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J-GLOBAL ID：200901059938586368
Update date: Mar. 06, 2025 Yamashita Riu
ヤマシタ リウ | Yamashita Riu
National Cancer Center Translational Informatics, EPOC
About National Cancer Center Translational Informatics, EPOC
Job title： Unit leader
Research field (5)：
Tumor biology
, Genetics
, Systems genomics
, Genomics
, Biological, health, and medical informatics
Research keywords (7)：
spatial-omics analysis
, image analysis
, multi-omics
, transcription, translation
, cancer genome
, データベース
, microbiome analysis
Research theme for competitive and other funds (2)： - 2023 - 2026 卵巣癌における腸管マイクロバイオームとPARP阻害薬の効果に関する研究
- 2006 - 2007 転写制御領域のためのデータベース構築、及び解析
- Shunsuke A Sakai, Ryosuke Nomura, Satoi Nagasawa, SungGi Chi, Ayako Suzuki, Yutaka Suzuki, Mitsuho Imai, Yoshiaki Nakamura, Takayuki Yoshino, Shumpei Ishikawa, et al. SpatialKNifeY (SKNY): Extending from spatial domain to surrounding area to identify microenvironment features with single-cell spatial omics data. PLoS computational biology. 2025. 21. 2. e1012854
- Yoshiaki Nakamura, Hiroshi Ozaki, Makoto Ueno, Yoshito Komatsu, Satoshi Yuki, Taito Esaki, Hiroya Taniguchi, Yu Sunakawa, Kensei Yamaguchi, Ken Kato, et al. Targeted therapy guided by circulating tumor DNA analysis in advanced gastrointestinal tumors. Nature medicine. 2025. 31. 1. 165-175
- Shunsuke A Sakai, Koichi Saeki, SungGi Chi, Yamato Hamaya, Junyan Du, Masaki Nakamura, Hidehiro Hojo, Takashi Kojima, Yoshiaki Nakamura, Hideaki Bando, et al. Mathematical modeling predicts optimal immune checkpoint inhibitor and radiotherapy combinations and timing of administration. Cancer immunology research. 2024
- Kohei Shitara, Kei Muro, Jun Watanabe, Kentaro Yamazaki, Hisatsugu Ohori, Manabu Shiozawa, Atsuo Takashima, Mitsuru Yokota, Akitaka Makiyama, Naoya Akazawa, et al. Baseline ctDNA gene alterations as a biomarker of survival after panitumumab and chemotherapy in metastatic colorectal cancer. Nature medicine. 2024. 30. 3. 730-739
- Hidekazu Oyoshi, Junyan Du, Shunsuke A Sakai, Riu Yamashita, Masayuki Okumura, Atsushi Motegi, Hidehiro Hojo, Masaki Nakamura, Hidenari Hirata, Hironori Sunakawa, et al. Comprehensive single-cell analysis demonstrates radiotherapy-induced infiltration of macrophages expressing immunosuppressive genes into tumor in esophageal squamous cell carcinoma. Science advances. 2023. 9. 50. eadh9069
- 山下 理宇, 酒井 俊輔, 澤田 憲太郎, 洞澤 智至, 吉河 歩, 藤澤 孝夫, 中村 能章, 吉野 孝之. 胃癌における腸内細菌叢の臨床的意義 がんゲノムスクリーニング調査MONSTARを利用した癌腫横断的な腸内細菌叢解析と解析ツールQINDAOの開発. 日本胃癌学会総会記事. 2024. 96回. 191-191
- 池 成基, 濱谷 和, 酒井 俊輔, 影山 俊一郎, 山下 理宇, 土原 一哉, 南 陽介. 急性骨髄性白血病における残存クローンとCHIP. 日本血液学会学術集会. 2023. 85回. 436-436
- 大吉 秀和, 山下 理宇, 茂木 厚, 北條 秀博, 小谷 大輔, 小島 隆嗣, 中村 優香, 小嶋 基寛, 鈴木 絢子, 善光 純子, et al. 時空間解析による放射線治療による食道がん患者組織での免疫環境変化の解析. 日本癌治療学会学術集会抄録集. 2023. 61回. O45-2
- 大吉 秀和, 杜 君顔, 酒井 俊輔, 山下 理宇, 奥村 真之, 中村 匡希, 平田 秀成, 砂川 弘憲, 矢野 友規, 小島 隆嗣, et al. 1細胞解析を用いた放射線治療による食道癌患者組織での免疫学的変化の経時的解析(Temporal single-cell analysis reveals time-dependent immunological modulation by radiotherapy in esophageal cancer). 日本癌学会総会記事. 2023. 82回. 1973-1973
- 澤田 憲太郎, 山下 理宇, 酒井 俊輔, 吉河 歩, 洞澤 智至, 中村 能章, 藤澤 孝夫, 門脇 重憲, 安井 久晃, 高橋 直樹, et al. 胃がん患者における腸内細菌叢と臨床的特徴の検討 SCRUM-Japan MONSTAR-SCREEN. 日本胃癌学会総会記事. 2023. 95回. 166-166
Professional career (1)：
- バイオサイエンス (奈良先端科学技術大学院大学)
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.
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