文献

J-GLOBAL ID：201702223371240158   整理番号：17A0869700

Global Data Associationを用いたアメーバ状細胞の追跡手法

著者 (6件)： 間下以大 (大阪大) ,  深野淳 (大阪大) ,  白崎舞 (大阪大) ,  菊田順一 (大阪大) ,  石井優 (大阪大) ,  竹村治雄 (大阪大)
資料名： 電子情報通信学会技術研究報告  (IEICE Technical Report (Institute of Electronics, Information and Communication Engineers))
巻： 117  号： 109(NC2017 5-19)  ページ： 69-74  発行年： 2017年06月16日 
JST資料番号： S0532B  ISSN： 0913-5685  資料種別： 会議録 (C)
記事区分： 原著論文  発行国： 日本 (JPN)  言語： 日本語 (JA)

抄録/ポイント： 二光子励起顕微鏡の登場により,観察が困難とされてきた硬い石灰質に囲まれた骨組織内部を生きたままで観察することが可能となり,骨髄腔内で血液が流れる様子や骨髄腔における破骨細胞の動態を動画像として取得することが可能となった。しかし,細胞の観測に必要な細胞の動態の検出と追跡は現在専門家の手作業によって行われており,自動化が課題である。破骨細胞はアメーバ状細胞の一種であり,細胞核をもつ本体が仮足と呼ばれる細長い突出で繋がる構造をしている。動画像には実際には仮足で繋がっているはずの細胞同士が,ある時間では途切れている場合が多々存在する。それらは本当にちぎれている場合もあれば,撮影条件や細胞の活動状況等の理由で動画像に現れない場合もある。本研究では,このようなアメーバ状細胞の観測されない潜在的な細胞の一部も含めて検出し,追跡する手法を提案する。細胞追跡とラベル付けには,Global Data Associationという手法を利用し,確からしいトラックレットの集合を1本のトラックに繋ぎ直して,追跡とラベル付けを行う。専門家の手による正解データと比較した結果,再現率88%,適合率83%で細胞を検出・追跡できた。グラフカットによる領域分割は,再現率59%,適合率96%であり,提案手法は再現率で大きく上回った。また,グラフカットでは検出できなかった潜在的な細胞の一部について検出できたと思われる領域分割も見られた。(著者抄録)

シソーラス用語： *光学顕微鏡 ,  *破骨細胞 ,  顕微鏡観察 ,  *画像分析 ,  比率 ,  実験 ,  動画像 ,  評価実験 ,  アメーバ属 ,  二光子顕微鏡 ,  微生物 ,  原生動物 ,  肉質類 ,  根足虫類
準シソーラス用語： アメーバ ,  二光子励起顕微鏡 ,  再現率 ,  細胞追跡 ,  適合率

分類 (1件)： 数値計算  (JE02000J)

引用文献 (6件)：

• DOJIN NEWS,“「蛍光生物学」の最前線 7-2,” http://www.dojindo.co.jp/letterj/144/review/03.html,最終アクセス2016年2月5日.
• 独立行政法人科学技術振興機構,“世界初破骨細胞が骨を壊す様子のライブイメージングに成功-関節リウマチや骨粗鬆症,がんの骨転移に対する理想的治療法開発に光-,” http://www.jst.go.jp/pr/announce/20130117/,最終アクセス2016年2月5日.
• Cell Tracking Challenge, http://www.codesolorzano.com/celltrackingchallenge/Cell_Tracking_Challenge/Welcome.html,最終アクセス2016年2月5日.
• Liu, A-A, Li, K., and Kanade, T.,“Mitosis sequence detection using hidden conditional random fields,” IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro, pp. 580-583, 2010.
• Bise, R, Yin, Z, and Kanade, T,“RELIABLE CELL TRACKING BY GLOBAL DATA ASSOCIATION”, The IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, 2011.

タイトルに関連する用語 (4件)： アメーバ ,  細胞 ,  追跡 ,  手法