MassBase: A comprehensive mass spectral tags archive for plant metabolomics

保有機関：

公益財団法人かずさDNA研究所

資源分類：データ・データベース

タグ【対象】 (1件)：代謝物

タグ【データの種類】 (1件)：手法

生物種 (17件)： Acacia mangium (NCBI Taxonomy ID: 224085) , Arabidopsis thaliana (NCBI Taxonomy ID: 3702) , Cosmos bipinnatus (NCBI Taxonomy ID: 51277) , Dicksonia antarctica (NCBI Taxonomy ID: 3271) , Escherichia coli (NCBI Taxonomy ID: 562) , Glycine max (NCBI Taxonomy ID: 3847) , Hevea brasiliensis (NCBI Taxonomy ID: 3981) , Jatropha curcas (NCBI Taxonomy ID: 180498) , Lotus japonicus (NCBI Taxonomy ID: 34305) , Medicago sativa (NCBI Taxonomy ID: 3879) , Medicago truncatula (NCBI Taxonomy ID: 3880) , Mus musculus (NCBI Taxonomy ID: 10090) , Nicotiana tabacum (NCBI Taxonomy ID: 4097) , Saccharomyces cerevisiae (NCBI Taxonomy ID: 4932) , Solanum lycopersicum (NCBI Taxonomy ID: 4081) , Solanum pimpinellifolium (NCBI Taxonomy ID: 4084) , Thellungiella halophila (NCBI Taxonomy ID: 98038)

概要：

MassBaseは代謝産物(メタボライト)に関するマススペクトラルタグ(MST)のアーカイブです。主に植物の生体サンプルやその代謝産物から得られた生のクロマトグラムデータおよびクロマトグラムデータを解析したテキストデータを収録しています。MassBankやKNApSAcKのような他のデータベースと組み合わせて興味のある代謝を理解するだけでなく、代謝物質ピークを抽出し、代謝物質をアノテイトするパイプライン・ソフトウェアを開発するためにも活用できます。全てのデータセットがダウンロード可能です。

作成機関： NBDC

レコード管理者： Integbio Database Catalog

本レコードの利用条件： Creative Commons CC0 license

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