- 2023 - 2028 光合成ユビキティ:あらゆる地球環境で光合成を可能とする超分子構造制御
- 2023 - 2028 チラコイド膜リモデリング因子の構造に基づく光合成環境適応原理
- 2024 - 2027 チラコスタシスの解明に基づく葉緑体生物学の再構成
- 2021 - 2024 チラコイド膜リモデリングと光合成の環境適応
- 2017 - 2021 葉緑体が獲得したプロセッシブな蛋白質・核酸分解と機能分化の統合理解
- 2016 - 2021 新光合成:光エネルギー変換システムの再最適化
- 2016 - 2021 プロトン駆動力による電子伝達のフィードバック制御
- 2018 - 2020 葉のステイグリーンと植物環境適応のミッシングリンク解明
- 2013 - 2016 被子植物に共通する誘導型オルガネラDNA分解とサルベージ機能の解明
- 2010 - 2012 巨大葉緑体イネ変異体の利用による葉緑体ゲノム改変技術の確立
- 2010 - 2011 植物のアロ認証に伴う雄側ミトコンドリアの排除とゲノム分解システムの普遍性
- 2009 - 2011 チラコイド膜プロテアーゼFtsHの安定性とTHF1との相互作用
- 2006 - 2010 光合成・光エネルギー変換装置のダイナミクスとその分子基盤の解明
- 2007 - 2008 配偶子形成におけるプラスチドの役割と葉緑体への分化・維持に関する研究
- 2007 - 2008 植物の葉における斑入りと環境適応
- 2005 - 2006 花粉の核性を支配する分子機構の解明
- 2003 - 2005 高等植物ミトコンドリアの分裂・融合機構の解明と形質転換系の確立
- 2003 - 2004 植物の葉が斑入りを起こす分子メカニズム
- 2001 - 2002 マイクロダイセクションによるライムギ由来小型染色体の分子的解析
- 2001 - 2002 イネアントシアニン着色に関する制御遺伝子群の解析と分子育種
- 1998 - 2001 イネ・トマトにおける易変性葉緑素突然変異を利用したトランスポゾンの捕捉
- 2000 - 2000 オオムギ染色体DNAライブラリーの構築とゲノム解析への利用
- 1999 - 2000 レーザマイクロダイセクションによる染色体特異的DNAライブラリーの構築-コムギ第1同祖群染色体の分子的解析
- 1999 - 2000 キメラ性葉緑素突然変異の解析と原因遺伝子に関する研究
- 1998 - 1999 植物染色体のセントロメアの分子構造と機能に関する研究
- 1998 - 1998 器官分化におけるミトコンドリアの動態と制御系に関する研究
- 1997 - 1998 細胞質遺伝を制御する核遺伝子の同定と機能の解析
- 1997 - 1997 植物の器官形成におけるミトコンドリアの役割と遺伝子発現
- 1995 - 1995 植物の器官形成におけるミトコンドリアの役割とその遺伝子発現
- 1995 - 1995 ターミナルフラワー等花器分化に関する遺伝子の構造と機能及び普遍性に関する研究
- 1995 - 1995 ミトコンドリア形質転換のための遺伝的選択マーカーの開発
- 1994 - 1994 ミトコンドリアの遺伝子発現により引き起こされる雄性不稔現象の解明
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