研究者
J-GLOBAL ID:201801011296786926   更新日: 2024年09月21日

高谷 大輔

Daisuke Takaya
所属機関・部署:
その他の所属(所属・部署名・職名) (1件):
  • 特定国立研究開発法人理化学研究所  生命機能科学研究センター   客員研究員
研究キーワード (9件): 創薬 ,  インシリコスクリーニング ,  FMODB ,  SBDD ,  CADD ,  LBDD ,  機械学習 ,  生物分子設計 ,  フラグメント分子軌道法
競争的資金等の研究課題 (5件):
  • 2023 - 2027 理論創薬研究における系統的前処理による確からしい生体現象予測と検証
  • 2022 - AIとFMO法を融合したインシリコスクリーニングと分子間相互作用解析支援
  • 2017 - 2022 構造インフォマティクスとFMO計算を融合したインシリコスクリーニング支援研究
  • 2018 - 2021 フラグメント分子軌道法による分子間相互作用データベース構築と創薬研究への普及
  • 2014 - 2016 アミノ酸残基環境ファクターとリガンド相互作用形成能の相関解析
論文 (30件):
  • Daisuke Takaya. Computer-Aided Drug Design Using the Fragment Molecular Orbital Method: Current Status and Future Applications for SBDD. Chemical and Pharmaceutical Bulletin. 2024. 72. 9. 781-786
  • Kikuko Kamisaka, Shunpei Nagase, Chiduru Watanabe, Daisuke Takaya, Hitomi Yuki, Teruki Honma. Statistical analysis of interactions among amino acid residues in apo structures using fragment molecular orbital method. Chem-Bio Informatics Journal. 2024. 24. 25-47
  • Yuya Seki, Chiduru Watanabe, Norihiko Tani, Kikuko Kamisaka, Tatsuya Ohyama, Daisuke Takaya, Teruki Honma. Structural Stability and Binding Ability of SARS-CoV-2 Main Protease with GC376: A Stereoisomeric Covalent Ligand Analysis by FMO calculation. Chem-Bio Informatics Journal. 2024. 24. 13-24
  • Chiduru Watanabe, Shigenori Tanaka, Yoshio Okiyama, Hitomi Yuki, Tatsuya Ohyama, Kikuko Kamisaka, Daisuke Takaya, Kaori Fukuzawa, Teruki Honma. Quantum Chemical Interaction Analysis between SARS-CoV-2 Main Protease and Ensitrelvir Compared with Its Initial Screening Hit. The Journal of Physical Chemistry Letters. 2023. 3609-3620
  • Nobuo Cho, Ko Kikuzato, Yushi Futamura, Takeshi Shimizu, Hiroki Hayase, Kikuko Kamisaka, Daisuke Takaya, Hitomi Yuki, Teruki Honma, Mamoru Niikura, et al. New antimalarials identified by a cell-based phenotypic approach: Structure-activity relationships of 2,3,4,9-tetrahydro-1H-β-carboline derivatives possessing a 2-((coumarin-5-yl)oxy)alkanoyl moiety. Bioorganic & medicinal chemistry. 2022. 66. 116830-116830
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MISC (26件):
  • 小田島大貴, 宮川柊兵, 半田佑磨, 古石誉之, 米持悦生, 佐藤朋広, 幸瞳, 本間光貴, 高谷大輔, 上村みどり, et al. フラグメント分子軌道法を活用したm-Glu5新規阻害剤の検討. 日本薬学会年会要旨集(Web). 2024. 144th
  • 上村憲汰, 半田佑磨, 半田佑磨, 宮岸澄真, 古石誉之, 米持悦生, 遠藤真弓, 上村みどり, TIAN Yushi, 高谷大輔, et al. FMO計算を用いたIL-10受容体複合体間の相互作用解析に基づく分子設計. 日本薬学会年会要旨集(Web). 2024. 144th
