- 2024 - 2027 種間比較から紐解く形態的な二次性徴形質の多様化機構の解明
- 2024 - 2027 色素細胞の創出と喪失の進化発生メカニズム
- 2023 - 2027 性決定システムの転換をもたらした進化メカニズムの解明
- 2024 - 2026 視覚シグナルを介した種内コミュニケーションの脳の分子神経基盤の解明
- 2023 - 2026 装飾形質をシグナルとした配偶者選好性を司る神経基盤の解明
- 2020 - 2026 種分化を規定するゲノム構造
- 2021 - 2025 魚類ソーシャルビジョンの分子・遺伝基盤の解明
- 2024 - 2025 ゲノム情報を活用した次世代水産物育種技術の確立
- 2021 - 2024 熱帯の多様性創出における急速な性染色体置換の役割
- 2022 - 2024 メダカ野生由来系統のゲノム多型情報整備
- 2023 - 2024 品種特異的なゲノム解析によるゲノム編集水産品種の育種効果の向上
- 2021 - 2023 メダカ黒色婚姻色の多様化をもたらす性的葛藤遺伝子の同定
- 2019 - 2023 XY型からZW型への性決定システムの進化
- 2018 - 2021 失われた野性味から明らかにする自然環境特異的な生体調節のメカニズム
- 2018 - 2020 メダカ科魚類における性的二型多様化の進化遺伝機構
- 2016 - 2019 メダカ科魚類における性的葛藤遺伝子の同定と機能解析
- 2016 - 2019 脊椎動物の社会性行動の遺伝・神経基盤の解明
- 2013 - 2016 人工ヌクレアーゼを用いた標的遺伝子組換えメダカ作出技術の確立
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