研究者
J-GLOBAL ID:201201044016566501
更新日: 2025年01月29日 荻島 創一
オギシマ ソウイチ | Ogishima Soichi
所属機関・部署: 職名:
教授
その他の所属(所属・部署名・職名) (5件): ホームページURL (1件): http://www.igm.megabank.tohoku.ac.jp/ 研究分野 (3件):
システムゲノム科学
, ゲノム生物学
, 生命、健康、医療情報学
研究キーワード (4件):
医療情報学
, システム生物学
, トランスレーショナル・バイオインフォマティクス
, バイオインフォマティクス
競争的資金等の研究課題 (19件): - 2021 - 2024 多因子疾患の環境曝露の発症機序への影響の深層学習によるシステム的解明
- 2018 - 2023 ゲノム医療実現推進のためのバイオバンク利活用促進に向けたバイオバンク・ネットワーク構築 と運用支援に関する研究開発
- 2019 - 2022 中央集約型と分散型の併用による医療情報共有のためのトラスト(信頼関係)の評価法
- 2018 - 2021 日本人のゲノム・健康・診療情報と公共知識ベースのセマンティック統合システムの開発
- 2016 - 2019 アルツハイマー病の疾患アトラクター・遺伝子調節ネットワーク解析による生命情報解析
- 2015 - 2019 研究におけるゲノム解析情報を医療等に活かすための課題の検討
- 2016 - 2019 アルツハイマー病の疾患アトラクター・遺伝子調節ネットワーク解析による生命情報解析
- 2014 - 2017 階層的オミックス医療情報のデータ交換形式と多軸的・多面的なオントロジーの整備
- 2016 - 2017 ゲノムデータの持つ個人識別性に関する研究
- 2013 - 2016 遺伝子-遺伝子発現-環境相互作用によるポテンシャルにおける癌アトラクターの解析
- 2015 - 2016 患者団体等が主体的に運用する疾患横断的な患者レジストリのデータの収集・分析による難病患者のQOL向上及び政策支援のためのQOL評価基準の策定および基礎的知見の収集
- 2012 - 2015 長寿遺伝子による骨代謝制御機構の解明
- 2014 - 2015 患者団体等が主体的に運用する疾患横断的な患者レジストリのデータの収集・分析による難病患者のQOL向上及び政策支援のための基礎的知見の収集
- 2013 - 2015 遺伝子-遺伝子発現-環境相互作用によるポテンシャルにおける癌アトラクターの解析
- 2010 - 2012 発生・分化システムの時系列遺伝子発現の安定状態(アトラクター)の同定と遷移解析
- 2010 - 2012 発生・分化システムの時系列遺伝子発現の安定状態(アトラクター)の同定と遷移解析
- 2008 - 2010 初期胚発生のHoxを中心とした転写調節ネットワークのシステム進化解析
- 2008 - 2009 選択的スプライシングを受ける遺伝子の探索とシス・エレメントの体系的解析
- 2008 - 2009 初期胚発生のHoxを中心とした転写調節ネットワークのシステム進化解析
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論文 (127件): -
Kinuko Ohneda, Yoichi Suzuki, Yohei Hamanaka, Shu Tadaka, Muneaki Shimada, Junko Hasegawa-Minato, Masanobu Takahashi, Nobuo Fuse, Fuji Nagami, Hiroshi Kawame, et al. Returning genetic risk information for hereditary cancers to participants in a population-based cohort study in Japan. Journal of human genetics. 2025
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Sayuri Tokioka, Naoki Nakaya, Rieko Hatanaka, Kumi Nakaya, Mana Kogure, Ippei Chiba, Masato Takase, Kotaro Nochioka, Kai Susukita, Hirohito Metoki, et al. Association Between Sodium- and Potassium-Related Urinary Markers and the Prevalence of Atrial Fibrillation. Circulation journal : official journal of the Japanese Circulation Society. 2025
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Keigo Sato, Yoshitaka Nakamura, Kazuhito Fujiyama, Kinuko Ohneda, Takahiro Nobukuni, Soichi Ogishima, Satoshi Mizuno, Seizo Koshiba, Shinichi Kuriyama, Shinji Jinno. Absolute quantification of eight human milk oligosaccharides in breast milk to evaluate their concentration profiles and associations with infants' neurodevelopmental outcomes. Journal of food science. 2024. 89. 12. 10152-10170
