研究者
J-GLOBAL ID:202201000046281331
更新日: 2024年03月30日
土居 英男
ドイ ヒデオ | Doi Hideo
研究キーワード (2件):
分子シミュレーション
, 計算化学
論文 (35件):
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Sota Matsuoka, Kota Sakakura, Yoshinobu Akinaga, Kazuki Akisawa, Koji Okuwaki, Hideo Doi, Yuji Mochizuki. Enhancement of energy decomposition analysis in fragment molecular orbital calculations. Journal of Computational Chemistry. 2023
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Koji Okuwaki, Hideo Doi, Taku Ozawa, Yuji Mochizuki. Development of reverse mapping system bridging dissipative particle dynamics and fragment molecular orbital calculation. Japanese Journal of Applied Physics. 2023
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Yusuke Tachino, Koji Okuwaki, Hideo Doi, Kazuki Akisawa, Yuji Mochizuki. Dissipative particle dynamics simulation for peptoid nanosheet with non-empirical parameter set. Japanese Journal of Applied Physics. 2023
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Hideo Doi, Sota Matsuoka, Koji Okuwaki, Ryo Hatada, Soujiro Minami, Ryosuke Suhara, Yuji Mochizuki. Machine learning to improve efficiency of non-empirical interaction parameter for dissipative particle dynamics (DPD) simulation. Japanese Journal of Applied Physics. 2023
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Yusuke TACHINO, Hideo DOI, Koji OKUWAKI, Yoshinori HIRANO, Yuji MOCHIZUKI. タンパク質に関する FMO-DPD シミュレーション用パラメータ算定と試行. Journal of Computer Chemistry, Japan. 2023. 22. 2. 15-17
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MISC (12件):
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松岡壮太, 柿沼紗也果, 奥脇弘次, 土居英男, 望月祐志. FMODBからのデータ取得用Pythonスクリプトの開発. J. Comp. Chem. Jpn. 2024
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望月 祐志, 中野 達也, 坂倉 耕太, 奥脇 弘次, 土居 英男, 加藤 季広, 滝沢 寛之, 成瀬 彰, 大島 聡史, 星野 哲也, et al. FMOプログラムABINIT-MPの整備状況2023. J. Comp. Chem. Jpn. 2024. 23. 1. 4-8
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望月 祐志, 中野 達也, 坂倉 耕太, 渡邊 啓正, 佐藤 伸哉, 奥脇 弘次, 秋澤 和輝, 土居 英男, 大島 聡史, 片桐 孝洋. FMOプログラムABINIT-MPの整備状況2022. J. Comp. Chem. Jpn. 2023. 21. 4. 106-110
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奥脇弘次, 新庄永治, 西田瑠花, 加藤幸一郎, 土屋裕大朗, 土居英男, 望月祐志, 望月祐志, 福澤薫, 福澤薫, et al. FMO-DPDの連携による脂質二重膜,タンパク質の構造解析システムの整備と応用. 応用物理学会春季学術講演会講演予稿集(CD-ROM). 2020. 67th
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奥脇弘次, 新庄英治, 土居英男, 望月祐志, 望月祐志, 福澤薫, 福澤薫, 米持悦生. FMO計算に基づく脂質二重膜,タンパク質の非経験的粗視化シミュレーションの展開. 応用物理学会春季学術講演会講演予稿集(CD-ROM). 2019. 66th
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講演・口頭発表等 (4件):
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機械学習を援用したDPDシミュレーションのための非経験的算定
(第84回応用物理学会秋季学術講演会 2023)
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DPDシミュレーション用パラメータの非経験的算定の機械学習による効率化
(第28回計算工学講演会 2023)
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フラグメント分子軌道計算に基づく脂質膜中の微小ドメインのDPDシミュレーションのためのパラメータ開発
(第70回応用物理学会春季学術講演会 2023)
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フラグメント分子軌道計算に基づく有効パラメータを用いる脂質膜中の微小ドメインの粗視化シミュレーションの試み
(第83回応用物理学会秋季学術講演会 2022)
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