- 2024 - 2026 南西諸島の冬虫夏草類の多様性の現状把握および微生物資源の保存
- 2019 - 2023 自然免疫と内部共生の境界線を探る -非自己の許容がもたらす細胞内共生の進化-
- 2018 - 2022 全地球規模で解き明かすカメムシ共生細菌の多様性と進化
- 2017 - 2022 昆虫-微生物共生可能性の探索と分子基盤の解明
- 2018 - 2021 ミバエ類の腸内細菌が土壌環境の改変により寄主植物に与える影響の解明
- 2017 - 2019 冬虫夏草がセミ共生真菌に進化した遺伝的基盤と生物機能の解明
- 2015 - 2018 モノクローナル抗体によるシロアリ腸内共生細菌の表層木質分解酵素分子の探索
- 2014 - 2017 昆虫における菌細胞共生進化解明のためのカメムシゲノム解読と形質転換系統の作製
- 2016 - 宿主の遺伝子操作にもとづく昆虫細胞内共生システムの解明
- 2013 - 2016 菌細胞塊形成の分子発生機構解明 - 共生器官の進化発生学
- 2010 - 2012 昆虫の保有する共生器官-菌細胞塊の発生過程および特異的に発現する遺伝子群の解析
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