研究者
J-GLOBAL ID：201201022778107365   更新日: 2024年09月25日

清家 泰介

セイケ タイスケ | Seike Taisuke
所属機関・部署：
大阪大学 大学院情報科学研究科 バイオ情報計測学講座

大阪大学 大学院情報科学研究科 バイオ情報計測学講座 について


職名： 助教
その他の所属（所属・部署名・職名） (4件)：
  • 大阪大学  先導的学際研究機構 産業バイオイニシアティブ研究部門   兼任教員
  • 理化学研究所  生命機能科学研究センター 多階層生命動態研究チーム   客員研究員
  • 国立遺伝学研究所  遺伝形質研究系 微生物機能研究室   外来研究員
  • 国立研究開発法人  科学技術振興機構 (JST)   さきがけ研究者
ホームページURL (1件)： http://www-symbio.ist.osaka-u.ac.jp/index.html
研究分野 (5件)： 応用微生物学 ,  ゲノム生物学 ,  多様性生物学、分類学 ,  進化生物学 ,  遺伝学
研究キーワード (16件)： 酵母 ,  フェロモン ,  有性生殖 ,  種分化 ,  生態 ,  生物多様性 ,  生殖隔離 ,  実験室進化 ,  細胞極性 ,  ショウジョウバエ ,  ゲノム解析 ,  次世代シーケンサー ,  代謝 ,  微生物育種 ,  メタボローム ,  プロテオーム
競争的資金等の研究課題 (21件)：
  • 2024 - 2028 酵母のフェロモン認識の二面性と環境適応メカニズムの解明
  • 2023 - 2028 バイオマスからの多彩のプロダクトを生産する微生物の再探索と機能開発
  • 2023 - 2026 果実ハエに捕食される酵母を用いた適応進化モデルシステムの構築
  • 2022 - 2026 データ駆動型アンサンブル学習による出芽酵母中心代謝シミュレーターの構築
  • 2024 - 2025 分裂酵母Schizosaccharomyces japonicusにおける交配型特異的な遺伝子の同定と解析
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論文 (22件)：
  • Matsuyama C, Seike T, Okahashi N, Niide T, Hara KY, Hirono-Hara Y, Ishii J, Shimizu H, Toya Y, Matsuda F. Metabolome analysis of metabolic burden in Escherichia coli caused by overexpression of green fluorescent protein and delta-rhodopsin. J Biosci Bioeng. 2024. 137. 3. 187-194
  • Seike T, Takekata H, Sakata N, Furusawa C, Matsuda F. Yamadazyma thunbergiae sp. nov., a novel yeast species associated with Bengal clock vines and soil in Okinawa, Japan. Int J Syst Evol Microbiol. 2024. in press
  • Sugimura M, Seike T, Okahashi N, Izumi Y, Bamba T, Ishii J, Matsuda F. Improved 2,3-butanediol production rate of metabolically engineered Saccharomyces cerevisiae by deletion of RIM15 and activation of pyruvate consumption pathway. Int J Mol Sci. 2023. 24. 22. 16378-16378
  • Yatabe F, Seike T, Okahashi N, Ishii J, Matsuda F. Improvement of ethanol and 2,3-butanediol production in Saccharomyces cerevisiae by ATP wasting. Microb Cell Fact. 2023. 22. 1. 204
  • Seike T, Takekata H, Uchida Y, Sakata N, Furusawa C, Matsuda F. Wickerhamiella bidentis sp. nov., a novel yeast species isolated from flowers and insects in Japan. Int J Syst Evol Microbiol. 2023. 73. 3. 005739
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MISC (59件)：
  • 松田 史生, 岩倉 崇文, 清家 泰介, 馬越 泰. ナノLC-トリプル四重極質量分析計を用いた中心代謝酵素のターゲットプロテオミクス. 島津アプリケーションノート. 2023. 88
  • 清家 泰介, 渡辺 大輔. 酵母という生き物~生態学的ふるまいとその多様性の理解に向けて~ 特集によせて. 生物工学会誌. 2023. 101. 10. 520
  • 清家 泰介. ショウジョウバエ体内における酵母の多様性と生態. 生物工学会誌. 2023. 101. 10. 521-523
  • 岩倉崇文, 清家泰介, 岡橋伸幸, 佐藤里佳子, 高久洋暁, 松田史生. ナノLC-MS/MSを用いたターゲットプロテオミクスのLipomyces starkeyiへの適用. 質量分析総合討論会講演要旨集. 2023. 71st
  • 仲矢颯太, 清家泰介, 岡橋伸幸, 松田史生. 小スケール培養系に基づくハイスループット13C代謝フラックス解析法の構築. 日本生物工学会大会講演要旨集. 2023. 75th
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特許 (2件)：
講演・口頭発表等 (21件)：
  • 複数の研究機関での経験を通じて学んだこと
    (第76回日本生物工学会大会 2024)
  • 酵母の有性生殖の進化と自然界に見られる多様性
    (サントリーワールドリサーチセンター 2024)
  • 酵母の性分化:交配相手を見つける仕組み
    (学変B性染色体サイクル 2024)
  • ショウジョウバエからの酵母の単離と有用酵母の探索
    (微生物CS G2第20回定例会 2023)
  • ショウジョウバエ体内における酵母の多様性と生態
    (第75回日本生物工学会大会 2023)
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学歴 (2件)：
  • 2009 - 2014 大阪市立大学 大学院理学研究科 生物地球系専攻
  • 2005 - 2009 大阪市立大学 理学部 生物学科
学位 (1件)：
  • 博士(理学) (大阪市立大学)
経歴 (11件)：
  • 2024/10 - 現在 国立研究開発法人科学技術振興機構 (JST) さきがけ研究者
  • 2024/09 - 現在 国立遺伝学研究所 遺伝形質研究系 外来研究員
  • 2021/04 - 現在 大阪大学 先導的学際研究機構 産業バイオイニシアティブ研究部門 兼任教員
  • 2020/09 - 現在 理化学研究所 生命機能科学研究センター 客員研究員
  • 2020/09 - 現在 大阪大学 大学院情報科学研究科 助教
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委員歴 (10件)：
  • 2025/01 - 現在 日本生物工学会 バイオミディア編集委員
  • 2023/04 - 現在 酵母研究会 庶務幹事
  • 2018/10 - 2023/03 酵母研究若手の会 運営委員長
  • 2022/10 - 2022/10 酵母研究若手の会第八回研究会 実行委員
  • 2022/09 - 2022/09 酵母遺伝学フォーラム第55回研究報告会 実行委員
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受賞 (7件)：
  • 2022/09 - 酵母遺伝学フォーラム第55回研究報告会 会長賞
  • 2019/05 - 理化学研究所 松本理事長感謝状
  • 2019/03 - 第13回日本ゲノム微生物学会年会 優秀ポスター賞
  • 2018/11 - 酵母細胞研究会 平成29年度地神芳文記念研究助成賞
  • 2018/03 - 第12回日本ゲノム微生物学会年会 若手賞
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所属学会 (4件)：
日本微生物生態学会 ,  日本生物工学会 ,  日本ゲノム微生物学会 ,  酵母遺伝学フォーラム
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