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J-GLOBAL ID：201001007717673941
Update date: Jan. 13, 2025 MICHIAKI HAMADA
ハマダ ミチアキ | MICHIAKI HAMADA
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Waseda University Faculty of Science and Engineering
About Waseda University Faculty of Science and Engineering
Job title： Professor
Other affiliations (2)：
- National Institute of Advanced Industrial Science and Technology AIST-Waseda University Computational Bio Big-Data Open Innovation Laboratory (CBBD-OIL) Team Leader
- Nippon Medical University Graduate School Visiting Professor
Research field (4)：
Systems genomics
, Genomics
, Biological, health, and medical informatics
, Intelligent informatics
Research keywords (13)：
RNA therapeutics
, Artificial Intelligence
, probabilistic model
, RNA-protein interaction
, RNA-RNA interaction
, interactome
, long noncoding RNA (lncRNA)
, epi-transcriptome
, epi-genome
, RNA aptamer
, sequece analysis
, RNA
, Bioinformatics
Research theme for competitive and other funds (23)： - 2022 - 2028 Platform for Advanced Genome Science
- 2024 - 2027 RNAリインカネーション
- 2024 - 2026 The lncRNA landscape of skeletal muscle cell biotransformation with aging.
- 2023 - 2026 Overview and Systematic Understanding of Biological Phase Separation Based on RNA-Centric Molecular Networks
- 2021 - 2024 AIアプタマー創薬プロジェクト
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- Ikuo Kurisaki, Michiaki Hamada. Deep learning generatesapoRNA conformations with cryptic ligand binding site. 2025
- Keisuke Yamada, Kanta Suga, Naoko Abe, Koji Hashimoto, Susumu Tsutsumi, Masahito Inagaki, Fumitaka Hashiya, Hiroshi Abe, Michiaki Hamada. Multi-objective computational optimization of human 5′ UTR sequences. 2024
- Kenzui Taniue, Anzu Sugawara, Chao Zeng, Han Han, Xinyue Gao, Yuki Shimoura, Atsuko Nakanishi Ozeki, Rena Onoguchi-Mizutani, Masahide Seki, Yutaka Suzuki, et al. The MTR4/hnRNPK complex surveils aberrant polyadenylated RNAs with multiple exons. Nature communications. 2024. 15. 1. 8684-8684
- Masato Kosuge, Jumpei Ito, Michiaki Hamada. Landscape of evolutionary arms races between transposable elements and KRAB-ZFP family. Scientific reports. 2024. 14. 1. 23358-23358
- Ryo Amano, Masaki Takahashi, Kazumi Haga, Mizuki Yamamoto, Kaku Goto, Akiko Ichinose, Michiaki Hamada, Jin Gohda, Jun-ichiro Inoue, Yasushi Kawaguchi, et al. A chimeric RNA consisting of siRNA and aptamer for inhibiting dengue virus replication. NAR Molecular Medicine. 2024
- Tsukasa Fukunaga, Michiaki Hamada. Fast RNA-RNA Interaction Prediction Methods for Interaction Analysis of Transcriptome-Scale Large Datasets. Methods in molecular biology (Clifton, N.J.). 2023. 2586. 163-173
- 高橋 聡, 野呂 林太郎, 吉川 明子, 中道 真仁, 菅野 哲平, 松本 優, 武内 進, 平尾 真季子, 松田 久仁子, Zeng Chao, et al. ドライバー遺伝子異常肺癌の薬剤耐性機序における長鎖ノンコーディングRNAの意義. 日本呼吸器学会誌. 2020. 9. 増刊. 177-177
