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J-GLOBAL ID:200901059938586368   Update date: Jun. 24, 2024

Yamashita Riu

ヤマシタ リウ | Yamashita Riu
Affiliation and department:
Job title: Unit leader
Research field  (5): Tumor biology ,  Genetics ,  Systems genomics ,  Genomics ,  Biological, health, and medical informatics
Research keywords  (7): spatial-omics analysis ,  image analysis ,  multi-omics ,  transcription, translation ,  cancer genome ,  データベース ,  microbiome analysis
Research theme for competitive and other funds  (2):
  • 2023 - 2026 卵巣癌における腸管マイクロバイオームとPARP阻害薬の効果に関する研究
  • 2006 - 2007 転写制御領域のためのデータベース構築、及び解析
Papers (71):
  • Kohei Shitara, Kei Muro, Jun Watanabe, Kentaro Yamazaki, Hisatsugu Ohori, Manabu Shiozawa, Atsuo Takashima, Mitsuru Yokota, Akitaka Makiyama, Naoya Akazawa, et al. Baseline ctDNA gene alterations as a biomarker of survival after panitumumab and chemotherapy in metastatic colorectal cancer. Nature medicine. 2024. 30. 3. 730-739
  • Hidekazu Oyoshi, Junyan Du, Shunsuke A Sakai, Riu Yamashita, Masayuki Okumura, Atsushi Motegi, Hidehiro Hojo, Masaki Nakamura, Hidenari Hirata, Hironori Sunakawa, et al. Comprehensive single-cell analysis demonstrates radiotherapy-induced infiltration of macrophages expressing immunosuppressive genes into tumor in esophageal squamous cell carcinoma. Science advances. 2023. 9. 50. eadh9069
  • Hisaaki Kudo, Noriko Ishida, Takahiro Nobukuni, Yuichi Aoki, Sakae Saito, Ichiko Nishijima, Takahiro Terakawa, Masayuki Yamamoto, Naoko Minegishi, Riu Yamashita, et al. Detection and Correction of Sample Misidentifications in a Biobank Using the MassARRAY System and Genomic Information. Biopreservation and biobanking. 2023
  • Takeshi Kajiwara, Tomohiro Nishina, Riu Yamashita, Yoshiaki Nakamura, Manabu Shiozawa, Satoshi Yuki, Hiroya Taniguchi, Hiroki Hara, Takashi Ohta, Taito Esaki, et al. Sidedness-Dependent Prognostic Impact of Gene Alterations in Metastatic Colorectal Cancer in the Nationwide Cancer Genome Screening Project in Japan (SCRUM-Japan GI-SCREEN). Cancers. 2023. 15. 21
  • Junyan Du, Shun-Ichiro Kageyama, Riu Yamashita, Kosuke Tanaka, Masayuki Okumura, Atsushi Motegi, Hidehiro Hojo, Masaki Nakamura, Hidenari Hirata, Hironori Sunakawa, et al. Transposable elements potentiate radiotherapy-induced cellular immune reactions via RIG-I-mediated virus-sensing pathways. Communications biology. 2023. 6. 1. 818-818
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MISC (76):
  • 山下 理宇, 酒井 俊輔, 澤田 憲太郎, 洞澤 智至, 吉河 歩, 藤澤 孝夫, 中村 能章, 吉野 孝之. 胃癌における腸内細菌叢の臨床的意義 がんゲノムスクリーニング調査MONSTARを利用した癌腫横断的な腸内細菌叢解析と解析ツールQINDAOの開発. 日本胃癌学会総会記事. 2024. 96回. 191-191
  • 池 成基, 濱谷 和, 酒井 俊輔, 影山 俊一郎, 山下 理宇, 土原 一哉, 南 陽介. 急性骨髄性白血病における残存クローンとCHIP. 日本血液学会学術集会. 2023. 85回. 436-436
  • 大吉 秀和, 山下 理宇, 茂木 厚, 北條 秀博, 小谷 大輔, 小島 隆嗣, 中村 優香, 小嶋 基寛, 鈴木 絢子, 善光 純子, et al. 時空間解析による放射線治療による食道がん患者組織での免疫環境変化の解析. 日本癌治療学会学術集会抄録集. 2023. 61回. O45-2
  • 大吉 秀和, 杜 君顔, 酒井 俊輔, 山下 理宇, 奥村 真之, 中村 匡希, 平田 秀成, 砂川 弘憲, 矢野 友規, 小島 隆嗣, et al. 1細胞解析を用いた放射線治療による食道癌患者組織での免疫学的変化の経時的解析(Temporal single-cell analysis reveals time-dependent immunological modulation by radiotherapy in esophageal cancer). 日本癌学会総会記事. 2023. 82回. 1973-1973
  • 澤田 憲太郎, 山下 理宇, 酒井 俊輔, 吉河 歩, 洞澤 智至, 中村 能章, 藤澤 孝夫, 門脇 重憲, 安井 久晃, 高橋 直樹, et al. 胃がん患者における腸内細菌叢と臨床的特徴の検討 SCRUM-Japan MONSTAR-SCREEN. 日本胃癌学会総会記事. 2023. 95回. 166-166
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Patents (5):
Professional career (1):
  • バイオサイエンス (奈良先端科学技術大学院大学)
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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