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研究者
J-GLOBAL ID:201801003095599572   更新日: 2025年03月13日

川島 秀一

Kawashima Shuichi | Kawashima Shuichi
所属機関・部署:
研究分野 (5件): データベース ,  遺伝学 ,  応用微生物学 ,  ウェブ情報学、サービス情報学 ,  ゲノム生物学
研究キーワード (9件): ゲノム変異 ,  リンクトデータ ,  リンクトオープンデータ ,  RDF ,  データベース ,  セマンティックウェブ ,  バイオインフォマティクス ,  オントロジー ,  ゲノムオントロジー
競争的資金等の研究課題 (5件):
  • 2021 - 2024 多因子疾患の環境曝露の発症機序への影響の深層学習によるシステム的解明
  • 2018 - 2022 日本人のゲノム・健康・診療情報と公共知識ベースのセマンティック統合システムの開発
  • 2014 - 2018 文献全文からの網羅的な生物メタ情報抽出技術の開発
  • 2010 - 2011 完全長cDNAライブラリを利用したダニアレルギーワクチンの開発
  • 2003 - 2004 微生物ゲノムと細胞機能の統合データベースの開発
論文 (78件):
  • Shuya Ikeda, Zhaonan Zou, Hidemasa Bono, Yuki Moriya, Shuichi Kawashima, Toshiaki Katayama, Shinya Oki, Tazro Ohta. Extraction of biological terms using large language models enhances the usability of metadata in the BioSample database. bioRxiv. 2025. 2025.02.17.638570
  • Shuya Ikeda, Kiyoko F. Aoki-Kinoshita, Hirokazu Chiba, Susumu Goto, Masae Hosoda, Shuichi Kawashima, Jin-Dong Kim, Yuki Moriya, Tazro Ohta, Hiromasa Ono, et al. Expanding the concept of ID conversion in TogoID by introducing multi-semantic and label features. Journal of Biomedical Semantics. 2025. 16. 1
  • 長尾 知生子, 鎌田 真由美, 中津井 雅彦, 深川 明子, 片山 俊明, 川島 秀一, 水口 賢司, 安倍 理加. 医薬品関連文書の利活用に向けたインタビューフォームの構造化の提案. 医薬品情報学. 2023. 24. 4. 187-195
  • Nobutaka Mitsuhashi, Licht Toyo-Oka, Toshiaki Katayama, Minae Kawashima, Shuichi Kawashima, Kazunori Miyazaki, Toshihisa Takagi. TogoVar: A comprehensive Japanese genetic variation database. Human genome variation. 2022. 9. 1. 44-44
  • 高月 照江, 池田 秀也, 井手 隆広, 大田 達郎, 小野 浩雅, 片山 俊明, 川島 秀一, 申 在紋, 建石 由佳, 千葉 啓和, et al. 統合データベース探索フレームワークTogoDXの開発とその応用. トーゴーの日2022. 2022. 1
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MISC (23件):
  • 守屋勇樹, 池田秀也, 井手隆広, 大田達郎, 小野浩雅, 川島秀一, SHIN Jae-Moon, 高月照江, 建石由佳, 千葉啓和, et al. TogoDX/Human:ヒトに関するデータを統合的に探索・俯瞰・抽出するためのアプリケーション. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2022. 45th
  • 三橋信孝, 川嶋実苗, 片山俊明, 川島秀一, 守屋勇樹, 秦千比呂, 福田亜沙美, 児玉悠一, 藤澤貴智, 豊岡理人, et al. 日本人ゲノムバリアント統合データベースTogoVarのアップデート. 日本人類遺伝学会大会(CD-ROM). 2022. 67th
  • 豊岡理人, 三橋信孝, 川嶋実苗, 片山俊明, 川島秀一, 秦千比呂, 福田亜沙美, 児玉悠一, 藤澤貴智, 高木利久, et al. TogoVarによるバリアント頻度情報統合とNBDCヒトデータベースによるデータ共有推進. 日本人類遺伝学会大会(CD-ROM). 2021. 66th
  • 豊岡理人, 三橋信孝, 川嶋実苗, 建石由佳, 片山俊明, 川島秀一, 秦千比呂, 福田亜沙美, 児玉悠一, 高木利久, et al. データ共有の推進とアリル頻度データベース統合のためのNBDCヒトデータベースとTogoVar. 日本人類遺伝学会大会(CD-ROM). 2020. 65th
  • 豊岡 理人, 三橋 信孝, 川嶋 実苗, 片山 俊明, 川島 秀一, 建石 由佳, 藤原 豊史. ゲノム研究に役立つヒトゲノムバリアントデータベース「TogoVar」. トーゴーの日2018. 2018. 1
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書籍 (1件):
  • SPARQL : オープンデータ時代の標準Web API
    インプレスR&D 2015 ISBN:9784802090438
学位 (1件):
  • 博士(科学) (東京大学)
経歴 (1件):
  • 2019/08 - 現在 情報・システム研究機構 データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター 特任准教授
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