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J-GLOBAL ID：201402217813204089   整理番号：14A0901437

大規模GPUクラスタによるタンパク質ドッキング計算システム

Protein-Protein Docking System on Large-Scale GPU Clusters

著者 (7件)： 大上雅史 (東京工大 大学院情報理工学研究科) ,  大上雅史 (日本学術振興会) ,  下田雄大 (東京工大 大学院情報理工学研究科) ,  松崎由理 (東京工大) ,  石田貴士 (東京工大 大学院情報理工学研究科) ,  秋山泰 (東京工大 大学院情報理工学研究科) ,  秋山泰 (東京工大)
資料名： 電子情報通信学会技術研究報告  (IEICE Technical Report (Institute of Electronics, Information and Communication Engineers))
巻： 114  号： 104(NC2014 1-16)  ページ： 173-176  発行年： 2014年06月18日 
JST資料番号： S0532B  ISSN： 0913-5685  資料種別： 会議録 (C)
記事区分： 原著論文  発行国： 日本 (JPN)  言語： 日本語 (JA)

抄録/ポイント： タンパク質ドッキング計算は通常2つのタンパク質の複合体構造を...

シソーラス用語： *ドッキング ,...
準シソーラス用語： *GPUクラスタ ,...

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分類 (1件)： 分子構造  (EB03020Y)

引用文献 (21件)：

• Stein, A. et al. (2011) Three-dimensional modeling of protein interactions and complexes is going ‘omics. Curr. Opin. Struct. Biol., 21, 200-208.
• Lensink, M.F., Wodak, S.J. (2013) Docking, scoring and affinity prediction in CAPRI. Proteins, 81, 2082-2095.
• Katchalski-Katzir, E., et al. (1992) Molecular surface recognition: determination of geometric fit between proteins and their ligands by correlation techniques. Proc. Natl. Acad. Sci., 89: 2195-2199.
• Gabb, H.A. et al. (1997) Modelling protein docking using shape complementarity, electrostatics and biochemical information. J. Mol. Biol., 272, 106-120.
• Chen, R. et al. (2003) ZDOCK: an initial-stage protein-docking algorithm. Proteins, 52, 80-87.

タイトルに関連する用語 (4件)： 大規模 ,  GPUクラスタ ,  タンパク質ドッキング ,  計算システム