木下賢吾

Kinoshita Kengo

所属機関・部署：
職名：教授
その他の所属（所属・部署名・職名） (1件)：

東北メディカル・メガバンク機構副機構長

ホームページURL (1件)： http://www.sb.ecei.tohoku.ac.jp

研究分野 (3件)：生物物理学 , システムゲノム科学 , ゲノム生物学

研究キーワード (30件)：蛋白質会合表面 , 非線型振動 , 組織特異的プロモーター , 原子占有率 , ホモ二量体 , ゲノム配列解析 , タンパク質立体構造 , 機能部位予測 , 会合表面間平均距離 , 振動緩和 , 結晶水 , 膜分子輸送複合体 , タンパク質 , ドッキング計算 , カタユウレイボヤ , プロテオーム , 立体構造-機能相関 , ミオグロビン , 会合空間体積 , クリスタルパッキング , 構造機能相関 , タンパク質間相互作用 , リガンド結合部位 , 静電ポテンシャル , 分子表面 , 分子シミュレーション , 立体構造 , データベース , バイオインフォマティクス , 蛋白質

競争的資金等の研究課題 (21件)：

2023 - 2026 生活習慣病・脳の老化の遺伝的背景に関する、大規模データベースを用いた国際共同研究
2022 - 2026 患者由来組織・オルガノイド培養細胞解析による膵胆道癌の治療抵抗機序の解明
2021 - 2024 クライオ電顕を用いたNaチャネルの構造解析による鎮痛特異的な局所麻酔薬の開発
2016 - 2019 レアバリアントの遺伝子発現量に及ぼす影響の俯瞰的解析
2016 - 2019 微小粒子状化学物質に対する生体応答分子機構の解明

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論文 (237件)：

Tomohisa Suzuki, Kota Ninomiya, Takamitsu Funayama, Yasunobu Okamura, Shu Tadaka, Kengo Kinoshita, Masayuki Yamamoto, Shigeo Kure, Atsuo Kikuchi, Gen Tamiya, et al. Next-generation sequencing analysis with a population-specific human reference genome. Genes & genetic systems. 2024
Shuki Yamazaki, Eiji Hishinuma, Yuma Suzuki, Akiko Ueda, Caroline Kijogi, Tomoki Nakayoshi, Akifumi Oda, Sakae Saito, Shu Tadaka, Kengo Kinoshita, et al. Functional significance of CYP2B6 gene rare allelic variants identified in Japanese individuals. Biochemical Pharmacology. 2024. 116515-116515
Miyuki Sakurai, Ikuko N Motoike, Eiji Hishinuma, Yuichi Aoki, Shu Tadaka, Mana Kogure, Masatsugu Orui, Mami Ishikuro, Taku Obara, Naoki Nakaya, et al. Identifying critical age and gender-based metabolomic shifts in a Japanese population of the Tohoku Medical Megabank cohort. Scientific reports. 2024. 14. 1. 15681-15681
Masato Takase, Naoki Nakaya, Tomohiro Nakamura, Mana Kogure, Rieko Hatanaka, Kumi Nakaya, Ippei Chiba, Ikumi Kanno, Kotaro Nochioka, Naho Tsuchiya, et al. Genetic Risk, Healthy Lifestyle Adherence, and Risk of Developing Diabetes in the Japanese Population. Journal of atherosclerosis and thrombosis. 2024
Hiroki Sekine, Haruna Takeda, Norihiko Takeda, Akihiro Kishino, Hayato Anzawa, Takayuki Isagawa, Nao Ohta, Shohei Murakami, Hideya Iwaki, Nobufumi Kato, et al. PNPO-PLP axis senses prolonged hypoxia in macrophages by regulating lysosomal activity. Nature Metabolism. 2024

