Rchr
J-GLOBAL ID:201301061402659114
Update date: Dec. 16, 2024
OTOMO Kohei
オオトモ コウヘイ | OTOMO Kohei
Affiliation and department:
Job title:
Senior Associate Professor
Other affiliations (1):
Homepage URL (1):
http://www.dbsb.science
Research field (3):
Bio-, chemical, and soft-matter physics
, Pharmaceuticals - analytical and physicochemistry
, Biophysics
Research keywords (5):
Light-sheet microscopy
, two-photon microscopy
, super resolution microscopy
, Bio-imaging
, Spectroscopy for biomolecules
Research theme for competitive and other funds (24):
- 2024 - 2032 細胞内タンパク質分子の空間ストイキオメトリ解析
- 2024 - 2030 先端レーザー光制御が導く脳機能の時空間縦断イメージング技術の創成
- 2024 - 2026 三次元多細胞体の多階層縦断ライブイメージング
- 2020 - 2026 記憶を司るシナプス微小構造の時空間ダイナミクス(代表:林康紀)
- 2022 - 2025 Comprehensive recording of brain activity and behavior by an auto-tracking ultra-fast volume imaging system
- 2022 - 2025 Multi-dimensional, less-invasive intravital imaging based on high-speed two-photon microscopy
- 2020 - 2025 ニューロフォトニクスの創成による脳機能の創発原理の探究
- 2021 - 2023 変性タンパク質の高次構造をin vivo可視化する三次元分子配向イメージング
- 2020 - 2023 Super-resolution visualization analysis of neural circuit function utilizing nonlinear optical laser technology
- 2020 - 2022 アドオン型高速ボリュームイメージングデバイスの開発
- 2021 - 2022 等散乱尖鋭プリズムの創出と生体脳透明化技術の融合による脳深部イメージング観察限界の突破
- 2021 - 2022 スペクトル符号化法による脳深部 in vivo イメージングの実証実験
- 2021 - 2022 機能性無機ナノ粒子を用いた生体への局所熱刺激および超解像イメージング
- 2021 - 2022 褪色フリーな生体イメージングによる侵襲性評価に基づいた赤外レーザーメスの開発
- 2020 - 2022 神経科学・光工学・データ科学の融合による線虫の全脳機能的神経回路の同定
- 2018 - 2022 生体内ナノ構造を長期間にわたり可視化追跡する超解像顕微鏡法の開発
- 2019 - 2021 高速偏光分解二光子顕微鏡法による生体内小胞動態の高次可視化解析
- 2020 - 2020 多点走査型二光子顕微鏡による低侵襲5D生体イメージング法の開発
- 2015 - 2020 ベクトルレーザー光を用いた高速in vivoイメージング技術の高度化と応用
- 2016 - 2018 生きた脂質微小ドメインを可視化する高速超解像顕微鏡法の開発
- 2014 - 2017 新規レーザー技術を駆使した神経・分泌機能のin vivo超解像イメージングの開発
- 2015 - 2016 多点走査型二光子顕微鏡による生体深部の高速多次元イメージング
- 2013 - 2015 多光子励起光活性化法を利用した生体深部の単一細胞cAMP濃度制御手法の開発
- 2010 - 2015 生体深部の可視化と操作が同時に可能な個体用in vivo二光子顕微鏡の開発と応用
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Papers (40):
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Takashi Murata, Motosuke Tsutsumi, Kohei Otomo, Tomomi Nemoto. Cell Division Imaging of Tobacco BY-2 Cells in a 3D Volume by Two-Photon Spinning-Disk Confocal Microscopy. Methods in Molecular Biology. 2024. 2872. 37-50
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Masanori Izumi, Sakuya Nakamura, Kohei Otomo, Hiroyuki Ishida, Jun Hidema, Tomomi Nemoto, Shinya Hagihara. Autophagosome development and chloroplast segmentation occur synchronously for piecemeal degradation of chloroplasts. eLife. 2024. 12
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Kaito Nakata, Joe Sakamoto, Kohei Otomo, Masanao Sato, Hirokazu Ishii, Motosuke Tsutsumi, Ryosuke Enoki, Tomomi Nemoto. Amyloid-β-induced Alteration of Fast and Localized Calcium Elevations in Cultured Astrocytes. bioRxiv. 2024
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Kohei Otomo, Takaki Omura, Yuki Nozawa, Steven J. Edwards, Yukihiko Sato, Yuri Saito, Shigehiro Yagishita, Hitoshi Uchida, Yuki Watakabe, Kiyotada Naitou, et al. descSPIM: an affordable and easy-to-build light-sheet microscope optimized for tissue clearing techniques. Nature Communications. 2024. 15. 1. 4941-1-4941-19
