研究者
J-GLOBAL ID：201201058893463242   更新日: 2024年06月19日

永田 崇

ナガタ タカシ | Nagata Takashi
所属機関・部署：
京都大学 エネルギー理工学研究所 エネルギー利用過程研究部門 生体エネルギー研究分野

京都大学 エネルギー理工学研究所 エネルギー利用過程研究部門 生体エネルギー研究分野 について


職名： 准教授
その他の所属（所属・部署名・職名） (2件)：
  • 京都大学  大学院エネルギー科学研究科 エネルギー基礎科学専攻   准教授
  • 京都大学  附属カーボンネガティブ・エネルギー研究センター   准教授
研究分野 (7件)： 薬系分析、物理化学 ,  生体化学 ,  生物分子化学 ,  分析化学 ,  生物物理学 ,  分子生物学 ,  構造生物化学
研究キーワード (64件)： 酵母表面ディスプレイ ,  FAE ,  フェルラ酸エステラーぜ ,  塩基対の開閉 ,  核酸のダイナミクス ,  in-cell NMR ,  溶解性多糖モノオキシゲナーゼ ,  LPMO ,  NMR ,  核磁気共鳴 ,  X線回折 ,  液液相分離 ,  LLPS ,  DNAオリガミ ,  蛋白質構造 ,  核酸構造 ,  立体構造 ,  蛋白質-核酸相互作用 ,  発現制御 ,  翻訳制御 ,  転写後調節 ,  転写因子 ,  天然変性 ,  四重鎖 ,  グアニン四重鎖 ,  Gカルテット ,  三重鎖 ,  フォールディング ,  スライディング ,  HIV ,  アミロイド ,  Musashi ,  FUS ,  APOBEC ,  プリオン ,  進化分子工学 ,  ナノボディ ,  VHH ,  SELEX ,  アプタマー ,  核酸医薬 ,  バイオマス ,  木質バイオマス ,  草本バイオマス ,  リグニン多糖複合体 ,  LCC ,  リグノセルロース ,  リグニン ,  ヘミセルロース ,  きのこ ,  グルクロニルエステラーゼ ,  マンガンペルオキシダーゼ ,  セルラーゼ ,  腐朽菌 ,  RNAアプタマー ,  RNA工学 ,  酵素 ,  蛋白質工学 ,  安定同位体 ,  ノンコーディングRNA ,  非コードRNA ,  RNA結合蛋白質 ,  蛋白質-蛋白質相互作用 ,  核酸-蛋白質相互作用
競争的資金等の研究課題 (19件)：
  • 2023 - 2026 HIVのヒト蛋白質分解機構を阻害するRNAアプタマーの開発とその作用機序の解明
  • 2022 - 2026 低温地域に特化した持続的グルコース生産システムの創成
  • 2020 - 2023 データサイエンスを導入した原子間力顕微鏡による四重鎖DNA検出法の開発
  • 2020 - 2023 核酸とペプチドツールを用いたアルツハイマー病関連複合体の形成原理の解明
  • 2018 - 2023 中分子アゴニスト創薬のロジカルデザイン〜OX40 アゴニスト開発を実施例として〜
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論文 (109件)：
  • Kazuyuki Kumagai, Keisuke Kamba, Takuya Suzuki, Yuto Sekikawa, Chisato Yuki, Michiaki Hamada, Kayoko Nagata, Akifumi Takaori-Kondo, Li Wan, Masato Katahira, et al. Selection and characterization of aptamers that bind to the Vif-CBF-ELOB-ELOC-CUL5 complex. Journal of Biochemistry, in press. 2024
  • Kanako Kuwasako, Weirong Dang, Fahu He, Mari Takahashi, Kengo Tsuda, Takashi Nagata, Akiko Tanaka, Naohiro Kobayashi, Takanori Kigawa, Peter Gunter, et al. 1H, 13C, and 15N resonance assignments and solution structure of the N-terminal divergent caplonin homology (NN-CH) domain of human intraflagellar transport protein 54. Biomolecular NMR Assignments. 2024
  • Hideki Kusunoki, Taiichi Sakamoto, Naohiro Kobayashi, Toshiyuki Kohno, Kaori Wakamatsu, Takashi Nagata. Structural insights into the interaction between the C-terminal-deleted BH3-like motif peptide of hepatitis B virus X protein and Bcl-xL. Biochemistry. 2024. 63. 632-643
  • Nozomi Yoneda, Haruka Iyama, Takashi Nagata, Masato Katahira, Yoshiki Ishii, Kohei Tada, Kazuhiko Matsumoto, Rika Hagiwara. Fluoride Ion in Alcohols: Isopropanol vs. Hexafluoroisopropanol. The Journal of Physical Chemistry Letters. 2024. 15. 1677-1685
  • Apisan Phienluphon, Keiko Kondo, Bunzo Mikami, Kenneth Sze Kai Teo, Kaori Saito, Takashi Watanabe, Takashi Nagata, Masato Katahira. Structure-based characterization and improvement of an enzymatic activity of <i>Acremonium alcalophilum</i> feruloyl esterase. ACS Sustainable Chemistry & Engineering. 2024. 12. 3831-3840
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MISC (422件)：
