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J-GLOBAL ID：201702267005168016   整理番号：17A0748424

未知であるが3次元構造膜蛋白質の熱安定化変異の同定【Powered by NICT】

Identification of thermostabilizing mutations for a membrane protein whose three-dimensional structure is unknown

著者 (9件)： Kajiwara Yuta (Department of Fundamental Energy Science, Graduate School of Energy Science, Kyoto University, Uji, Kyoto, 611-0011, Japan) ,  Yasuda Satoshi (Department of Chemistry, Graduate School of Science, Chiba University, 1-33 Yayoi-cho, Inage, Chiba, 263-8522, Japan) ,  Yasuda Satoshi (Molecular Chirality Research Center, Chiba University, 1-33 Yayoi-cho, Inage, Chiba, 263-8522, Japan) ,  Yasuda Satoshi (Laboratory for Complex Energy Processes Section, Institute of Advanced Energy, Kyoto University, Uji, Kyoto, 611-0011, Japan) ,  Takamuku Yuuki (Department of Chemistry, Graduate School of Science, Chiba University, 1-33 Yayoi-cho, Inage, Chiba, 263-8522, Japan) ,  Murata Takeshi (Department of Chemistry, Graduate School of Science, Chiba University, 1-33 Yayoi-cho, Inage, Chiba, 263-8522, Japan) ,  Murata Takeshi (Molecular Chirality Research Center, Chiba University, 1-33 Yayoi-cho, Inage, Chiba, 263-8522, Japan) ,  Murata Takeshi (JST, PRESTO, 1-33 Yayoi-cho, Inage, Chiba, 263-8522, Japan) ,  Kinoshita Masahiro (Laboratory for Complex Energy Processes Section, Institute of Advanced Energy, Kyoto University, Uji, Kyoto, 611-0011, Japan)
資料名： Journal of Computational Chemistry  (Journal of Computational Chemistry)
巻： 38  号： 4  ページ： 211-223  発行年： 2017年 
JST資料番号： C0111B  ISSN： 0192-8651  CODEN： JCCHDD  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 最近膜蛋白質の熱安定化突然変異を同定するための物理学に基づく方法を開発した。脂質二分子層内の炭化水素基の並進エントロピーの重要性を強調したこの方法は,自由エネルギー関数Fを用いた。変異の全ては急速に調べることができる。法はアデノシンA_2a受容体(A_2aR)を図解したが実験的に決定された三次元(3D)構造は,野生型構造として利用した。九単一変異と安定化あるいは不安定化であると予測された二重変異は実験結果を参考にしてチェックした成功率は著しく高かった。本研究では,A_2aRの3D構造は未知であると仮定した。相同性モデリングを用いた3次元構造のための候補モデルを構築し,蛋白質折畳みに及ぼすFの変化に最低値を与えるモデルを選択した。達成された性能は最近の研究でよりも少しだけ低かった。Copyright 2017 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 三次元 ,  炭化水素 ,  相同性 ,  野生型 ,  *膜タンパク質 ,  モデリング ,  突然変異 ,  エントロピー ,  脂質二分子膜 ,  *熱安定化 ,  高速度 ,  タンパク質折畳み ,  *遺伝的変異
準シソーラス用語： *変異 ,  不安定化 ,  *三次元構造 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 蛋白質 ,  脂質二分子層 ,  自由エネルギー関数 ,  溶媒和エントロピー ,  水素結合

分類 (2件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  分子の電子構造  (BH05010Q)

タイトルに関連する用語 (5件)： 3次元構造 ,  膜蛋白質 ,  熱安定化 ,  変異 ,  同定