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Taiga Takahashi, Hong Zhang, Masakazu Agetsuma, Junichi Nabekura, Kohei Otomo, Yosuke Okamura, Tomomi Nemoto. Large-scale cranial window for in vivo mouse brain imaging utilizing fluoropolymer nanosheet and light-curable resin. Communications Biology. 2024. 7. 1. 232-1-232-13
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MISC (26):
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野沢裕貴, 大友康平, 大村鷹希, 洲﨑悦生. descSPIM ユーザーアフォーダブルなDIY透明化組織用小型ライトシート顕微鏡. 生体の科学. 2024. 75. 6. 625-630
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Kohei Otomo, Taiga Takahashi, Hirokazu Ishii, Tomomi Nemoto, Etsuo A Susaki. Novel fluorescence microscopy for revealing 3D biological microstructures: deeper, wider, and sharper. Experimental Medicine. 2024. 19. 12. 2961-2967
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堤 元佐, 大友康平, 石井宏和, 根本知己. 2光子励起顕微鏡法の高度化と顕微鏡観察支援. 生体の科学. 2024. 75. 5. 396-397
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Akira L. Yoshikawa, Kohei Otomo, Etsuo A. Susaki. Overview of light sheet fluorescence microscopy and tissue clearing. OPTRONICS. 2024. 43. 3. 65-69
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Kohei OTOMO, Hirokazu ISHII, Tomomi Nemoto. Novel two-photon excitation microscopy for mullti-dimensional intravital imaging. Bunko-kenkyu. 2023. 72. 1. 30-39
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Patents (1):
Books (7):
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正しい結果を得るためのイメージング&画像解析実践テキスト : あなたの目的にあった顕微鏡の選択と撮像、定量解析フローの組み立て
羊土社 2024 ISBN:9784758122719
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正しい結果を得るためのイメージング&画像解析実践テキスト : あなたの目的にあった顕微鏡の選択と撮像、定量解析フローの組み立て
羊土社 2024 ISBN:9784758122719
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実験医学別冊 ライトシート顕微鏡実践ガイド組織透明化&ライブイメージング : 臓器も個体も"まるごと"観る!オールインワン型からローコストDIY顕微鏡まで
2023 ISBN:9784758122689
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実験医学別冊 ライトシート顕微鏡実践ガイド組織透明化&ライブイメージング : 臓器も個体も"まるごと"観る!オールインワン型からローコストDIY顕微鏡まで
2023 ISBN:9784758122689
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実験医学増刊 生きてるものは全部観る!イメージングの選び方・使い方100+
羊土社 2018
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Lectures and oral presentations (78):
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Proposal of DIY light-sheet microscope for 3D histological researches
(2024)
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DIY construction and customization of microscopy systems for medical research
(The 47th Annual Meeting of the Molecular Biology Society of Japan 2024)
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Novel 3D fluorescence microscopy to visualize internal microstructures of biological tissues
(CMX Workshop Emergence Conference 2024)
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Multi-dimensional bioimaging utilizing DIY microscopy system
(Laboratory Automation Monthly Workshop 2024)
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Visualization analysis approaches to reveal microstructures in opaque living specimens
