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J-GLOBAL ID：202002285234312123   整理番号：20A0539630

大きな生体分子のための量子力学的計算データベースの構築に向けた自動フラグメント分子軌道(FMO)計算プロトコルの開発

Development of an automated fragment molecular orbital (FMO) calculation protocol toward construction of quantum mechanical calculation database for large biomolecules

著者 (10件)： Watanabe Chiduru (Center for Biosystems Dynamics Research, RIKEN) ,  Watanabe Chiduru (JST, PRESTO) ,  Watanabe Hirofumi (Education Center on Computational Science and Engineering, Kobe University) ,  Okiyama Yoshio (Center for Biosystems Dynamics Research, RIKEN) ,  Okiyama Yoshio (National Institute of Health Sciences) ,  Takaya Daisuke (Center for Biosystems Dynamics Research, RIKEN) ,  Fukuzawa Kaori (Center for Biosystems Dynamics Research, RIKEN) ,  Fukuzawa Kaori (Department of Physical Chemistry, School of Pharmacy and Pharmaceutical Sciences, Hoshi University) ,  Tanaka Shigenori (Graduate School of System Informatics, Kobe University) ,  Honma Teruki (Center for Biosystems Dynamics Research, RIKEN)
資料名： Chem-Bio Informatics Journal (Web)  (Chem-Bio Informatics Journal (Web))
巻： 19  ページ： 5-18(J-STAGE)  発行年： 2019年 
JST資料番号： U0216A  ISSN： 1347-0442  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 日本 (JPN)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ab initio FMO法により,創薬標的のような多数の蛋...

シソーラス用語： *分子軌道法 ,...
準シソーラス用語： ERα ,...

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著者キーワード (6件)： フラグメント分子軌道(FMO) ,  分子間相互作用 ,  配位子結合エネルギー ,  エストロゲン受容体α(ERα) ,  p38マイトジェン活性化蛋白質(MAP)キナーゼ ,  FMOデータベース

分類 (3件)： 薬物の研究法  (GV01020U) ,  蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

引用文献 (47件)：

• [1] Kitaura, K.; Ikeo, E.; Asada, T.; Nakano, T.; Uebayasi, M. Fragment Molecular Orbital Method: an Approximate Computational Method for Large Molecules. Chem. Phys. Lett. 1999, 313, 701-706.
• [2] Fedrov, D. G.; Kitaura, K. The Fragment Molecular Orbital Method: Practical Application to Large Molecular System; CRC Press, 2009.
• [3] Tanaka, S.; Mochizuki, Y.; Komeiji, Y.; Okiyama, Y.; Fukuzawa, K. Electron-correlated Fragment-molecular-orbital Calculations for Biomolecular and Nano Systems. Phys. Chem. Chem. Phys. 2014, 16, 10310-10344.
• [4] Fedorov, D. G.; Kitaura, K. Pair interaction energy decomposition analysis. J. Comp. Chem. 2007, 28, 222-237.
• [5] Tsukamoto, T.; Kato, K.; Kato, A.; Nakano, T.; Mochizuki, Y. et al. Implementation of Pair Interaction Energy Decomposition Analysis and its Applications to Protein-Ligand Systems. J. Comput. Chem. Jpn. 2015, 14, 1-9.

タイトルに関連する用語 (9件)： 生体分子 ,  量子力学 ,  計算 ,  データベース ,  構築 ,  フラグメント ,  分子軌道 ,  プロトコル ,  開発