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J-GLOBAL ID：201702228930316718   整理番号：17A0177619

ギブスサンプラに基づくアミノ酸配列モチーフの高精度抽出法

Method for High-precision Motif Extraction Based on Gibbs Sampler in Amino Acid Sequences

著者 (5件)： 高橋誉文 (広島市大 大学院情報科学研究科) ,  北上始 (広島市大 大学院情報科学研究科) ,  福本翔平 (広島市大 大学院情報科学研究科) ,  森康真 (広島市大 大学院情報科学研究科) ,  田村慶一 (広島市大 大学院情報科学研究科)
資料名： 情報処理学会論文誌トランザクション 数理モデル化と応用(Web)  (情報処理学会論文誌 数理モデル化と応用(Web))
巻： 9  号： 3  ページ： 32-43 (WEB ONLY)  発行年： 2016年12月14日 
JST資料番号： U0475A  ISSN： 1882-7780  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 日本 (JPN)  言語： 日本語 (JA)

抄録/ポイント： アミノ酸配列データベースから類似部分配列を抽出することとして...

シソーラス用語： *アミノ酸配列 ,...
準シソーラス用語： *サンプリング法 ,...

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分類 (1件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

引用文献 (50件)：

• Lawrence, C.E., Altscul, S.F., Boguski, M.S., Liu, J.S., Neuwald, A.F. and Wootton, J.C.: Detecting Subtle Sequence Signals: A Gibbs Sampling Strategy for Multiple Alignment, Science, Vol.262, No.513, pp.208-214 (1993).
• Liu, L.-f. and Jiao, L.-c.: A Greedy Two-stage Gibbs Sampling Method for Motif Discovery in Biological Sequences, Journal of Information Science and Engineering, Vol.26, pp.2309-2318 (2010).
• Thompson, W., Rouchka, E.C. and Lawrence, C.E.: Gibbs Recursive Sampler: Finding transcription factor binding sites, Nucleic Acids Research, Vol.31, Issue 13, pp.3580-3585 (2003).
• The Gibbs Motif Sampler Homepage, available from http://ccmbweb.ccv.brown.edu/gibbs/gibbs.html
• Laskowski, R.A.: SURFNET: A program for visualizing molecular surfaces, cavities and intermolecular interactions, Journal of Molecular Graphics, Vol.13, Issue 5, pp.323-330 (Oct. 1995).

タイトルに関連する用語 (4件)： サンプラ ,  アミノ酸配列 ,  モチーフ ,  抽出法