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J-GLOBAL ID:202001002655408532   Update date: May. 14, 2024

Nishio Haruki

ニシオ ハルキ | Nishio Haruki
Affiliation and department:
Job title: Assistant professor
Other affiliations (1):
Research field  (2): Plants: molecular biology and physiology ,  Ecology and environmental science
Research keywords  (7): Flowering regulation ,  Environmental memory of Plants ,  Epigenetics ,  Bioinformatics ,  Time series modeling ,  Machine learning ,  Image analysis
Research theme for competitive and other funds  (10):
  • 2024 - 2028 アブラナ科植物における季節的な遺伝子制御の種間比較
  • 2023 - 2028 BVOC放出とストレス耐性を連動させるエピゲノム分子基盤の解明
  • 2022 - 2025 SfMを用いた道路走行環境の三次元復元に関する研究
  • 2022 - 2025 車載カメラにおける周辺環境認識や自己位置推定に関する研究
  • 2023 - 2024 時系列トランスクリプトームによる植物の適応進化の解析
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Papers (13):
  • Hiroyuki Shimono, Reo Sato, Akira Abe, Haruki Nishio, Hiroshi Kudoh. Genetic progress for floral morphology under different nitrogen of rice cultivars in Japan. Agronomy Journal. 2024
  • Satoyuki Hirano, Minoru Noguchi, Chonprakun Thagun, Haruki Nishio, Yutaka Kodama. Levels of photoactivated phototropin modulate signal transmission during the chloroplast accumulation response. Plant, Cell & Environment. 2024
  • Masahide Seki, Yuta Kuze, Xiang Zhang, Ken-ichi Kurotani, Michitaka Notaguchi, Haruki Nishio, Hiroshi Kudoh, Takuya Suzaki, Satoko Yoshida, Sumio Sugano, et al. An improved method for the highly specific detection of transcription start sites. Nucleic Acids Research. 2023. gkad1116
  • Haruki Nishio, Taiji Kawakatsu, Nobutoshi Yamaguchi. Beyond heat waves: Unlocking epigenetic heat stress memory in Arabidopsis. Plant Physiology. 2023. kiad558
  • Haruki Nishio, Satoyuki Hirano, Yutaka Kodama. Statistical analysis of organelle movement using state-space models. Plant Methods. 2023. 19. 1. 67
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MISC (4):
  • 西尾 治幾. 植物の季節応答、動物の胚発生、細胞のガン化に共通する仕組み. 京都大学生態学研究センターニュース. 2021. 147. 12-12
  • 西尾 治幾. 植物が春を認識して開花期間を決める仕組み. 生物工学会誌「バイオミディア」. 2020. 98. 10. 552-552
  • 西尾 治幾. in natura研究に魅せられて. 京都大学生態学研究センターニュース. 2016. 134. 6-6
  • Haruki Nishio, Atsushi J. Nagano, Diana M. Buzas, Hiroshi Kudoh. Seasonal analysis of histone modifications at FLOWERING LOCUS C in a natural perennial population. Genes & Genetic Systems. 2013. 88. 6. 336-336
Books (1):
  • エピジェネティクスの生態学
    文一総合出版 2017
Lectures and oral presentations  (26):
  • 非生物的ストレスの記憶および花成制御における冬の記憶
    (第71回日本生態学会大会 2024)
  • 冬季における葉の老化調節の停止
    (第71回日本生態学会大会 2024)
  • Circadian and environmental signal integration in a natural population of Arabidopsis
    (第65回日本植物生理学会年会 2024)
  • シロイヌナズナ属の長期低温ストレスに応答するH3K27me3 を介した制御機構
    (第65回日本植物生理学会年会 2024)
  • 冬季の長期低温に応答する遺伝子のH3K27me3を介した発現制御
    (第11回植物RNA研究ネットワークシンポジウム 2023)
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Education (3):
  • 2012 - 2016 Kyoto University Graduate School of Science Division of Biological Science, Doctoral Course
  • 2010 - 2012 Kyoto University Graduate School of Science Division of Biological Science, Master's Course
  • 2006 - 2010 Kobe University Faculty of Science Department of Biology
Professional career (3):
  • 学士(理学) (神戸大学)
  • 修士(理学) (京都大学)
  • 博士(理学) (京都大学)
Work history (5):
  • 2022/07 - 現在 Kyoto University Center for Ecological Research Assistant professor
  • 2022/04 - 現在 Shiga University Data Science and AI Innovation Research Promotion Center Assistant professor
  • 2020/04 - 現在 Ryukoku University Part-time lecturer
  • 2021/04 - 2022/03 Shiga University Center for Data Science Education and Research Assistant Professor
  • 2016/08 - 2021/03 Kyoto University Center for Ecological Research Postdoctoral researcher
Awards (3):
  • 2021/03 - English Presentation Audience Award, the 68th Annual Meeting of ESJ
  • 2017/09 - The Genetics Society of Japan GGS Prize 2017 From the laboratory to the field: assaying histone methylation at FLOWERING LOCUS C innaturally growing Arabidopsis halleri
  • 2015/03 - Poster Presentation Award, the 62th Annual Meeting of ESJ
Association Membership(s) (4):
Japanese Society for Bioinformatics ,  The Japan Statistical Society ,  日本植物生理学会 ,  日本生態学会
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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