特許

J-GLOBAL ID：201803006803297111

トピックモデルを用いた遺伝子情報推定装置

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発明者： 岩山 幸治 ,  永野 惇
出願人/特許権者： 学校法人 龍谷大学
代理人 (1件)： 特許業務法人 安富国際特許事務所
公報種別：公開公報
出願番号（国際出願番号）：特願2017-033381
公開番号（公開出願番号）：特開2018-139043
出願日： 2017年02月24日
公開日（公表日）： 2018年09月06日
要約：

【課題】低コストかつ高精度で遺伝子情報を推定できる装置を提供する。【解決手段】既存のトピックモデルに基づき、遺伝子情報に適した新しいトピックモデルを用いた遺伝子情報を推定する。このモデルでは単語の生成分布を従来の多項分布から負の二項分布に置き換える。【選択図】図2

請求項（抜粋）：

(i)複数のサンプルに対応する遺伝子情報の測定データを読み込む手順、 (ii)遺伝子情報の測定データに基づき遺伝子の平均出現頻度を算出する手順、 (iii)各サンプルの各遺伝子にトピックが割り当てられる確率を初期化する手順、 (iv)遺伝子へのトピック割り当て確率を更新する手順、 (v)トピック情報を更新する手順、 (vi)トピック情報の分散を更新する手順、 (vii)負の二項分布のdispersionパラメータを更新する手順、 および、 (viii)トピック情報およびトピック出現頻度から遺伝子情報を推定する手順、 を有する、 トピックモデルを用いた遺伝子情報推定装置。

IPC (1件)：

G06F 19/24

FI (1件)：

G06F19/24

Fターム (4件)：

4B063QA01 ,  4B063QA13 ,  4B063QQ42 ,  4B063QS39