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Masato Takase, Naoki Nakaya, Tomohiro Nakamura, Mana Kogure, Rieko Hatanaka, Kumi Nakaya, Ippei Chiba, Ikumi Kanno, Kotaro Nochioka, Naho Tsuchiya, et al. Genetic Risk, Healthy Lifestyle Adherence, and Risk of Developing Diabetes in the Japanese Population. Journal of atherosclerosis and thrombosis. 2024. 31. 12. 1717-1732
-
Sayuri Tokioka, Naoki Nakaya, Rieko Hatanaka, Kumi Nakaya, Mana Kogure, Ippei Chiba, Kotaro Nochioka, Hirohito Metoki, Takahisa Murakami, Michihiro Satoh, et al. Depressive symptoms as risk factors for the onset of home hypertension: a prospective cohort study. Hypertension research : official journal of the Japanese Society of Hypertension. 2024. 47. 11. 2989-3000
もっと見る MISC (122件): - 島田 宗昭, 荻島 創一, 八重樫 伸生, 山本 雅之. 【婦人科医が知っておくべきがん遺伝子パネル検査の基礎知識】研究資源としてのがん組織・がんオミックス解析データ がんゲノム医療におけるバイオバンキングの役割. 産婦人科の実際. 2020. 69. 7. 755-759
-
荻島創一, 今井健, 吉田輝彦, 小原収, 堤正好, 古田耕, 中込英人, 西村邦裕. クリニカルシークエンスデータの標準化. 医療情報学連合大会論文集(CD-ROM). 2020. 40th
- 荻島創一. がんゲノム医療のビッグデータ解析へ向けたゲノム情報と表現型情報の標準化とデータ共有. 遺伝性腫瘍(Web). 2020. 20. 1. 6-8
- 荻島 創一. ゲノム・オミクス情報の収集と利活用に向けて 国内外のゲノム医療の研究開発におけるゲノム・オミクス情報の収集と利活用. 医療情報学連合大会論文集. 2019. 39回. 224-224
- 高橋 雄太, 植木 優夫, 田宮 元, 荻島 創一, 長神 風二, 福本 健太郎, 大塚 耕太郎, 山本 雅之, 富田 博秋. ゲノムワイド遺伝子多型データを用いた機械学習によるうつ状態脆弱性の予測. 精神神経学雑誌. 2019. 2019特別号. S609-S609
もっと見る 書籍 (27件): - がんゲノムペディア : 77のキーワードで理解するゲノム医療とゲノム研究
羊土社 2024 ISBN:9784758121309
- 季刊誌「遺伝子医学」通巻47号・復刊22号(2024年1月発行) 特集「ゲノム医療におけるバイオバンクの役割とその利活用 」:わが国のバイオバンクの現状とバイオバンク・ネットワークによる利活用システムの構築
メディカル・ドゥ 2024 ISBN:9784909508270
- ヒト生体試料・データ取扱い実践ハンドブック : 適切なサンプル・データ取得からバイオバンク利活用、法規制まで、必須知識と標準フローをこの1冊に凝縮
羊土社 2023 ISBN:9784758122658
- 月刊PHARMSTAGE 2023年6月号 ゲノム情報・医療情報の統合による個別化ヘルスケアに向けたTR研究への活用
技術情報協会 2023
- 革新的AI創薬 : 医療ビッグデータ、人工知能がもたらす創薬研究の未来像
エヌ・ティー・エス 2022 ISBN:9784860437886
もっと見る 講演・口頭発表等 (211件): -
ゲノム社会における医療・健診を通じた個別化予防・医療の実現へ
(Hospital Management Japan Summit 2024 2024)
-
Research and development platform toward data-enabled health system
(「デジタル技術による医療変革の最前線」 第6回 LINK-J・UCサンディエゴ ライフサイエンスシンポジウム 2024)
-
データの取扱い(第1回)
(バイオメディカルセミナー<データ取扱い編> 2024)
-
Biobank network in Japan to accelerate progress towards genomic medicine
(EUROPE BIOBANK WEEK 2024 2024)
-
データ基盤構築と医療・健康データ等の利活用
(共創の場形成支援プログラム 共創分野・地域共創分野 第 1 回 領域ワークショップ「医療・健康データ等の利活用」 2024)
