特許

J-GLOBAL ID：201903007082326186

タンパク質-RNA相互作用の検出

発明者： 増田 章男 ,  大野 欽司
出願人/特許権者： 国立大学法人名古屋大学
代理人 (1件)： 萩野 幹治
公報種別：公開公報
出願番号（国際出願番号）：特願2017-137406
公開番号（公開出願番号）：特開2019-017281
出願日： 2017年07月13日
公開日（公表日）： 2019年02月07日
要約：

【課題】より簡便かつ短時間で、しかも少量の試料であっても生体内タンパク質-RNA相互作用の解析を可能にする、新たな手法を提供することを課題とする。【解決手段】(1)供試細胞内のタンパク質-RNA結合を架橋するステップ、(2)ステップ(1)後の供試細胞を溶解し、細胞溶解液を調製するステップ、(3)細胞溶解液中の標的タンパク質-RNA複合体を、標的特異的抗体を介してビーズ上に捕捉するステップ、(4)ビーズを回収し、捕捉された標的タンパク質-RNA複合体をエンドヌクレアーゼで処理するステップ、(5)ステップ(4)後のビーズ上の標的タンパク質-RNA複合体を5'→3'エキソヌクレアーゼで処理するステップ、(6)ステップ(5)後のビーズ上の標的タンパク質-RNA複合体をプロテアーゼで処理するステップ、(7)ステップ(6)の処理液からRNAを回収し、シーケンシング解析するステップを含む、タンパク質-RNA相互作用を検出する方法が提要される。【選択図】図1

請求項（抜粋）：

以下のステップ(1)〜(7)を含む、タンパク質-RNA相互作用を検出する方法: (1)供試細胞内のタンパク質-RNA結合を架橋するステップ、 (2)ステップ(1)後の供試細胞を溶解し、細胞溶解液を調製するステップ、 (3)細胞溶解液中の標的タンパク質-RNA複合体を、標的特異的抗体を介してビーズ上に捕捉するステップ、 (4)ビーズを回収し、捕捉された標的タンパク質-RNA複合体をエンドヌクレアーゼで処理するステップ、 (5)ステップ(4)後のビーズ上の標的タンパク質-RNA複合体を5'→3'エキソヌクレアーゼで処理するステップ、 (6)ステップ(5)後のビーズ上の標的タンパク質-RNA複合体をプロテアーゼで処理するステップ、 (7)ステップ(6)の処理液からRNAを回収し、シーケンシング解析するステップ。

IPC (3件)：

C12Q 1/68 ,  G01N 33/50 ,  G01N 33/543

FI (3件)：

C12Q1/68 Z ,  G01N33/50 P ,  G01N33/543 541A

Fターム (13件)：

2G045AA25 ,  2G045CB01 ,  2G045DA14 ,  4B063QA01 ,  4B063QA18 ,  4B063QQ52 ,  4B063QQ79 ,  4B063QR14 ,  4B063QR16 ,  4B063QR62 ,  4B063QS25 ,  4B063QX01 ,  4B063QX02