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研究者
J-GLOBAL ID:202101013476683597   更新日: 2025年01月12日

大田 達郎

オオタ タツロウ | Ohta Tazro
クリップ
所属機関・部署:
職名: 准教授
その他の所属(所属・部署名・職名) (3件):
  • 特定国立研究開発法人理化学研究所  情報統合本部   客員研究員
  • 国立遺伝学研究所  生命情報・DDBJ研究センター   特命准教授
  • 情報・システム研究機構  データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター   客員准教授
論文 (33件):
  • Shuya Ikeda, Kiyoko F. Aoki-Kinoshita, Hirokazu Chiba, Susumu Goto, Masae Hosoda, Shuichi Kawashima, Jin-Dong Kim, Yuki Moriya, Tazro Ohta, Hiromasa Ono, et al. Expanding the concept of ID conversion in TogoID by introducing multi-semantic and label features. Journal of Biomedical Semantics. 2025. 16. 1
  • Yuka MASAMURA, Ryuichi KUBO, Yuki MIDORIKAWA, Natsuko O SHINOZAKI, Satoshi WATANABE, Sayumi MAEKAWA, Aya K TAKEDA, Tazro OHTA. Differences in the human gut microbiota with varying depressive symptom severity scores. Bioscience of Microbiota, Food and Health. 2024
  • Zhaonan Zou, Tazro Ohta, Shinya Oki. ChIP-Atlas 3.0: a data-mining suite to explore chromosome architecture together with large-scale regulome data. Nucleic Acids Research. 2024. 52. W1. W45-W53
  • Mats Perk, Arun Isaac, Tazro Ohta, Egon Willighagen, Leyla Jael Castro, Toshiaki Katayama, Pjotr Prins. Metadata handling for BioHackathon publications through BioHackrXiv. 2024
  • Tazro Ohta, Ayaka Hananoe, Ayano Fukushima-Nomura, Koichi Ashizaki, Aiko Sekita, Jun Seita, Eiryo Kawakami, Kazuhiro Sakurada, Masayuki Amagai, Haruhiko Koseki, et al. Best practices for multimodal clinical data management and integration: An atopic dermatitis research case. Allergology international : official journal of the Japanese Society of Allergology. 2023
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MISC (1件):
  • 守屋勇樹, 池田秀也, 井手隆広, 大田達郎, 小野浩雅, 川島秀一, SHIN Jae-Moon, 高月照江, 建石由佳, 千葉啓和, et al. TogoDX/Human:ヒトに関するデータを統合的に探索・俯瞰・抽出するためのアプリケーション. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2022. 45th
書籍 (10件):
  • Nanopore sequencing : methods and protocols
    Humana Press 2023 ISBN:9781071629956
  • バイオDBとウェブツール : ラボで使える最新70選 : 知る・学ぶ・使う、バイオDX時代の羅針盤
    羊土社 2022 ISBN:9784758104067
  • ロングリードWET&DRY解析ガイド : シークエンスをもっと自由に! : リピート配列から構造変異、ダイレクトRNA、de novoアセンブリまで、研究の可能性をグンと広げる応用自在な最新技術 : どこでも、誰でも、今日から使える!
    羊土社 2021 ISBN:9784758122535
  • Practical guide to life science databases
    Springer 2021 ISBN:9789811658112
  • 次世代シークエンサーDRY解析教本
    学研メディカル秀潤社,学研プラス (発売) 2019 ISBN:9784780909838
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講演・口頭発表等 (16件):
  • Tonkaz: A workflow reproducibility scale for automatic validation of biological interpretation results
    (The 31st Annual Intelligent Systems For Molecular Biology and the 22nd Annual European Conference on Computational Biology 2023)
  • Sapporo: A GA4GH WES implementation for multiple workflow languages
    (GA4GH CONNECT 2023 2023)
  • Demonstration: Common Workflow Language
    (2022年度 日本バイオインフォマティクス学会年会 第11回 生命医薬情報学連合大会 2022)
  • Yevis: System to support building a workflow registry with automated quality control
    (The 30th Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology 2022)
  • Sapporo: an implementation of the GA4GH Workflow Execution Service standard
    (Basel Computational Biology Conference 2021)
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学歴 (2件):
  • 2009 - 2011 東京大学 大学院農学生命科学研究科 生産・環境生物学専攻
  • 2005 - 2009 神戸大学 農学部 生物環境制御学科
学位 (1件):
  • 博士(理学) (総合研究大学院大学)
経歴 (8件):
  • 2023/05 - 現在 国立遺伝学研究所 生命情報・DDBJ研究センター 特命准教授
  • 2023/04 - 現在 千葉大学 大学院 医学研究院 准教授
  • 2023/04 - 現在 千葉大学 国際高等研究基幹 准教授
  • 2023/04 - 現在 情報・システム研究機構 データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター 客員准教授
  • 2019/05 - 現在 特定国立研究開発法人理化学研究所 情報統合本部 客員研究員
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