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J-GLOBAL ID：202002234774541972   整理番号：20A2059815

Phytophthora infestans由来のUDP-ガラクトース4-エピメラーゼ様L-トレオニン3-デヒドロゲナーゼの触媒特性と結晶構造【JST・京大機械翻訳】

Catalytic properties and crystal structure of UDP-galactose 4-epimerase-like l-threonine 3-dehydrogenase from Phytophthora infestans

著者 (7件)： Yoneda Kazunari (Department of Bioscience, School of Agriculture, Tokai University, 9-1-1 Toroku, Higashi-ku, Kumamoto-shi, Kumamoto, 862-8652, Japan) ,  Nagano Rina (Department of Bioscience, School of Agriculture, Tokai University, 9-1-1 Toroku, Higashi-ku, Kumamoto-shi, Kumamoto, 862-8652, Japan) ,  Mikami Takuya (Department of Bioscience, School of Agriculture, Tokai University, 9-1-1 Toroku, Higashi-ku, Kumamoto-shi, Kumamoto, 862-8652, Japan) ,  Sakuraba Haruhiko (Department of Applied Biological Science, Faculty of Agriculture, Kagawa University, 2393 Ikenobe, Miki-cho, Kita-gun, Kagawa, 761-0795, Japan) ,  Fukui Kenji (Department of Biochemistry, Osaka Medical College, 2-7 Daigakumachi, Takatsuki, Osaka, 569-8686, Japan) ,  Araki Tomohiro (Department of Bioscience, School of Agriculture, Tokai University, 9-1-1 Toroku, Higashi-ku, Kumamoto-shi, Kumamoto, 862-8652, Japan) ,  Ohshima Toshihisa (Department of Biomedical Engineering, Faculty of Engineering, Osaka Institute of Technology, 5-16-1, Ohmiya, Asahi-ku, Osaka, 535-8585, Japan)
資料名： Enzyme and Microbial Technology  (Enzyme and Microbial Technology)
巻： 140  ページ： Null  発行年： 2020年 
JST資料番号： A0989B  ISSN： 0141-0229  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 植物の病害原因菌であるPhytophthora infestans由来のUDP-ガラクトース4-エピメラーゼ様L-トレオニン3-デヒドロゲナーゼ(GalE様L-ThrDH)の3次元構造と生化学的性質を初めて報告した。遺伝子およびゲノム(KEGG)データベースの京都エンシクロペディアを用いてGalE様L-ThrDHを新しい殺菌剤の開発の候補標的として同定した。GalE様L-ThrDH遺伝子を大腸菌で発現させ,その産物を精製し,特性化した。N-アセチルグリシンは酵素の競合阻害剤(Ki=0.18mM)として作用することが分かった。ユニークな六量体GalE様L-ThrDHの結晶構造を,基質類似体であるNAD+とクエン酸の存在下で2.3Åの分解能で分子置換法を用いて測定した。分子ドッキングシミュレーションに基づいて,N-アセチルグリシン分子を活性部位にモデル化し,N-アセチルグリシンの結合モードと阻害機構を解明した。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *結晶構造 ,  データベース ,  大腸菌 ,  遺伝子 ,  基質 ,  活性部位 ,  ゲノム ,  *エピメラーゼ ,  殺菌薬 ,  *デヒドロゲナーゼ ,  脂肪族アルコール ,  脂肪族カルボン酸 ,  ヒドロキシ酸 ,  ポリカルボン酸
準シソーラス用語： 阻害機構 ,  結合モード ,  競合阻害 ,  分子ドッキングシミュレーション , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： UDP-ガラクトース4-エピメラーゼ様L-トレオニン ,  3-デヒドロゲナーゼ ,  疫病菌 ,  結晶構造 ,  酵素学的キャラクタリゼーション

分類 (3件)： 酵素一般  (EB09010D) ,  酵素の応用関連  (EB09100B) ,  微生物代謝産物の生産  (FK03020A)

物質索引 (1件)： クエン酸

タイトルに関連する用語 (6件)： Phytophthora ,  UDP-ガラクトース4-エピメラーゼ ,  L-トレオニン ,  デヒドロゲナーゼ ,  触媒特性 ,  結晶構造