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J-GLOBAL ID:201301061402659114   Update date: May. 28, 2021

OTOMO Kohei

オオトモ コウヘイ | OTOMO Kohei
Affiliation and department:
Job title: 助教
Other affiliations (1):
Homepage URL  (1): https://www.nips.ac.jp/bp/index.html
Research field  (1): Biophysics
Research keywords  (4): two-photon microscopy ,  super resolution microscopy ,  Bio-imaging ,  Spectroscopy for biomolecules
Research theme for competitive and other funds  (9):
  • 2020 - 2026 記憶を司るシナプス微小構造の時空間ダイナミクス(代表:林康紀)
  • 2020 - 2025 ニューロフォトニクスの創成による脳機能の創発原理の探究
  • 2020 - 2023 Super-resolution visualization analysis of neural circuit function utilizing nonlinear optical laser technology
  • 2018 - 2022 生体内ナノ構造を長期間にわたり可視化追跡する超解像顕微鏡法の開発
  • 2015 - 2020 ベクトルレーザー光を用いた高速in vivoイメージング技術の高度化と応用
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Papers (25):
  • Taiga Takahashi, Hong Zhang, Kohei Otomo, Yosuke Okamura, Tomomi Nemoto. Protocol for constructing an extensive cranial window utilizing a PEO-CYTOP nanosheet for in vivo wide-field imaging of the mouse brain. STAR Protocols. 2021. 2. 2. 100542-100542
  • Chentao Wen, Takuya Miura, Venkatakaushik Voleti, Kazushi Yamaguchi, Motosuke Tsutsumi, Kei Yamamoto, Kohei Otomo, Yukako Fujie, Takayuki Teramoto, Takeshi Ishihara, et al. 3DeeCellTracker, a deep learning-based pipeline for segmenting and tracking cells in 3D time lapse images. eLife. 2021. 10. e59187
  • Kazushi Yamaguchi, Kohei Otomo, Yuichi Kozawa, Motosuke Tsutsumi, Tomoko Inose, Kenji Hirai, Shunichi Sato, Tomomi Nemoto, Hiroshi Uji-i. Adaptive Optical Two-Photon Microscopy for Surface-Profiled Living Biological Specimens. ACS Omega. 2021. 6. 1. 438-447
  • Sakuya Nakamura, Shinya Hagihara, Kohei Otomo, Hiroyuki Ishida, Jun Hidema, Tomomi Nemoto, Masanori Izumi. Autophagy contributes to quality control of leaf mitochondria. Plant and Cell Physiology. 2020
  • Taiga Takahashi, Hong Zhang, Ryosuke Kawakami, Kenji Yarinome, Masakazu Agetsuma, Junichi Nabekura, Kohei Otomo, Yosuke Okamura, Tomomi Nemoto. PEO-CYTOP Fluoropolymer Nanosheets as a Novel Open-Skull Window for Imaging of the Living Mouse Brain. iScience. 2020. 23. 10. 101579-101579
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MISC (15):
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Patents (1):
  • 照明装置及び照明光生成方法
Books (3):
  • 実験医学増刊 生きてるものは全部観る!イメージングの選び方・使い方100+
    羊土社 2018
  • Super-Resolution Imaging in Biomedicine
    CRC Press (Taylor & Francis Group) 2016
  • 実験医学別冊 初めてでもできる!超解像イメージング
    羊土社 2016
Lectures and oral presentations  (49):
  • Improving two-photon excitation microscopy for deeper, sharper and/or faster intravital imaging
    (44th Meeting of Australian Society for Biophysics 2020)
  • Two-photon excitation confocal spinning-disk microscopy for real-time visualizations of biological phenomena
    (A3 Foresight & 5 Star Alliance Joint Workshop on Organic/Inorganic Hybrid Nano Materials and Bio Imaging 2020)
  • 二光子励起顕微鏡の機能向上による多次元生細胞イメージング
    (生理学研究所研究会 「細胞システム理解のためのシグナル応答原理解明の最前線」 2020)
  • Two-Photon Excitation Spinning-Disk Confocal Microscopy and Its Biological Applications
    (Focus On Microscopy 2020 2020)
  • Improvements of two-photon microscopy techniques for understanding intravital phenomena
    (The 8th RIEC International Symposium on Brain Functions and Brain Computer 2020)
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Education (2):
  • 2004 - 2009 Tohoku University
  • 1999 - 2004 Tohoku University
Professional career (1):
  • 博士(薬学) (東北大学)
Work history (8):
  • 2019/12 - 現在 The Graduate University for Advanced Studies School of Life Science Department of Physiological Sciences Assistant Professor
  • 2019/12 - 現在 National Institutes for Natural Sciences National Institute for Physiological Science Assistant Professor
  • 2019/12 - 現在 National Institute for Natural Sciences ExCELLS Assistant Professor
  • 2016/04 - 2019/11 Hokkaido University Graduate School of Information Science and Technology Division of Bioengineering and Bioinformatics Assistant Professor
  • 2016/04 - 2019/11 Hokkaido University Research Institute for Electronic Sciences Assistant Professor
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Awards (8):
  • 2019/02 - コニカミノルタ科学技術振興財団 コニカミノルタ画像科学奨励賞 高速偏光分解二光子顕微鏡法による生体内小胞動態の高次可視化解析
  • 2018/09 - 日本バイオイメージング学会 ベストイメージ賞浜松ホトニクス賞 多点走査型2光子顕微鏡による4重標識生細胞の3次元経時観察
  • 2018/09 - 日本バイオイメージング学会 ベストイメージ賞ニコン賞 多点走査型 2 光子顕微鏡への偏光光学系の導入と生体イメージングへの応用
  • 2017/12 - 日本顕微鏡学会北海道支部会 優秀ポスター賞 多点走査型二光子顕微鏡による生体組織の高速SHGイメージング
  • 2017/09 - 日本バイオイメージング学会 2017年度 ベストイメージ・ZEISS賞 多点走査型2光子顕微鏡を用いたマウス膵臓におけるin vivo Ca2+イメージング
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Association Membership(s) (1):
BIOIMAGING SOCIETY
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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