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J-GLOBAL ID：202301013582557589   Update date: Jun. 06, 2024

Shiba Tomoo

シバ トモオ | Shiba Tomoo
Affiliation and department：
Kyoto Institute of Technology

About Kyoto Institute of Technology


Job title： Professor
Research field  (2)： Parasitology ,  Structural biochemistry
Research keywords  (6)： PLP酵素 ,  赤痢アメーバ ,  トリパノソーマ ,  寄生虫学 ,  構造生物化学 ,  構造生物学
Research theme for competitive and other funds  (9)：
  • 2017 - 2020 人獣共通感染症病原体アフリカ型トリパノソーマのイソクエン酸代謝:新規な宿主環境適応機構と創薬標的
  • 2017 - 2019 Development of alternative oxidase inhibitors for the treatment of African trypanosomiasis
  • 2015 - 2018 Study on the reaction mechanism of type II NADH dehydrogenase by structural and biochemical analyses of the enzyme-inhibitor interaction.
  • 2014 - 2017 Drug development of African sleeping sickness targeting energy metabolic pathway
  • 2012 - 2017 分子創薬による家畜寄生虫症の制御
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Papers (75)：
  • Touya Toyomoto, Katsuhiko Ono, Tomoo Shiba, Kenta Momitani, Tianli Zhang, Hiroyasu Tsutsuki, Takeshi Ishikawa, Kanae Hoso, Koma Hamada, Azizur Rahman, et al. Alkyl gallates inhibit serine O-acetyltransferase in bacteria and enhance susceptibility of drug-resistant Gram-negative bacteria to antibiotics. Frontiers in Microbiology. 2023. 14
  • Ryo Ikunishi, Ryohei Otani, Takahiro Masuya, Kyoko Shinzawa-Itoh, Tomoo Shiba, Masatoshi Murai, Hideto Miyoshi. Respiratory complex I in mitochondrial membrane catalyzes oversized ubiquinones. Journal of Biological Chemistry. 2023. 105001-105001
  • Shigehiro Enkai, Hirokazu Kouguchi, Daniel Ken Inaoka, Tomoo Shiba, Masahito Hidaka, Hiroyuki Matsuyama, Takaya Sakura, Kinpei Yagi, Kiyoshi Kita. Killing Two Birds with One Stone: Discovery of Dual Inhibitors of Oxygen and Fumarate Respiration in Zoonotic Parasite, Echinococcus multilocularis. Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 2023
  • Augustin Tshibaka Kabongo, Rajib Acharjee, Takaya Sakura, Gloria Mavinga Bundutidi, Endah Dwi Hartuti, Cadi Davies, Ozan Gundogdu, Kiyoshi Kita, Tomoo Shiba, Daniel Ken Inaoka. Biochemical characterization and identification of ferulenol and embelin as potent inhibitors of malate:quinone oxidoreductase from Campylobacter jejuni. Frontiers in Molecular Biosciences. 2023. 10
  • Arif Nurkanto, Riyo Imamura, Yulia Rahmawati, Erwahyuni Endang Prabandari, Danang Waluyo, Takeshi Annoura, Kazuki Yamamoto, Masakazu Sekijima, Yuki Nishimura, Takayoshi Okabe, et al. Dephospho-Coenzyme A Kinase Is an Exploitable Drug Target against Plasmodium falciparum: Identification of Selective Inhibitors by High-Throughput Screening of a Large Chemical Compound Library. Antimicrobial agents and chemotherapy. 2022. 66. 11. e0042022
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MISC (36)：
  • 大川 敦司, 志波 智生, 林 将也, 尾上 友基, 室田 昌輝, 佐藤 暖, 稲垣 純子, 田村 隆, 原田 繁春, 稲垣 賢二. L-メチオニン脱炭酸酵素のX線結晶構造と基質特異性の構造的基盤. ビタミン. 2021. 95. 331-335
  • 城戸 康年, 杉浦 悠毅, 中釜 悠, 稲岡 健ダニエル, 志波 智生, 斎本 博之, 山本 雅一, 上村 尚人, 金子 明, 北 潔. 構造生物学から観た寄生適応の分子戦略 メタボローム解析による薬剤標的の評価とアフリカトリパノソーマ症に対する早期臨床開発. 日本生化学会大会プログラム・講演要旨集. 2019. 92回. [2S06m-05]
  • 城戸 康年, 杉浦 悠毅, 中釜 悠, 稲岡 健ダニエル, 志波 智生, 斎本 博之, 山本 雅一, 上村 尚人, 金子 明, 北 潔. 構造生物学から観た寄生適応の分子戦略 メタボローム解析による薬剤標的の評価とアフリカトリパノソーマ症に対する早期臨床開発. 日本生化学会大会プログラム・講演要旨集. 2019. 92回. [2S06m-05]
  • 佐藤 暖, 志波智生, 湯之戸俊介, 古谷和大, 福本充樹, 工藤大蔵, 田村 隆, 稲垣賢二, 原田繁春. メチオニン γ-リアーゼ C116H 変異体は基質支援触媒作用によって ホモシステインを分解する. ビタミン. 2017. 92. 117-120
  • 西藤 万智, 志波 智生, 上田 慧, 稲岡 ダニエル健, 城戸 康年, バログン・エマニエル, アントニー・ムーア, 斎本 博之, 北 潔, 原田 繁春. アフリカトリパノソーマのシアン耐性酸化酵素(TAO)とクマリン骨格をもつ新規阻害剤との複合体結晶構造. 日本生化学会大会プログラム・講演要旨集. 2016. 89回. [2P-114]
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Patents (2)：
Books (2)：
  • 生命科学から創薬へのイノベーション
    南山堂 2014 ISBN:9784525134518
  • アカデミア創薬の戦略と実例
    実験医学増刊 (ISSN:02885514) 2014
Lectures and oral presentations  (21)：
  • ダイズGlycine max由来 L-メチオニン γ-リアーゼ2の結晶構造
    (日本生化学会大会 2022)
  • ダイズGlycine max由来 L-メチオニン γ-リアーゼのX線結晶構造解析
    (日本蛋白質科学会大会 2022)
  • 放線菌Streptomyce sp.590由来L-メチオニン脱炭酸酵素Y421F変異体のX線結晶構造解析
    (日本蛋白質科学会大会 2021)
  • Trypanosoma brucei由来イソクエン酸脱水素酵素D252N変異体の構造
    (令和2年(2020)年度日本結晶学会大会 2020)
  • 熱帯熱マラリア原虫由来ジヒドロオロト酸脱水素酵素 の阻害剤開発に向けた構造生物学的研究
    (令和2年(2020)年度日本結晶学会大会 2020)
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Education (3)：
  • 1995 - 2000 The University of Tokyo Graduate School of Pharmaceutical Sciences
  • 1993 - 1995 Osaka University Graduate School of Engineering
  • 1989 - 1993 大阪大学 工学部・応用精密化学科
Work history (7)：
  • 2019/01 - 現在 Kyoto Institute of Technology Graduate School of Science and Technology
  • 2011/06 - 2019/01 Kyoto Institute of Technology Graduate School of Science and Technology
  • 2009/08 - 2011/06 The University of Tokyo Graduate School of Medicine
  • 2006/04 - 2009/08 The University of Tokyo Graduate School of Arts and Sciences
  • 2005/06 - 2006/03 The University of Tokyo Graduate School of Arts and Sciences
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Awards (1)：
  • 2005/12 - 日本結晶学会 日本結晶学会進歩賞
Association Membership(s) (3)：
日本蛋白質科学会 ,  日本生化学会 ,  日本結晶学会
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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