- 2022 - 2025 抗菌薬が促進する養殖環境中の耐性遺伝子拡散と高度耐性菌出現のメカニズム
- 2021 - 2025 パンゲノム-表現型関連解析による遅発育抗酸菌のニッチ適応戦略の解明
- 2021 - 2024 宿主ゲノム・病原体ゲノムの統合解析から迫る肺非結核性抗酸菌症の病態解明
- 2018 - 2023 養殖環境で生じる多剤耐性遺伝子の細菌プラスミドから染色体への乗り換え機構の解明
- 2018 - 2021 有性生殖を介した抗酸菌進化モデルの実験と集団ゲノミクスによる検証
- 2020 - 2020 水産養殖場に分布する薬剤耐性トランスポゾンの宿主移動と進化のメカニズム
- 2015 - 2019 養殖環境中の多剤耐性菌が利用する遺伝子伝達メカニズムとその多様性
- 2015 - 2018 エピゲノム駆動進化に倣う微生物育種
- 2015 - 2016 塩基切り出し型制限酵素という驚き:構造と機能からエピジェネティクスの起源へ
- 2013 - 2016 DNAメチル化酵素の配列認識変換の機構解明とエピゲノム育種への応用
- 2013 - 2016 エピゲノムのデジタル変換による適応進化:オーミクスと実験進化による検証
- 2014 - 2015 DNAの鎖を切る代わりに塩基を切り出す制限酵素
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