もっと見る 学歴 (4件): - 2001 - 2005 東京医科歯科大学大学院 医歯学総合研究科 先端医療開発学系 遺伝子・分子医学 生命情報学分野
- 1999 - 2001 東京医科歯科大学 難治疾患研究所 情報医学部門 生命情報学分野
- 1996 - 1999 東京大学 工学部 計数工学科
- 1994 - 1996 東京大学 教養学部 理科一類
学位 (1件): 経歴 (11件): - 2020/03 - 現在 東北大学 高等研究機構 未来型医療創成センター 教授
- 2018/04 - 現在 東北大学 東北メディカル・メガバンク機構 医療情報ICT部門 ゲノム医科学情報学分野 教授
- 2024/04 - 2025/03 大阪大学 ヒューマン・メタバース疾患研究拠点 招へい教授
- 2023/09 - 2025/03 北海道大学 非常勤講師
- 2006/04 - 2022/03 東京医科歯科大学 非常勤講師
- 2014/10 - 2018/03 東北大学 東北メディカル・メガバンク機構 医療情報ICT部門 バイオクリニカル情報学分野 准教授
- 2012/05 - 2014/09 東北大学 東北メディカル・メガバンク機構 医療情報ICT部門 バイオクリニカル情報学分野 講師
- 2007/04 - 2012/04 東京医科歯科大学 難治疾患研究所 ゲノム応用医学研究部門 生命情報学分野 助教
- 2009/05 - 2009/11 ハイデルベルク大学 ドイツがんセンター 定量システム生物学研究所(BIOQUANT) 客員研究員
- 2007/01 - 2007/03 東京医科歯科大学 難治疾患研究所 ゲノム応用医学研究部門 生命情報学分野 助手
- 2006/04 - 2006/12 東京医科歯科大学 情報医科学センター 特任助手
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委員歴 (71件): - 2020/05 - 現在 日本HL7協会 技術委員会 ゲノムWG 委員長
- 2019/06 - 現在 日本オミックス医学会(旧 日本オミックス医療学会) 理事
- 2018/05 - 現在 がんゲノム医療中核病院WG 患者情報登録WG 構成員
- 2018/05 - 現在 がんゲノム医療中核病院WG 委員
- 2016 - 現在 一般社団法人 日本ユーザビリティ医療情報化推進協議会(JUMP)ゲノムが作る新たな医療推進委員会 委員
- 2012/06 - 現在 日本バイオインフォマティクス学会 生命システム理論研究会 副査
- 2005 - 現在 オープンバイオ研究会 運営委員
- 2021/11 - 2027/03 国立研究開発法人 理化学研究所 バイオリソース研究センター リソース検討委員
- 2020/09 - 2026/08 日本医学会 医学用語管理委員会 委員
- 2020/10 - 2026/06 ISO/TC215 SC1 国内対策委員会 委員
- 2024/04 - 2026/03 日本バイオインフォマティクス学会 理事
- 2020/07 - 2026/03 日本メディカルAI学会 評議員
- 2022/07 - 2025/06 日本医療情報学会 国際委員会委員
- 2024/08 - 2025/03 国立研究開発法人国立国際医療研究センター 感染症臨床研究ネットワーク事業 システム・DX小委員会 委員
- 2024/07 - 2025/03 国立研究開発法人 国立国際医療研究センター 感染症臨床研究ネットワーク事業 ヒトゲノム小委員会 委員
- 2024/04 - 2025/03 CBIジャーナル 副編集委員長
- 2023/07 - 2025/03 健康医療情報が拓く未来会議 WG4「ゲノムのある診察室」委員
- 2021/08 - 2025/03 国立研究開発法人 国立国際医療研究センター 新興・最高感染症データバンク事業ナショナル・リポジトリ(REBIND)利活用委員会委員
- 2019/03 - 2025/03 ISO/TC276 国内審議委員会 委員(WG5 : Data Processing)
- 2014/04 - 2025/03 情報計算化学生物学会(CBI学会) 評議員
- 2013/06 - 2025/03 情報計算化学生物学会誌 CBIジャーナル 「バイオインフォマティクスとその医学応用」分野、分野長
- 2023/02 - 2025/02 クリニカルバイオバンク学会 理事
- 2024/01 - 2024/10 情報計算化学生物学会 (CBI学会)大会 2024年大会 実行委員
- 2024/01 - 2024/10 情報計算化学生物学会 (CBI学会)2024大会 プログラム委員
- 2020/10 - 2024/09 公益財団法人 日本適合性認定協会 技術アドバイザ(バイオバンク分野)
- 2013/04 - 2024/03 情報計算化学生物学会誌 CBIジャーナル 編集委員
- 2023 - 2024 第9回 クリニカルバイオバンク学会シンポジウム 大会長
- 2023/01 - 2023/10 情報計算化学生物学会 (CBI学会)2023年大会 実行委員長
- 2023/01 - 2023/10 情報計算化学生物学会 (CBI学会)2023年大会 プログラム委員
- 2021/09 - 2023/10 国立がん研究センター東病院 SCRUM-Japan MONSTAR-SCREEN-2 データベース委員会委員 委員
