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J-GLOBAL ID：201302297634540960   整理番号：13A0155275

有用な代謝物質の過剰産生のための3倍反応ノックアウト大腸菌菌株のin silicoスクリーニング

In silico screening of triple reaction knockout Escherichia coli strains for overproduction of useful metabolites

著者 (4件)： OHNO Satoshi (Dep. of Bioinformatic Engineering, Graduate School of Information Sci. and Technol., Osaka Univ., 1-5 Yamadaoka ...) ,  FURUSAWA Chikara (Dep. of Bioinformatic Engineering, Graduate School of Information Sci. and Technol., Osaka Univ., 1-5 Yamadaoka ...) ,  FURUSAWA Chikara (Quantitative Biology Center (QBiC), RIKEN, 6-2-3 Furuedai, Suita, Osaka 565-0874, JPN) ,  SHIMIZU Hiroshi (Dep. of Bioinformatic Engineering, Graduate School of Information Sci. and Technol., Osaka Univ., 1-5 Yamadaoka ...)
資料名： Journal of Bioscience and Bioengineering  (Journal of Bioscience and Bioengineering)
巻： 115  号： 2  ページ： 221-228  発行年： 2013年02月 
JST資料番号： G0535B  ISSN： 1389-1723  CODEN： JBBIF6  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 微生物による産業上有用な代謝物質の効率的生産については,生産に適する代謝ネットワークを設計することが重要である。この目的で,強制系代謝フラックスシミュレーションは,標的生産性に対する反応ノックアウトの影響を予測する,強力なツールである。本研究では,強制系代謝シミュレーションを用いて,in silicoスクリーニングを行い,組換え大腸菌による1-ブタノール,1-プロパノール,および1,3-プロパンジオールの生産性を増加させる,ノックアウト候補組を同定した。3倍反応ノックアウトのすべての可能性のある組によってもたらされた物質代謝について,顕著に計算コストを低減するように構成した,低減代謝モデルを用いて,評価した。結果は,遺伝子破壊によって標的生産性を改良するための戦略を実証した。従来の選別法によっては,これらのうちの一部を達成することができなかった。かかるノックアウト戦略は,標的生産性のさらなる改善をサポートすることができた。Copyright 2013 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.

シソーラス用語： 計算機シミュレーション ,  スクリーニング ,  遺伝子ターゲティング ,  代謝産物 ,  フラックス【流束】 ,  *大腸菌 ,  *アルコール発酵 ,  *遺伝子破壊 ,  *突然変異体 ,  脂肪族アルコール ,  in silico ,  *遺伝子ノックアウト法 ,  遺伝的組換え ,  代謝流束 ,  計算機利用 ,  利用 ,  *微生物
準シソーラス用語： 組換 ,  *遺伝子ノックアウト ,  遺伝子組換 ,  代謝フラックス

分類 (1件)： 微生物代謝産物の生産  (FK03020A)

物質索引 (3件)： 1,3-プロパンジオール ,  1-ブタノール ,  1-プロパノール

引用文献 (30件)：

• AJIKUMAR, P. K. Isoprenoid pathway optimization for taxol precursor overproduction in Escherichia coli. Science. 2010, 330, 70-74
• BECKER, J. Bio-based production of chemicals, materials and fuels-Corynebacterium glutamicum as versatile cell factory. Curr. Opin. Biotechnol. 2011, 23, 1-10
• BURGESS, C. M. Bacterial vitamin B2, B11 and B12 overproduction : an overview. Int. J. Food Microbiol. 2009, 133, 1-7
• MA, F. Biodiesel production : a review. Bioresour. Technol. 1999, 70, 1-15
• SAVILE, C. K. Biocatalytic asymmetric synthesis of chiral amines from ketones applied to sitagliptin manufacture. Science. 2010, 329, 305-309

タイトルに関連する用語 (5件)： 代謝物質 ,  ノックアウト ,  大腸菌 ,  菌株 ,  スクリーニング