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J-GLOBAL ID：202302280934703027   整理番号：23A1830682

「富岳」を利用した大規模なフラグメント分子軌道計算について

Large-scale fragment molecular orbital calculations on the supercomputer Fugaku

著者 (13件)： 望月祐志 (立教大 理) ,  望月祐志 (東大 生産技研) ,  坂倉耕太 (計算科学振興財団) ,  中野達也 (医薬品食品衛生研) ,  土居英男 (立教大 理) ,  奥脇弘次 (立教大 理) ,  秋澤和輝 (立教大 理) ,  北原駿 (立教大 理) ,  太刀野雄介 (立教大 理) ,  松岡壮太 (立教大 理) ,  小沢拓 (JSOL) ,  大島聡史 (九大 情報基盤研究開発セ) ,  片桐孝洋 (名古屋大 情報基盤セ)
資料名： 計算工学講演会論文集(CD-ROM)  (Proceedings of the Conference on Computational Engineering and Science (CD-ROM))
巻： 28  ページ： ROMBUNNO.C-03-01  発行年： 2023年05月31日 
JST資料番号： L2913B  ISSN： 1342-145X  資料種別： 会議録 (C)
記事区分： 原著論文  発行国： 日本 (JPN)  言語： 日本語 (JA)

抄録/ポイント： 超コンピュータ富岳では,ABINIT-MP(フラグメント分子軌道(FMO)計算のためのプログラムである)を改善し,感染性疾患に関連する蛋白質に関する相互作用解析を行い,メソスケール系の粗粒シミュレーションのパラメータを評価してきた。この文書は,富岳と種々の関連応用に関するABINIT-MPの現状を要約する。(翻訳著者抄録)

シソーラス用語： *スーパコンピュータ ,  *分子軌道計算 ,  感染症 ,  シミュレーション ,  中規模 ,  *プログラムパッケージ ,  動力学 ,  フラグメント
準シソーラス用語： *ABINIT ,  メゾスケール ,  感染性疾患 ,  散逸粒子動力学

分類 (1件)： 数値解析,近似法  (AB04000F)

引用文献 (32件)：

• ′′The Fragment Molecular Orbial Method: Practical Applications to Large Molecular Systems′′, ed. D.G. Fedorov and K. Kitaura, CRC Press (2009).
• ′′Recent Advances of the Fragment Molecular Orbital Method - Enhanced Performance and Applicability′′, ed. Y. Mochizuki, S. Tanaka and K. Fukuzawa, Springer (2021).
• S. Tanaka et al., ′′Electron-correlated fragment-molecular-orbital calculations for biomolecular and nano systems′′, Phys. Chem. Chem. Phys., 16 (2014) 10310-10344.
• Y. Mochizuki et al., ′′The ABINIT-MP Program′′ in Ref. [2], pp. 53-67.
• 望月祐志 他, ′′新型コロナウイルスのタンパク質に関するフラグメント分子軌道計算の事例′′, 計算工学, 26 (2021) 4204-4209.

タイトルに関連する用語 (3件)： 大規模 ,  フラグメント ,  分子軌道計算