- 高橋 聡, 野呂 林太郎, 吉川 明子, 中道 真仁, 菅野 哲平, 松本 優, 武内 進, 平尾 真季子, 松田 久仁子, Zeng Chao, et al. ドライバー遺伝子異常肺癌の薬剤耐性機序における長鎖ノンコーディングRNAの意義. 日本呼吸器学会誌. 2020. 9. 増刊. 177-177
- Akira Orimo, Yasuhiko Ito, Yoshihiro Mezawa, Kaidiliavi Sulidan, Yataro Daigo, Nadila Wali, Okio Hino, Kazuyoshi Takeda, Michiaki Hamada, Yuko Matsumura. CAFs induce formation of metastatic human breast tumor cell clusters with partial epithelial-mesenchymal transition. CANCER SCIENCE. 2018. 109. 797-797
- 藤田 理紗, 有村 泰宏, 山本 達郎, 浜田 道昭, 斉藤 典子, 胡桃坂 仁志. 非コードRNA Eleanorはヌクレオソーム中のヒストンの交換を促進する. 生命科学系学会合同年次大会. 2017. 2017年度. [3PT18-0555)]
Books (14)：
- ゲノム配列情報解析
コロナ社 2024 ISBN:9784339027358 - 核酸医薬 〜モダリティ・合成・分析・DDSの最新動向〜
(株)エヌ・ティー・エス 2024 ISBN:9784860438869 - あなたのラボから薬を生み出すアカデミア創薬の実践 : all Japan体制の先端技術支援を利用した創薬の最前線
羊土社 2024 ISBN:9784758104166 - 機械学習を用いた アプタマー配列の解析と創薬、実験医学別冊 Pythonで実践 生命科学データの機械学習
羊土社 2023 ISBN:9784758122634 - 機械学習による遺伝子転写制御に関わる因子の探索, 月刊細胞
ニューサイエンス社 2022
-
GFlowNets による多様性制御生成モデルの学習
(第27回情報論的学習理論ワークショップ(IBIS2024)、電子情報通信学会 情報論的学習理論と機械学習研究会) -
ベイズ最適化によるCap2型mRNA生産の最適条件の探索
(第55回 中部化学関係学協会支部連合秋季大会) -
Deep generative model for functional RNA design
(BIOINFO 2024) -
Information technology accelerating RNA therapeutics
(RNA and Developmental Biology A Symposium Commemorating the End of the 12-Year RNA Medical Science Laboratory 2024) -
タンパク質言語モデルを用いたコロナウイルスの宿主予測
(生命情報科学若手の会 第16回年会)
- 2005 - 2009 Tokyo Institute of Technology Interdisciplinary Science and Engineering Intelligent Systems Science
- 2000 - 2002 Tohoku University Graduate School of Science Department of Mathematics
- 1996 - 2000 Tohoku University
- Ph.D. (Tokyo Institute of Technology)
- 2023/04 - 現在 Japanese Society for Bioinformatics (JSBi) Vice president
- 2022/04 - 現在 早稲田大学 次代の中核研究者
- 2018/04 - 現在 Waseda University Faculty of Science and Engineering Professor
- 2017/04 - 現在 Nippon Medical School
- 2016/10 - 現在 産業技術総合研究所 生体システムビッグデータ解析オープ ンイノベーションラボラトリ(CBBD-OIL) 招聘研究員 / 班長
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- 2024/09 - 現在 早稲田大学 人を対象とする研究に関する倫理審査委員会B 委員長
- 2023/04 - 現在 Japanese Society for Bioinformatics Vice president
- 2022/06 - 現在 mRNA Targeted Drug Discovery Research Organization board of directors
- 2020/04 - 現在 Japanese Society for Bioinformatics
- 2021/09 - 2021年日本バイオインフォマティクス学会年会・第10回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2021) congress president
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- 2024/11 - Waseda University Okuma Memorial Academic Award (Encouragement Award)
- 2023/07 - Waseda University Waseda University Teaching Award Bioinformatics
- 2022/04 - 早稲田大学 早稲田大学 次代の中核研究者 2022
- 2021/12 - 早稲田大学 早稲田大学リサーチアワード(国際研究発信力)
- 2017/04 - 文部科学省 平成29年度科学技術分野の文部科学大臣表彰 若手科学者賞
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※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.
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