ,  ソフトウェア ,  *性能分析 ,  計算機アーキテクチャ ,  高速化 ,  遺伝 ,  塩基対 ,  FPGA ,  カスタム化 ,  *電力効率 ,  基準線 ,  加速器 ,  *電力 ,  消費電力

分類 (1件)： 専用演算制御装置  (JC04030Y)

タイトルに関連する用語 (3件)： 加速 ,  電力効率 ,  解析