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所属機関・部署：
職名： 教授
ホームページURL (1件)： http://www.tsurumi.yokohama-cu.ac.jp/bioinfo/
競争的資金等の研究課題 (21件)：
論文 (222件)：
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講演・口頭発表等 (97件)：
学歴 (2件)：
学位 (1件)：
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横浜市立大学 理学部 理学科 生命医科学研究科 生命医科学専攻
横浜市立大学 理学部 理学科 生命医科学研究科 生命医科学専攻 について
職名： 教授
ホームページURL (1件)： http://www.tsurumi.yokohama-cu.ac.jp/bioinfo/
競争的資金等の研究課題 (21件)：
- 2018 - 2023 生体発動分子の機能発現に関する構造ダイナミクス研究
- 2013 - 2016 分子シミュレーションによるV型ATPaseの回転機構の解明
- 2011 - 2013 Pループ型ATP加水分解酵素の機能発現機構の解明
- 2011 - 2012 相同組換えに関わる分裂酵母Rad51-Swi5-Sfr1複合体の構造生物学的研究
- 2010 - 2012 分子シミュレーションによる F1 分子モーターの回転機構の解明
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- Toru Ekimoto, Masami Nomura, Yuri Saito, Minami Suzuki, Tsutomu Yamane, Zhikuan Zhang, Umeharu Ohto, Mitsunori Ikeguchi, Toshiyuki Shimizu. Synergistic Activation of TLR7 and 8 Mediated by Reduction of Electrostatic Repulsion. Chemical and Pharmaceutical Bulletin. 2024. 72. 11. 1005-1013
- Kaho Shionoya, Jae-Hyun Park, Toru Ekimoto, Junko S Takeuchi, Junki Mifune, Takeshi Morita, Naito Ishimoto, Haruka Umezawa, Kenichiro Yamamoto, Chisa Kobayashi, et al. Structural basis for hepatitis B virus restriction by a viral receptor homologue. Nature communications. 2024. 15. 1. 9241-9241
- Masao Inoue, Tomohiko Hayashi, Satoshi Yasuda, Minoru Kato, Mitsunori Ikeguchi, Takeshi Murata, Masahiro Kinoshita. Statistical-Mechanics Analyses on Thermodynamics of Protein Folding Constructed by Privalov and Co-Workers. The journal of physical chemistry. B. 2024. 128. 41. 10110-10125
- Mitsugu Araki, Toru Ekimoto, Kazuhiro Takemura, Shigeyuki Matsumoto, Yunoshin Tamura, Hironori Kokubo, Gert-Jan Bekker, Tsutomu Yamane, Yuta Isaka, Yukari Sagae, et al. Molecular Dynamics Unveils Multiple-Site Binding of Inhibitors with Reduced Activity on the Surface of Dihydrofolate Reductase. Journal of the American Chemical Society. 2024
- Ryosuke KITA, Chiduru WATANABE, Masateru OHTA, Naoki TANIMURA, Koji OKUWAKI, Mitsunori IKEGUCHI, Kaori FUKUZAWA, Teruki HONMA, Tsuyohiko FUJIGAYA, Koichiro KATO. A machine learning model for predicting quantum chemistry based protein-drug molecule interactions. The 38th Annual Conference of the Japanese Society for Artificial Intelligence. 2024. 38
- 鈴木里佳, 登坂綺水, 浴本亨, 高橋真帆, 山根努, 坂倉正義, 水越弓子, 竹内恒, 嶋田一夫, 池口満徳, et al. 神経栄養因子NGF高親和性受容体TrkAドメイン5と新規結合ペプチドの相互作用解析. 日本薬学会年会要旨集(Web). 2021. 141st
- 永田崇, 山田達矢, 林智彦, 肥喜里志門, 小林直宏, 池口満徳, 片平正人, 木下正弘, 柳川弘志. STRUCTURAL AND PHYSICAL BASIS FOR THE HIGHER AFFINITY TO ONCOPROTEIN MDM2 OF A PEPTIDE SELECTED WITH MRNA DISPLAY OVER TUMOR SUPPRESSOR P53. 64th Annual Meeting of the Biophysical Society, San Diego, 2020.2.15-19. 2020
- 浴本亨, 小甲裕一, 苙口友隆, 池口満徳, 池口満徳. X線小角散乱と分子動力学シミュレーションを組み合わせた生体分子の溶液構造解析. アンサンブル. 2020. 22. 3
- 佐藤美和, 中川寛之, 小甲裕一, 宮口郁子, 鹿島亜希子, 馬彪, 徳久淳師, 大田雅照, 池口満徳, 池口満徳. 深層学習による低解像度電子密度データからの構造予測. 日本細胞生物学会大会(Web). 2019. 71st
- 宮口郁子, 鹿島亜季子, 佐藤美和, 中田一人, 馬彪, 松本篤幸, 徳久淳師, 大田雅照, 池口満徳. AI用学習データ作成のための高・低分解能の蛋白質結晶構造比較. 日本細胞生物学会大会(Web). 2019. 71st
- 実験医学増刊 構造生命科学で何がわかるのか何ができるのか
羊土社 2014 - Protein Conformational Dynamics
Springer Cham Heidelberg New York Dordrecht London 2014 - 1分子ナノバイオ計測
化学同人 2014 - 最新分子マシン ナノで働く“高度な機械”を目指して
化学同人 2008
-
Finite-size effect on the charging free energy in the alchemical perturbation and “Warp Drive” method
(Biophysical society 62th Annual Meeting 2018) -
In silico binding affinity analysis for phosphodiesterase-10A inhibitors
(情報計算科学生物学会2017年大会 2017) -
In silico protein design for functional modification of the photoactivated adenylate cyclase
(情報計算科学生物学会2017年大会 2017) -
Finite-size effect on the charging free energy in the alchemical perturbation and ``warp drive'' method
(情報計算科学生物学会2017年大会 2017) -
Apo- and antagonist-binding structures of vitamin D receptor ligand-binding domain elucidated by SAXS experiments and MD simulations
(第55回日本生物物理学会年会 2017)
- - 1994 東京大学 農学系研究科 応用生命工学専攻
- - 1989 東京大学 工学部 計数工学科
- 博士(農学) (東京大学)
- 横浜市立大学 国際総合科学部 生命医科学コース 生命医科学研究科生命医科学専攻 教授
- 東京大学農学部助手
※ J-GLOBALの研究者情報は、researchmapの登録情報に基づき表示しています。 登録・更新については、こちらをご覧ください。
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