- 2023 - 2026 感染症対策が駆動する新型コロナウイルスの進化予測とウィズコロナ
- 2022 - 2025 作物の水輸送効率の最適化に向けた根の通過細胞数の遺伝学的解析
- 2020 - 2025 複雑臓器制御系の数理的包括理解と超早期精密医療への挑戦
- 2022 - 2024 植物器官の周期的出現パタンとその変調による個体の「かたち」の多様性の統合的理解
- 2021 - 2024 植物3次元形態の数理モデル化によるフェノタイピング基盤技術の開発
- 2020 - 2024 シーボルト標本を用いた江戸の自然の科学的復元
- 2019 - 2024 三次元データベースと数理解析・モデル構築による分野統合的研究の促進
- 2020 - 2023 博物館資料の3D形態学:形状認識の定量化、高精度化、および展示公開への活用
- 2018 - 2023 貝殻らせん成長メカニズムの解明:進化発生古生物学創成に向けて
- 2020 - 2023 「かたち」に関する数理科学基盤の構築および諸分野への社会実装
- 2019 - 2021 作物3D形態ベンチマークデータセットの構築による植物フェノタイピング研究の加速
- 2018 - 2021 Systems Bone Biology~骨・軟骨疾患の発症予測から疾患予防へ
- 2016 - 2020 マルチスケールデータ融合による草姿・草型の超解像フェノタイピング技術の開発
- 2012 - 2015 形態の適応と形成過程の数理的研究
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