  • 小田島大貴, 宮川柊兵, 半田佑磨, 古石誉之, 米持悦生, 佐藤朋広, 幸瞳, 本間光貴, 高谷大輔, 上村みどり, et al. フラグメント分子軌道法を活用した代謝型グルタミン酸受容体5阻害剤の分子設計. 構造活性相関シンポジウム講演要旨集(CD-ROM). 2023. 51st
  • 海老原佳奈, 稲葉和恵, 千田美紀, 安孫子ユミ, 佐久間知佐子, 小祝孝太郎, 高谷大輔, 渡邉千鶴, 今村理世, 岡部隆義, et al. ネッタイシマカ由来のグルタチオンS-トランスフェラーゼに対する新規殺虫化合物の作用機序. 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web). 2023. 2023
  • 上村憲汰, 半田佑磨, 古石誉之, 米持悦生, 上村みどり, 遠藤真弓, 田雨時, 高谷大輔, 福澤薫, 福澤薫. FMO計算を用いたIL10-IL10受容体複合体間の相互作用解析. 日本薬学会関東支部大会講演要旨集. 2022. 66th (CD-ROM)
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書籍 (7件):
  • タンパク質の構造解析手法と In silicoスクリーニングへの応用事例
    2023 ISBN:9784861049712
  • 口頭発表 O6 「計算化学(分子認識)/ 構造相関解析 / 量子構造生命科学」
    CBI学会誌第10巻第4号 2022
  • TS-02 第 29 回 FMO 研究会 「FMO データベースの実践チュートリアル - 生体高分子の認識機構解析: MD 連携、核酸分子解析 -」報告書
    2022
  • チュートリアル「第24回FMO研究会 FMOデータベースの最新機能紹介と実践チュートリアル-COVID-19関連タンパク質の分子認識機構解析-」報告書
    CBI学会誌 第9巻第4号 2021
  • SAR News No.40; 理論創薬及び関連分野における SARS-CoV-2 研究動向 2020~2021/3
    日本薬学会 構造活性相関部会 2021
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講演・口頭発表等 (42件):
  • インシリコスクリーニング(LBDD)のための最近のフィンガープリントの性能検討
    (第50回構造活性相関シンポジウム 2022)
  • Constructing QSAR models for c-Met inhibitors
    (CBI 2022 年大会 2022)
  • Recent Progress in the Development of FMODB: A Database of QM-based Interaction Data of Biomolecules for Drug Discovery and Protein Functional Analysis
    (Biologics By Design Asia 2022 2022)
  • 脱ユビキチン化酵素USP15を特異的に阻害する低分子化合物の開発
    (第44回日本分子生物学会年会)
  • VISCANA による SARS-CoV-2 main protease とリガンドの網羅的相互作用解析
    (第49回構造活性相関シンポジウム プログラム 2021)
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Works (4件):
  • FMODB
    2019 - 現在
  • FMODBチュートリアル資料2021
    高谷大輔 2021 -
  • Cover art, Journal of Chemical Information and Modeling, Volume 61, Issue 2
    2021 -
  • 公開用githubリポジトリ
経歴 (2件):
  • 2022/06 - 現在 特定国立研究開発法人理化学研究所 生命機能科学研究センター 客員研究員
  • 2020/10 - 2022/05 特定国立研究開発法人理化学研究所 生命機能科学研究センター 研究員
委員歴 (7件):
  • 2024/01 - 2024/06 日本薬学会 構造活性相関部会 実行委員
  • 2021/12 - 2022/10 CBI学会 CBI学会2022年大会プログラム委員
  • 2021/09 - 2022/10 CBI 学会 2022 年大会実行委員
  • 2021/05 - 2021/11 第49回構造活性相関シンポジウム 第49回構造活性相関シンポジウム実行委員
  • 2021/01 - 2021/10 CBI学会 2021年大会プログラム委員
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受賞 (1件):
  • 2022/12 - 日本薬学会 構造活性相関部会 SAR Presentation Award(第50回構造活性相関シンポジウム) インシリコスクリーニング(LBDD)のための最近のフィンガープリントの性能検討
所属学会 (2件):
日本薬学会 ,  日本蛋白質科学会
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