(第 33 回日本バイオイメージング学会学術集会 2024)
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Education (2):
- 2004 - 2009 Tohoku University Graduate School of Pharmaceutical Sciences
- 1999 - 2004 Tohoku University Faculty of Pharmaceutical Sciences
Professional career (1):
Work history (13):
- 2024/11 - 現在 Juntendo University Biochemistry II, Faculty of Medicine Senior Associate Professor
- 2024/11 - 現在 Juntendo University Department of Biochemistry and Systems Biomedicine, Graduate School of Medicine Associate Professor (Concurrent)
- 2021/10 - 現在 National Institute for Physiological Sciences, National Institutes of Natural Sciences Associate Professor (Concurrent)
- 2021/10 - 現在 Exploratory Research Center on Life and Living Systems, National Institute of Natural Sciences Associate Professor (Concurrent)
- 2021/10 - 2024/10 Graduate School of Medicine, Juntendo University Associate Professor
- 2019/12 - 2021/09 The Graduate University for Advanced Studies School of Life Science Department of Physiological Sciences Assistant Professor
- 2019/12 - 2021/09 National Institutes for Natural Sciences National Institute for Physiological Science Assistant Professor
- 2019/12 - 2021/09 National Institute for Natural Sciences ExCELLS Assistant Professor
- 2016/04 - 2019/11 Hokkaido University Graduate School of Information Science and Technology Division of Bioengineering and Bioinformatics Assistant Professor
- 2016/04 - 2019/11 Hokkaido University Research Institute for Electronic Sciences Assistant Professor
- 2012/06 - 2016/03 Hokkaido University Research Institute for Electronic Science
- 2011/04 - 2012/05 Tokyo Institute of Technology Graduate School of Science and Engineering
- 2009/04 - 2011/03 The Graduate University for Advanced Studies
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Awards (11):
- 2022/12 - 15th International Symposium of Nanomedicine Poster Award Amyloid-β dimers enhance localized fast calcium elevations
- 2022/12 - 日本分子生物学会 MBSJ 2022 サイエンスピッチアワード descSPIM:ユーザーアフォーダブルな透明化組織用小型光シート顕微鏡
- 2022/09 - 日本バイオイメージング学会 ベストイメージング・浜松ホトニクス(晝馬)賞 高分子超薄膜を活用したマウス脳の長期的な広視野in vivo二光子イメージング
- 2019/02 - コニカミノルタ科学技術振興財団 コニカミノルタ画像科学奨励賞 高速偏光分解二光子顕微鏡法による生体内小胞動態の高次可視化解析
- 2018/09 - 日本バイオイメージング学会 ベストイメージ賞浜松ホトニクス賞 多点走査型2光子顕微鏡による4重標識生細胞の3次元経時観察
- 2018/09 - 日本バイオイメージング学会 ベストイメージ賞ニコン賞 多点走査型 2 光子顕微鏡への偏光光学系の導入と生体イメージングへの応用
- 2017/12 - 日本顕微鏡学会北海道支部会 優秀ポスター賞 多点走査型二光子顕微鏡による生体組織の高速SHGイメージング
- 2017/09 - 日本バイオイメージング学会 2017年度 ベストイメージ・ZEISS賞 多点走査型2光子顕微鏡を用いたマウス膵臓におけるin vivo Ca2+イメージング
- 2015/04 - the Japanese Society of Analytical Chemistry Hot Article Award Analytical Sciences Multi-point Scanning Two-photon Excitation Microscopy by Utilizing a High-peak-power 1042-nm Laser
- 2014/09 - 日本バイオイメージング学会 2014年度 ベストイメージ・OLYMPUS賞 励起レーザー光学系の最適化による多点走査方式2 光子顕微鏡法の改良
- 2014/09 - 日本バイオイメージング学会 2014年度 ベストイメージ・賞晝馬賞 スーパーコンティニュウム光を用いた多色励起高速共焦点顕微鏡法
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Association Membership(s) (3):
The Japanese Biochemical Society
, MBSJ
, BIOIMAGING SOCIETY
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