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J-GLOBAL ID：201702275649070751   整理番号：17A0323556

LSKLペプチド,LAP TGFベータ由来ペプチド,ADAMTS1の間の相互作用のin silico特性化【Powered by NICT】

In silico characterization of the interaction between LSKL peptide, a LAP-TGF-beta derived peptide, and ADAMTS1

著者 (5件)： Laurent Marie-Amandine (Universite Paris Diderot, Sorbonne Paris Cite, Molecules Therapeutiques in silico (MTi), Inserm UMR-S 973, 35 rue Helene Brion, 75013 Paris, France) ,  Bonnier Dominique (INSERM U1085, Institut de Recherche en Sante, Environnement et Travail (IRSET), Universite de Rennes 1, 2 avenue Pr Leon Bernard, Rennes, France) ,  Theret Nathalie (INSERM U1085, Institut de Recherche en Sante, Environnement et Travail (IRSET), Universite de Rennes 1, 2 avenue Pr Leon Bernard, Rennes, France) ,  Tuffery Pierre (Universite Paris Diderot, Sorbonne Paris Cite, Molecules Therapeutiques in silico (MTi), Inserm UMR-S 973, 35 rue Helene Brion, 75013 Paris, France) ,  Moroy Gautier (Universite Paris Diderot, Sorbonne Paris Cite, Molecules Therapeutiques in silico (MTi), Inserm UMR-S 973, 35 rue Helene Brion, 75013 Paris, France)
資料名： Computational Biology and Chemistry  (Computational Biology and Chemistry)
巻： 61  ページ： 155-161  発行年： 2016年 
JST資料番号： H0201B  ISSN： 1476-9271  CODEN： COCHDK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 細胞外マトリックスのリモデリングに関与するメタロプロテアーゼはサイトカインおよび成長因子の生物学的利用能を調節することにより細胞応答において重要な役割を果たす。最近,ディスインテグリンとメタロプロテアーゼ,ADAMTS1は形質転換成長因子TGF-β,線維症,及び癌における主要な因子を活性化できることが示されている。ADAMTS1からKTFR配列はTGF-βの潜在型からLSKLペプチドとの相互作用に関与し,その活性化をもたらした。相互作用サイトの原子的詳細は,効率的な阻害分子の合理的な設計の基礎となり得るが,相互作用の結合モードは完全に知られていない。本研究では,著者らはKTFR配列を含むヒトADAMTS1の組換断片はTGF-βの潜在型を結合する能力に保つことを示した。最良の親和性で組換フラグメントは原子レベルでのADAMTS1とLSKLペプチドの結合モードを調べるためにモデル化した。分子ドッキングと複数の独立した分子動力学(MD)シミュレーションを用いた組合せ法を用いて,著者らはADAMTS1とLSKLペプチドの結合様式を提供する。分子ドッキングによって予測された二つの最低エネルギーモデルから出発して,MDシミュレーションは3塩橋(K_3 NH_3~+E_626C00~-とL_4C00~-K_619 NH_3~+とE_624C00~ L_1 NH_3~+)と二つの水素結合(E_623C00~ とS.2OH;E_623C00~ L_4NH)により特徴付けられる安定な相互作用を示した。この相互作用機構の知識は,肝疾患におけるADAMTS1によるTGF-βの不適切な活性化に対してより強力かつより特異的阻害剤の設計への道を開くものである。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 細胞外マトリックス ,  モデリング ,  TGFβ ,  ヒト ,  バイオアベイラビリティ ,  *キャラクタリゼーション ,  *ペプチド ,  親和性 ,  分子動力学 ,  水素結合
準シソーラス用語： 阻害剤 ,  分子ドッキング ,  結合モード ,  細胞応答 ,  *ADAMTS1 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： ADAMTS1 ,  細胞外マトリックス ,  肝線維症 ,  分子動力学シミュレーション ,  TGF-βペプチド

分類 (4件)： 酵素一般  (EB09010D) ,  計算機シミュレーション  (JE11000H) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  分子構造  (EB03020Y)

タイトルに関連する用語 (6件)： ペプチド ,  LAP ,  TGFベータ ,  ADAMTS1 ,  相互作用 ,  特性化