- 2023 - 2026 代謝経路を内在する人工小器官の創製と機能発現原理の確立
- 2023 - 2025 光合成による二酸化炭素固定化鍵酵素の基質を拡張した分子コンビナートの構築
- 2017 - 2021 人工代謝経路を内包するナノ空間「複合触媒コンパートメント」の創出
- 2018 - 2021 細胞内環境測定多元同時センサーの開発
- 2015 - 2020 グリーンイノベーションに資する高効率スマートマテリアルの創製研究 -アンダーワンルーフ型拠点連携による研究機能と人材育成の強化-
- 2017 - 2019 トリプレットリピート病の鍵を握るRNA凝集体の直接観察と検出法の開発
- 2017 - 2019 活性酸素種による翻訳後修飾を検出する蛍光バイオセンサー
- 2013 - 2018 革新的高効率太陽光利用技術の開発 -ゼロエミッション文明への変革を加速する-
- 2015 - 2017 活性酸素種による翻訳後修飾を検出する蛍光バイオセンサー
- 2013 - 2017 タンパク質単分子配置による分子コンビナート構築原理の確立
- 2013 - 2015 非天然型活性中心を導入したRNA-ペプチド複合体による協同的触媒機能の発現
- 2012 - 2014 単一細胞内での複数のセカンドメッセンジャー動態リアルタイム計測
- 2008 - 2013 高機能RNPナノデバイスの開発
- 2010 - 2012 クロスリンク反応性を内在する機能性生体高分子によるケミカルバイオロジーの開拓
- 2011 - 2012 タウタンパク質によるアミロイド繊維形成を支配するアミノ酸リン酸化コードの探求
- 2008 - 2012 生体分子情報-構造-機能統合ナノシステムの構築:高機能RNPナノデバイスの開発
- 2010 - 2011 単一細胞内セカンドメッセンジャー代謝動態のリアルタイム計測
- 2008 - 2011 モジュール設計による機能性RNA-タンパク質複合体創製原理の確立
- 2008 - 2010 被修飾タウ分子の病理的視点からの分子構造論:繊維性凝集と環境相互作用を中心に
- 2007 - 2008 三次元構造をもとにしたミニチュアメタン酸化酵素の創製
- 2007 - 2008 生体内シグナル伝達分子を標的とした蛍光バイオセンサーの創製
- 2005 - 2007 機能性リボヌクレオペプチドによる生体内情報伝達シグナルの検出と制御
- 2006 - 2006 生体内生理活性分子の迅速な定量にむけた蛍光センシングチップの開発
- 2005 - 2006 機能性ミニチュアRNAタンパク質複合体の構築
- 2004 - 2005 化学反応で動くRNA-ペプチド複合体の創製
- 2003 - 2004 テーラーメイドバイオセンサーとバイオチップ素子のコンビナトリアル創製
- 2003 - 2003 機能性ミニチュアRNAタンパク質複合体の構築
- 2002 - 2003 D-アミノ酸からなる機能性スモールプロテインのコンビナトリアル創製
- 2000 - 2003 複数のサブユニットから成るテーラーメイド人工酵素の創製
- 2002 - 2002 機能性ミニチュアRNAタンパク質複合体の構築
- 2000 - 2002 腫瘍学的一酸化窒素生体内動態の化学的解明
- 2000 - 2001 生体内シグナル応答性高選択的DNA結合スモールプロティンの創製
- 1999 - 機能性RNAタンパク質組織体の設計
- 1999 - 生体内分子センサー
- 1997 - 1998 協同的結合と選択的化学反応の複合によるDNA塩基配列の精密認識
- 1996 - 1996 協同性発現によるDNA塩基配列認識能鋭敏化の分子機構
- 1996 - 1996 非共有結合により四次構造を形成する人工DNA結合タンパク質の構築とその機能解析
- 1995 - 1996 非共有結合により四次構造を形成する人工DNA結合タンパク質の構築とその機能解析
- 1995 - 1995 化学反応場としてのペプチドループ構造の設計とその機能解析
- 1994 - 1995 非共有結合により四次構造を形成する人工DNA結合タンパク質の構築とその機能解析
- 1995 - 機能性人工タンパク質の設計
- 1994 - 1994 安定なβ-シート構造形成能を有する機能性ペプチドの構築
- 1992 - タンパク質によるDNA認識
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