小林徹也

コバヤシテツヤ | kobayashi Tetsuya J

所属機関・部署：
職名：教授
ホームページURL (1件)： http://research.crmind.net

研究分野 (6件)：生物物理、化学物理、ソフトマターの物理 , 数理情報学 , 生物物理学 , ソフトコンピューティング , 生命、健康、医療情報学 , システムゲノム科学

研究キーワード (20件)：計算論的神経科学 , 嗅覚系 , 大偏差理論 , 力学系 , 点過程 , 化学熱力学 , 非平衡物理学 , 化学反応ネットワーク , 最適フィルター理論 , 最適制御理論 , 情報幾何学 , 応用数学 , 進化生物学 , システム生物学 , 発生生物学 , 免疫学 , バイオインフォマティクス , 生物物理学 , 理論生物学 , 定量生物学

競争的資金等の研究課題 (18件)：

2019 - 2024 情報物理学でひもとく生命の秩序と設計原理
2019 - 2024 適応過程の情報物理学的理解
2019 - 2022 細胞複製能の階層横断的理解
2018 - 2020 深層ネットワークを援用した表現型制約と表現型進化原理の探索と普遍構造の探求
2018 - 2020 低次元化に基づく免疫受容体配列ダイバーシティ解析手法の改良と応用展開

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論文 (103件)：

Atsushi Kamimura, Yuki Sughiyama, Tetsuya J. Kobayashi. Thermodynamic and stoichiometric laws ruling the fates of growing systems. Physical Review Research. 2024. 6. 023173
Tsuyoshi Mizohata, Tetsuya J. Kobayashi, Louis-S. Bouchard, Hideyuki Miyahara. Information geometric bound on general chemical reaction networks. Physical Review E. 2024. 109. 4
Yuki Takakura, Moeka Machida, Natsumi Terada, Yuka Katsumi, Seika Kawamura, Kenta Horie, Maki Miyauchi, Tatsuya Ishikawa, Nobuko Akiyama, Takao Seki, et al. Mitochondrial protein C15ORF48 is a stress-independent inducer of autophagy that regulates oxidative stress and autoimmunity. Nature Communications. 2024. 15. 1
Tetsuya J. Kobayashi, Dimitri Loutchko, Atsushi Kamimura, Shuhei A. Horiguchi, Yuki Sughiyama. Information geometry of dynamics on graphs and hypergraphs. Information Geometry. 2023
Kenta Horie, Kano Namiki, Kyouhei Kinoshita, Maki Miyauchi, Tatsuya Ishikawa, Mio Hayama, Yuya Maruyama, Naho Hagiwara, Takahisa Miyao, Shigeo Murata, et al. Acute irradiation causes a long-term disturbance in the heterogeneity and gene expression profile of medullary thymic epithelial cells. Frontiers in Immunology. 2023. 14

MISC (37件)：

中村絢斗, 小林徹也. 大腸菌走化性運動における最適な感知と制御. 生物物理. 2023. 63. 6. 325-329
小林徹也, 中村絢斗. 細胞はどれくらい賢く匂いを嗅げるのか?-生体による化学情報感知の普遍的性質. AROMA RESEARCH. 2022. 23. 4. 320-327
中村絢斗, 小林徹也. バクテリア化学走性と確率最適制御:Bacterial chemotaxis and stochastic optimal control. システム/制御/情報. 2022. 66. 9. 346-351
梶田真司, 合原一幸, 小林徹也. 免疫T細胞の抗原識別における確率ノイズの機能. 日本数理生物学会年会(Web). 2019. 29th
梶田真司, 合原一幸, 小林徹也. 細胞によるリガンド識別と親和性への非線形応答性. 自動制御連合講演会講演論文集. 2017. 60. 0. 1003-1004

書籍 (5件)：

機械学習を生命科学に使う! : シークエンスや画像データをどう解析し、新たな生物学的発見につなげるか?
羊土社 2020 ISBN:9784758103916
定量生物学 : 生命現象を定量的に理解するために
化学同人 2018 ISBN:9784759817300
バイオ画像解析手とり足とりガイド : バイオイメージングデータを定量して生命の形態や動態を理解する!
羊土社 2014 ISBN:9784758108157
「特集」生命システムを定量する! : 未知なる現象の謎を解け!
羊土社 2013 ISBN:9784758100953
生命科学の新しい潮流理論生物学
共立出版 2011 ISBN:4320057139

講演・口頭発表等 (105件)：

epiNMF: a Novel Method to Uncover the Influence of Epigenome on Local Mutation Rates
(Gordon Research Seminar, DNA Damage, Mutation and Cancer 2024)
ストレス条件下における髄質胸腺上皮細胞の分化ダイナミクス変化の情報学的解析
(第8回理論免疫学ワークショップ 2024)
環境を通じて情報共有する細胞集団の強化学習的理解
(第8回理論免疫学ワークショップ 2024)
細胞集団の勾配流によるモデリング
(第8回理論免疫学ワークショップ 2024)
歴史から紐解く化学反応論と化学熱力学
(定量生物学の会第十一回年会 2024)

学位 (1件)：

科学 (東京大学)

経歴 (8件)：

2023/04 - 現在東京大学生産技術研究所教授
2011/10 - 現在東京大学大学院情報理工学系研究科数理情報学専攻准教授
2011/10 - 現在東京大学大学院工学系研究科電気系工学専攻准教授
2011/10 - 2023/03 東京大学生産技術研究所准教授
2017/03 - 2018/03 ユニバーシティ・カレッジ・ロンドン honorary research associate

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受賞 (4件)：

2024/03 - 総務省 2023年度「異能ジェネレーションアワード」生物はどこまで賢く匂いを探索するのか?ノイズに負けない探索戦略を紐解く新理論の構築
2019/11 - 生産技術研究所奨励会顕彰免疫レパートリビッグデータの解析技術の構築とシステム免疫学の国際ネットワークの形成
2013/10 - 日本生物物理学会日本生物物理学会若手奨励賞細胞システムの内因的・外因的ゆらきに対するロバスト性に関する理論的基礎
2010/06 - (独)科学技術振興機構 CREST「生命システムの動作原理と基盤技術」ポスター賞

所属学会 (4件)：

日本生物物理学会 , 定量生物学の会 , 「細胞を創る」研究会 , 日本数理生物学会

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小林 徹也

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