文献

J-GLOBAL ID：201402229161074330   整理番号：14A0898384

Burrows-Wheelerアルゴリズムを用いたDNA塩基配列位置推定のための高並列FPGAアクセラレータ

Highly-Parallel FPGA Accelerator for DNA Sequence Alignment Using the Burrows-Wheeler Algorithm

著者 (3件)： WAIDYASOORIYA Hasitha M. (東北大 大学院情報科学研究科) ,  張山昌論 (東北大 大学院情報科学研究科) ,  亀山充隆 (東北大 大学院情報科学研究科)
資料名： 電子情報通信学会技術研究報告  (IEICE Technical Report (Institute of Electronics, Information and Communication Engineers))
巻： 114  号： 75(RECONF2014 1-16)  ページ： 17-20  発行年： 2014年06月04日 
JST資料番号： S0532B  ISSN： 0913-5685  資料種別： 会議録 (C)
記事区分： 原著論文  発行国： 日本 (JPN)  言語： 日本語 (JA)

抄録/ポイント： バイオインフォマティクスではDNA塩基配列位置推定は遺伝子解...

シソーラス用語： *ヌクレオチド配列 ,...
準シソーラス用語： ゲノムマッピング

ログイン（無料）して見る     続きはJDreamIII（有料）にて 

分類 (1件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

引用文献 (8件)：

• H. Li, “Maq: Mapping and assembly with qualities”, http://maq.sourceforge.net/, 2008.
• B. Langmead, C. Trapnell, M. Pop, and S. Salzberg, “Ultrafast and memory-efficient alignment of short dna sequences to the human genome”, Genome Biology, Vol.10, No.3, p.R25, 2009.
• Heng Li and Richard Durbin, “Fast and accurate short read alignment with Burrows-Wheeler transform”, Bioinfomatics, Vol.25, No.14, pp.1754-1760, 2009.
• N. Homer, B. Merriman and S. F. Nelson, “BFAST: An Alignment Tool for Large Scale Genome Resequencing”, PLoS ONE, vol.4, No.11, p.e7767, 2009.
• M. Burrows and D. J. Wheeler, “A block-sorting lossless data compression algorithm”, Digital Equipment Corporation, Palo Alto, CA, Technical report 124, 1994.

タイトルに関連する用語 (5件)： アルゴリズム ,  DNA塩基配列 ,  位置推定 ,  FPGA ,  アクセラレータ