資源
J-GLOBAL ID:201410029005389667
研究資源コード:NBDC00598
更新日:2017年01月30日
Noncoding RNA database
Noncoding RNA database
保有機関:
資源分類:
データ・データベース
タグ【対象】 (1件):
RNA
タグ【データの種類】 (1件):
配列
生物種 (3件):
Bacteria (NCBI Taxonomy ID: 2)
, Archaea (NCBI Taxonomy ID: 2157)
, Eukaryota (NCBI Taxonomy ID: 2759)
概要:
非コードRNAの配列と機能に関する情報を収集したデータベースです。真正細菌、古細菌、真核生物の99生物種について30,000以上の配列が登録されています。配列情報はGenBank、アノテーション情報はFANTOM3(マウス)、H-inviational Integrated Database(ヒト)、ゲノムマッピング情報はUCSCゲノムブラウザを用いています。細菌由来の低分子量細胞質RNA(scRNA)の配列とアノテーションはRfamデータベースを用いています。
microRNA、snoRNAや、rRNA、tRNA、snRNA、SPR RNAのようなハウスキーピングRNAについては収録していませんが、他のデータベースへのリンクがあります。
作成機関:
NBDC
レコード管理者:
Integbio Database Catalog
本レコードの利用条件:
Creative Commons CC0 license
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