- 2024 - 2029 日本列島の森林生態系の形成過程の解明
- 2024 - 2027 人為選択実験と全ゲノム分析による植物の適応進化過程の復元
- 2024 - 2027 矮化オオバコの適応進化ーエピジェネティックな変化による進化の検証
- 2021 - 2024 生態ゲノミクスによる野生植物の平行進化機構の解明
- 2019 - 2024 シカがもたらす葉サイズの進化と可塑性の変化ー葉サイズ制御の分子機構の解明
- 2018 - 2021 キク科植物の交配前隔離に関わるゲノム領域の特定
- 2016 - 2020 オーストラリアの乾燥環境勾配に沿った染色体数減数現象の解析
- 2016 - 2019 植物の生態型分化機構研究:アキノキリンソウ群多様化の比較ゲノム解析
- 2014 - 2017 ニューカレドニアにおけるヒノキ科2属の平行的な生態的種分化の解明
- 2013 - 2017 植物の超塩基性土壌への適応進化:シュンジュギクの比較ゲノム解析
- 2013 - 2016 生態ゲノミクスで豪州ヒノキにおける環境適応プロセスを復元する
- 2012 - 2015 種内・属内レベルの集団ゲノミクスによる樹木の適応進化・種分化プロセスの解明
- 2010 - 2012 ヒノキ科樹木における環境適応プロセスの遺伝的解明
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