MISC (59件)：

菱沼英史, 菱沼英史, 島田宗昭, 島田宗昭, 島田宗昭, 松川直美, 萩原達也, 工藤敬, 渋谷祐介, 重田昌吾, et al. 血漿メタボローム解析を用いた婦人科癌におけるバイオマーカーの探索. 日本婦人科腫瘍学会学術講演会プログラム・抄録集(Web). 2024. 66th
美辺詩織, 小巻翔平, 大桃秀樹, 高嶋聰, 小野加奈子, 山崎弥生, 須藤洋一, 田高周, 水野聖士, 石黒真美, et al. 出生三世代コホートにおける7人家族のエピゲノム研究基盤構築. 日本抗加齢医学会総会プログラム・抄録集. 2023. 23回. 252-252
山崎柊紀, 菱沼英史, 菱沼英史, 上田昭子, 前川正充, 前川正充, 前川正充, 佐藤裕, 公文代將希, 眞野成康, et al. 日本人8,380人の全ゲノム解析から同定されたCYP2B6レアバリアントの酵素機能変化解析. 日本薬学会年会要旨集(Web). 2023. 143rd
菱沼英史, 菱沼英史, 小渕開, 寺内健人, 上田昭子, 田高周, 齋藤さかえ, 前川正充, 木下賢吾, 平澤典保, et al. 大規模ゲノム解析データを活用した日本人DPD活性予測パネルの構築. 日本薬学会東北支部大会講演要旨集. 2023. 62nd
岩上将夫, 後藤温, 鈴木詩織, 片桐諒子, 羽入田明子, 山地太樹, 澤田典絵, 中杤昌弘, 若井建志, 須藤洋一, et al. メンデルのランダム化法による血中脂質と大腸がんの関係の検討. Journal of Epidemiology. 2022. 32. Suppl.1. 155-155

書籍 (6件)：

創薬研究のための相互作用解析パーフェクト : 低中分子・抗体創薬におけるスクリーニング戦略と実例、in silico解析、一歩進んだ分析技術まで
羊土社 2021 ISBN:9784758122566
実験医学増刊 Vol.39 No.7 日本人の疾患と健康のためのバイオバンクとデータベース活用法〜試料と情報の的確な探し方と使い方
羊土社 2021 ISBN:4758103941
バリアントデータ検索&活用 : 変異・多型情報を使いこなす達人レシピ
羊土社 2020 ISBN:9784758122450
プレシジョン・メディシン〜ビッグデータの構築・分析から臨床応用・課題まで〜
エヌ・ティー・エス 2018
実験医学増刊 Vol.35 No.17
2017

講演・口頭発表等 (108件)：

jMorp: Japanese Multi Omics Reference Panel
(トーゴーの日2022 2022)
一般住民バイオバンクの全ゲノム情報を活用したCYP2B6遺伝子多型バリアントの網羅的機能変化解析
(第42回日本臨床薬理学会学術総会)
東北メディカル・メガバンク計画におけるデータセキュリティと利活用促進での取り組み
(第34回日本内視鏡外科学会総会 2021)
SLC26A9トランスポーターの分子動力学シミュレーションが明らかにした、塩化物イオン輸送経路のゲート開閉運動における細胞質ドメインの役割
(第59回日本生物物理学会年会 2021)
Comparative Scoring Power;Assessments of Protein-Liga;Docking Scoring Functions by Considering;Protein Functional Groups
(第59回日本生物物理学会年会 2021)

学位 (1件)：

博士(理学) (京都大学)

経歴 (11件)：

2019/04 - 現在東北大学未高等研究機構来型医療創生センター(併任) 副センター長
2016/04 - 現在東北大学東北メディカル・メガバンク機構(併任) 副機構長
2012/04 - 現在東北大学東北メディカル・メガバンク機構ゲノム解析部門(併任) 教授
2009/10 - 現在東北大学大学院情報科学研究科教授
2007/04 - 2009/09 東京大学医科学研究所附属ヒトゲノム解析センター准教授(職名変更)

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受賞 (2件)：

2022/04 - 文部科学省令和4年度科学技術分野の文部科学大臣表彰科学技術賞研究部門未来型医療実現を目指したゲノム情報基盤構築に関する研究
2012/02 - 日本学術振興会日本学術振興会賞情報科学的アプローチによる機能未知遺伝子の機能予測法の開発

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