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J-GLOBAL ID：201402207951150326   整理番号：14A0604045

真核生物rRNA遺伝子を増幅する可能性は低いが,原核生物16S rRNA遺伝子を増幅する新しい非縮重ユニバーサルプライマーセットの設計及び実験的適用

Design and Experimental Application of a Novel Non-Degenerate Universal Primer Set that Amplifies Prokaryotic 16S rRNA Genes with a Low Possibility to Amplify Eukaryotic rRNA Genes

著者 (12件)： MORI Hiroshi (Tokyo Inst. Technol., Yokohama, JPN) ,  MORI Hiroshi (Tokyo Inst. Technol., Tokyo, JPN) ,  MARUYAMA Fumito (Tokyo Medical and Dental Univ., Tokyo, JPN) ,  KATO Hiromi (Tohoku Univ., Sendai, JPN) ,  TOYODA Atsushi (National Inst. Genetics, Shizuoka, JPN) ,  DOZONO Ayumi (Tokyo Inst. Technol., Yokohama, JPN) ,  OHTSUBO Yoshiyuki (Tohoku Univ., Sendai, JPN) ,  NAGATA Yuji (Tohoku Univ., Sendai, JPN) ,  FUJIYAMA Asao (National Inst. Genetics, Shizuoka, JPN) ,  FUJIYAMA Asao (National Inst. Informatics, Tokyo, JPN) ,  TSUDA Masataka (Tohoku Univ., Sendai, JPN) ,  KUROKAWA Ken (Tokyo Inst. Technol., Tokyo, JPN)
資料名： DNA Research  (DNA Research)
巻： 21  号： 2  ページ： 217-227  発行年： 2014年04月 
JST資料番号： W1628A  ISSN： 1340-2838  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： プライマー選択と関連する問題を克服するために,保存細菌及び古...

シソーラス用語： *原核生物 ,...
準シソーラス用語： ピロシークエンシング ,...

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分類 (2件)： 遺伝学研究法  (EC01020N) ,  微生物形態学・分類学  (EG03030Y)

引用文献 (42件)：

• Hamady, M. and Knight, R. 2009, Microbial community profiling for human microbiome projects: tools, techniques, and challenges, Genome Res., 19, 1141-52.
• Rappe, M.S. and Giovannoni, S.J. 2003, The uncultured microbial majority, Annu. Rev. Microbiol., 57, 369-94.
• Hamady, M.,Walker, J.J., Harris, J.K.,Gold, N.J.andKnight, R. 2008, Error-correcting barcoded primers for pyrosequencing hundreds of samples in multiplex, Nat. Methods, 5, 235-7.
• Mori, H.,Maruyama, F.andKurokawa, K.2010,VITCOMIC: visualization tool for taxonomic compositions of microbial communities based on 16S rRNA gene sequences, BMC Bioinformatics, 11, 332.
• Turnbaugh, P.J., Hamady, M., Yatsunenko, T., et al. 2009, A core gut microbiome in obese and lean twins, Nature, 457, 480-4.

タイトルに関連する用語 (8件)： 真核生物 ,  rRNA遺伝子 ,  増幅 ,  可能性 ,  原核生物 ,  縮重 ,  設計 ,  実験