  • Keisuke Kamba, Li Wan, Kentaro Tozawa, Satoru Unzai, Ryo Morishita, Akifumi Takaori-Kondo, Takashi Nagata, Masato Katahira. Direct inhibition of human APOBEC3 deaminases by HIV-1 Vif independent of the ubiquitination/degradation pathway. 2024 IUPAB CONGRESS + 62nd Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan, 2024.06.24-28. 2024
  • 兎澤 賢太郎, 神庭 圭佑, 岩岡 諒, 永田 崇, 片平 正人. HIV-1 Vif-ヒトE3ユビキチンリガーゼ複合体がヒト抗ウイルス/がん関連因子APOBEC3の脱アミノ化活性に及ぼす影響. 第24回日本蛋白質科学会年会, 札幌コンベンションセンター, 2024.06.11-13. 2024
  • 八木 勇成, 近藤 敬子, Huyen Nguyen, 渡辺 隆司, 三上 文三, 永田 崇, 片平 正人. 溶解性多糖モノオキシゲナーゼの基質結合面上のチロシン残基:セルロース分解促進効果に与える影響. 第24回日本蛋白質科学会年会, 札幌コンベンションセンター, 2024.06.11-13. 2024
  • 楠英樹, 小林直宏, 若松馨, 田中俊之, 永田崇. 安定同位体標識したHBV X蛋白質由来ペプチドの簡便な調製法とNMRによる宿主蛋白質との弱い相互作用系への応用. 第24回日本蛋白質科学会年会, 札幌コンベンションセンター, 2024.06.11-13. 2024
  • Yudai Yamaoki, Takashi Nagata, Tomoki Sakamoto, Omar Eladl, Keiko Kondo, Masato Katahira. In-cell NMR analysis on base-pair opening dynamics and interactions with ligands of nucleic acids in living human cells. 2024 IUPAB CONGRESS + 62nd Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan, 2024.06.24-28. 2024
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特許 (1件)：
  • Hsp70を有効成分として含有するHIV-1感染症治療剤
書籍 (10件)：
  • Experimental Approaches of NMR Spectroscopy -Methodology and Application to Life Science and Material Science 2nd Edition, in press
    Springer Nature 2024
  • 生命金属ダイナミクス~生体内における金属の挙動と制御~
    NTS 2021
  • Observation of nucleic acids inside living human cells by in-cell NMR spectroscopy
    Biophysics and Physicobiology, 13, 164, 2020 2020
  • Recent progress of in-cell NMR of nucleic acids in living human cells
    Biophysical Reviews, 12, 411, 2020 2020
  • ヒト生細胞中における核酸NMRシグナルの初計測
    生物物理誌 2019
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講演・口頭発表等 (24件)：
  • 生体高分子の運動性と構造を様々な時間領域で調べるためのin-cell NMR法の開発
    (京都大学エネルギー理工学研究所R5年度第4回センター談話会 2023)
  • バイオマス利用に向けた構造生命科学的あアプローチ:可能性と挑戦
    (京都大学宇治キャンパス公開2023エネルギー理工学研究所公開講演会 2023)
  • Structural Biology Approaches to Biomass Utilization: Opportunities and Challenges
    (The 14th International Symposium of Advanced Energy Science 2023)
  • タンパク質のNMRシグナルの帰属・構造解析の基礎 ~自動化の時代~
    (第22回若手NMR研究会 NMRによる多彩な生体試料へのアプローチ 2022)
  • Analysis of Structure and Dynamics of Oligonucleotides in Living Human Cells
    (Joint conference of ISMAR-APNMR-NMRSJ-SEST 2021, 2021.8.23-27. 2021)
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学歴 (2件)：
  • 1994 - 1999 横浜国立大学 大学院工学研究科 物質工学専攻後期課程
  • 1992 - 1994 横浜国立大学 大学院工学研究科 物質工学専攻前期課程
学位 (1件)：
  • 博士(工学) (横浜国立大学大学院工学研究科)
経歴 (9件)：
  • 2013/06 - 現在 京都大学 エネルギー理工学研究所 准教授
  • 2011/09 - 2013/05 京都大学 エネルギー理工学研究所 助教
  • 2009/04 - 2011/08 横浜市立大学 生命ナノシステム科学研究科 助教
  • 2008/04 - 2009/03 横浜市立大学 国際総合科学部 助教
  • 2006/04 - 2008/03 横浜市立大学 国際総合科学部 助手
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委員歴 (1件)：
  • 2016/04 - 現在 日本分光学会 編集委員
受賞 (5件)：
  • 2023/03 - 京都大学エネルギー理工学研究所 2022年度研究所長賞 核酸塩基対の開閉運動を生きた細胞内で観測することに成功
  • 2002 - 米国白血病研究基金 博士研究員奨学金
  • 2001 - 米国白血病研究基金 博士研究員奨学金
  • 2001 - 米国エネルギー省 米国エネルギー省奨学金(ポスター賞)
  • 2000 - ロックフェラー大学 学長賞
所属学会 (7件)：
日本分光学会 ,  日本生物物理学会 ,  日本核磁気共鳴学会 ,  日本RNA学会 ,  日本蛋白質科学会 ,  日本分子生物学会 ,  The Biophysical Society
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