- 2019/04 - 2023/03 国立研究開発法人 新エネルギー・産業技術総合開発機構 分野横断的公募事業のピアレビュア
- 2019/04 - 2023/03 日本バイオインフォマティクス学会 理事
- 2022 - 2023 公益財団法人 放射線影響研究所 特別科学諮問委員
- 2023 - 第12回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2023) 実行委員
- 2021/10 - 2022/10 情報計算化学生物学会 (CBI学会)年次大会 プログラム委員長
- 2021/06 - 2022/03 国立大学法人 東京大学医科学研究所 ゲノム医療実現バイオバンク利活用プログラム(ゲノム研究バイオバンク)「バイオバンク・ジャパンあり方検討委員会」委員
- 2021/05 - 2022/03 国立研究開発法人日本医療研究開発機構(AMED) 「AMEDデータ利用審査のあり方検討会議」外部有識者
- 2019 - 2022 IMIA Standards in Health Care Informatics WG Chair
- 2022 - 第42回医療情報学連合大会 プログラム委員
- 2022 - 第4回日本メディカルAI学会学術集会 組織委員
- 2010/01 - 2021/12 次世代生命医学研究所(旧:オミックス医療協会) 監事
- 2021/02 - 2021/10 情報計算化学生物学会(CBI学会)年次大会 実行委員
- 2014 - 2021/10 情報計算化学生物学会 (CBI学会)年次大会 プログラム委員
- 2020/12 - 2021/03 KDDI総合研究所 パーソナルデータ流通の運用技術に関する標準化検討会委員
- 2020/11 - 2021/03 四次元医療改革研究会 電子カルテ改革分科会構成員
- 2020/07 - 2021/03 PeOPLe/OPERA事業 ヘルスケアデータと倫理TF 委員
- 2015/04 - 2021/03 日本バイオインフォマティクス学会 幹事(連携/ゲノム・個人情報保護)
- 2014/04 - 2021/02 一般財団法人 国際情報システム開発センター オミックス情報国際標準化検討会 委員
- 2021 - 第10回生命医薬情報学連合大会(IIBMP 2021) 実行委員
- 2018 - 2020/10 一般社団法人 日本マイクロバイオ-ムコンソーシアム NEDO先導研究プログラム研究開発推進委員会 外部委員
- 2019/11 - 2020/04 ISO/TC215 SC1 国内対策委員会 委員
- 2019/08 - 2020/03 国立研究開発法人 日本医療研究開発機構(AMED) 科学技術調査員
- 2018/12 - 2020/03 国立研究開発法人 理化学研究所 バイオリソース研究センター リソース検討委員
- 2020 - 第9回生命医薬情報学連合大会(IIBMP 2020) 実行委員
- 2019/03 - 公益財団法人 放射線影響研究所 特別科学諮問委員
- 2019 - 第8回生命医薬情報学連合大会(IIBMP 2019) 実行委員
- 2018 - 情報計算化学生物学会(CBI学会)年次大会 実行委員
- 2016/07 - 2017/03 一般社団法人 バイオ産業情報化コンソーシアム IoT推進のための新産業モデル創出基盤整備事業「ライフデータ利活用環境等に関する調査の実施」有識者委員会 委員
- 2015/07 - 2017/03 経済産業省 IoT 推進のための新事業モデル創出基盤整備事業 有識者委員会 委員
- 2017 - NGS現場の会第五回研究会 大会長
- 2017 - 第6回生命医薬情報学連合大会(IIBMP 2017) 実行委員
- 2016 - 第20回日本医療情報学会春季学術大会 プログラム委員
- 2015 - NGS現場の会第四回研究会 実行委員
- 2015 - 第19回日本医療情報学会春季学術大会 実行委員
- 2014 - 第3回生命医薬情報学連合大会(IIBMP 2014) 実行委員
- 2011/04 - 2013/10 オミックス医療研究会 幹事
- 2010/10 - 2012/05 日本バイオインフォマティクス学会 応用システムバイオロジー研究会 副査
- 2012 - NGS現場の会第二回研究会 実行委員
- 2012 - 情報計算化学生物学会(CBI学会)年次大会 プログラム委員
- 2012 - 第1回生命医薬情報学連合大会(IIBMP 2012) 実行委員
- 2011 - Linked Open Data チャレンジ Japan 2011 実行委員
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受賞 (3件): - 2017/09 - 情報処理学会DICOMO2017実行委員会 最優秀論文賞 プライバシ保護ゲノム解析のための秘密計算フィッシャー正確検定の実装評価
- 2012 - Oxford Journals Japanese Society for Bioinformatics Prize 2012
- 2011 - Asia Pacific Bioinformatics Conference 2011 the Best Poster Award
所属学会 (5件):
オープンバイオ研究会
, 日本医療情報学会
, 日本オミックス医療学会
, 情報計算化学生物学会
, 日本バイオインフォマティクス学会
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