研究者
J-GLOBAL ID:200901034194227400   更新日: 2024年11月07日

長田 直樹

オサダ ナオキ | Osada Naoki
所属機関・部署:
職名: 准教授
ホームページURL (1件): https://sites.google.com/view/nosada17/
研究分野 (4件): システムゲノム科学 ,  ゲノム生物学 ,  多様性生物学、分類学 ,  進化生物学
研究キーワード (17件): 遺伝子重複 ,  遺伝子発現調節 ,  再編 ,  カニクイザル ,  CXCL1L ,  ケモカイン ,  偽遺伝子 ,  ゲノム進化 ,  翻訳 ,  CXCL1 ,  グノム ,  種分化 ,  生態学 ,  霊長類 ,  進化 ,  遺伝学 ,  遺伝子交流
競争的資金等の研究課題 (14件):
  • 2023 - 2028 先史人類による人為的環境形成(動物相)に関する研究
  • 2023 - 2028 日本列島域における先史人類史の総合的復元方法の研究
  • 2022 - 2026 ヒトゲノム中に多型的に存在するウイルス様配列の大規模探索と集団ゲノム解析
  • 2023 - 2026 種内数千ゲノム比較によるピンポイント適応変異数千の検出
  • 2022 - 2025 血中exosome内circRNA発現解析による膵癌の診断・予後関連マーカー探索
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論文 (93件):
  • Zhenxin Fan, Rusong Zhang, Anbo Zhou, Jody Hey, Yang Song, Naoki Osada, Yuzuru Hamada, Bisong Yue, Jinchuan Xing, Jing Li. Genomic Evidence for the Complex Evolutionary History of Macaques (Genus Macaca). Journal of Molecular Evolution. 2024. 92. 286-299
  • Kazumichi Fujiwara, Shunpei Kubo, Toshinori Endo, Toyoyuki Takada, Toshihiko Shiroishi, Hitoshi Suzuki, Naoki Osada. Inference of selective forces on house mouse genomes during secondary contact in East Asia. Genome Research. 2024. 34. 366-375
  • Sangeetha Ratnayake, Axel Martinelli, Toshinori Endo, Naoki Osada. Exploring The Interplay Between Scoring Functions and Physico-chemical Properties in Antibody-antigen Docking. IPSJ Transactions on Bioinformatics. 2024. 17. 10-17
  • Satoshi D. Ohdachi, Kazumichi Fujiwara, Chandra Shekhar, Nguyn Trưng Sơn, Hitoshi Suzuki, Naoki Osada. Phylogenetics and Population Genetics of the Asian House Shrew, Suncus murinus-S. montanus Species Complex, Inferred From Whole-Genome and Mitochondrial DNA Sequences, with Special Reference to the Ryukyu Archipelago, Japan. Zoological Science. 2024. 41. 2
  • Sangeetha Ratnayake, Axel Martinelli, Toshinori Endo, Naoki Osada. Advancing Antibody-antigen Interface Analysis in Docking Scoring Functions for Precision Docking Analysis. IPSJ Transactions on Bioinformatics. 2024. 17. 40-47
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MISC (62件):
  • 藤原一道, 長田直樹. 東アジアのハツカネズミにおける亜種間交雑によるゲノム進化. 実験医学. 2024. 42. 2549-2552
  • 細川竜聡, 里村和浩, 長田直樹, 遠藤俊徳. De novo Gene Birth:ゲノムの非コード領域から新たに誕生する遺伝子. 日本遺伝学会大会プログラム・予稿集. 2023. 95th (CD-ROM)
  • 長田直樹. ソフトウェア紹介13:SLiM-前向きシミュレーターについて. Yaponesian. 2022. 4. はる. 12-13
  • 細川竜聡, 里村和浩, 長田直樹, 遠藤俊徳. オミックスデータを用いたde novo gene birthメカニズムの探索. 日本遺伝学会大会プログラム・予稿集. 2022. 94th (CD-ROM)
  • 長田 直樹. 最先端医療の今 ヤポネシア人の人口・歴史推定. Medical Science Digest. 2021. 47. 9. 476-478
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書籍 (9件):
  • Human Impacts on the Evolution of Rats and Mice in East Asia
    Springer Nature 2024 ISBN:9789819768875
  • Phylogeographic History of Plants and Animals Coexisting with Humans in Asia
    Springer Nature 2024 ISBN:9789819768875
  • 霊長類学の百科事典 = The encyclopedia of primatology
    丸善出版 2023 ISBN:9784621308042
  • 遺伝学の百科事典 : 継承と多様性の源
    丸善出版 2022 ISBN:9784621306604
  • 進化で読み解く バイオインフォマティクス入門
    森北出版 2019 ISBN:4627261411
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講演・口頭発表等 (125件):
  • 次世代シークエンサーを用いたゲノム多様性解析の概要
    (第26回日本進化学会神奈川大会 2024)
  • Inference of population history and selective force on house mouse genomes during secondary contact in East Asia
    (SMBE Regional Meeting in Taiwan 2024)
  • ゲノムデータのQC,マッピング,バリアントコール,フィルタリング
    (第一回統合生物考古学セミナー 2023)
  • 東アジアにおいて野生ハツカネズミが辿った歴史と進化
    (第33回モロシヌス研究会 2023)
  • ほぼ中立説と弱有害変異について-霊長類・げっ歯類ゲノム研究の視点から
    (日本遺伝学会第95回大会 2023)
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学歴 (2件):
  • 1997 - 2002 東京大学大学院 理学系研究科 生物科学専攻
  • 1993 - 1997 東京大学 理学部 生物学科
学位 (1件):
  • 博士(理学) (東京大学)
経歴 (13件):
  • 2023/04 - 現在 札幌医科大学, 非常勤講師
  • 2019/04 - 現在 北海道大学 大学院情報科学研究院 准教授
  • 2024/04 - 名古屋大学, 大学院生命農学研究科, 非常勤講師
  • 2017/09 - 2021/03 北海道大学 国際連携研究教育局 准教授
  • 2012/05 - 2020/03 放射線医科学総合研究所 客員研究員
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委員歴 (20件):
  • 2022/07 - 2026/06 日本進化学会 代議員
  • 2023/04 - 2024/03 日本遺伝学会 評議員
  • 2021/04 - 2022/03 日本学術振興会 科学研究費委員会委員・挑戦的研究部会委員・挑戦的研究部会第45小委員会委員(幹事)
  • 2020/01 - 2020/12 文部科学省 科研費専門委員会委員
  • 2019/01 - 2020/12 日本遺伝学会 評議員
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受賞 (3件):
  • 2019/07 - 日本学術振興会 特別研究員等審査会専門委員(書面担当)の表彰
  • 2014/09 - 日本遺伝学会 日本遺伝学会奨励賞 ゲノム情報と進化理論の統合による進化機構の解明
  • 2007/10 - 日本遺伝学会 ベストペーパー賞 On the correlation between gene expression pattern and selection intensity in the human genome
所属学会 (7件):
生き物文化誌学会 ,  日本バイオインフォマティクス学会 ,  日本人類学会 ,  日本分子生物学会 ,  日本霊長類学会 ,  日本進化学会 ,  日本遺伝学会
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