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J-GLOBAL ID：201702226958908225   整理番号：17A0045930

野生型/突然変異型チトロームP450 1A2の三次元構造と構造柔軟性の分子動力学シミュレーションを用いた予測

Prediction of three-dimensional structures and structural flexibilities of wild-type and mutant cytochrome P450 1A2 using molecular dynamics simulations

著者 (8件)： Watanabe Yurie (Faculty of Pharmacy, Institute of Medical, Pharmaceutical and Health Sciences, Kanazawa University, Kanazawa, Ishikawa, Japan) ,  Fukuyoshi Shuichi (Faculty of Pharmacy, Institute of Medical, Pharmaceutical and Health Sciences, Kanazawa University, Kanazawa, Ishikawa, Japan) ,  Hiratsuka Masahiro (Graduate School of Pharmaceutical Sciences, Tohoku University, Aoba-ku, Sendai, Miyagi, Japan) ,  Yamaotsu Noriyuki (School of Pharmacy, Kitasato University, Minato-ku, Tokyo, Japan) ,  Hirono Shuichi (School of Pharmacy, Kitasato University, Minato-ku, Tokyo, Japan) ,  Takahashi Ohgi (Fuculty of Pharmaceutical Science, Tohoku Pharmaceutical University, Aoba-ku, Sendai, Miyagi, Japan) ,  Oda Akifumi (Faculty of Pharmacy, Institute of Medical, Pharmaceutical and Health Sciences, Kanazawa University, Kanazawa, Ishikawa, Japan) ,  Oda Akifumi (Institute for Protein Research, Osaka University, Suita, Osaka, Japan)
資料名： Journal of Molecular Graphics & Modelling  (Journal of Molecular Graphics & Modelling)
巻： 68  ページ： 48-56  発行年： 2016年07月 
JST資料番号： B0044D  ISSN： 1093-3263  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 本研究では,チトロームP450 1A2(CYP1A2)の三次元立体配座に及ぼす遺伝多型の影響を分子動力学(MD)シミュレーションを利用し調べた。チトクロームP450酵素(CYP)の中で主な薬物代謝酵素CYP1A2は,多くの変形対立遺伝子を持つことが知られている。CYP1A2の遺伝多型は薬物動力学の個体差を生じさせる。100ns以上のMDシミュレーション実行により,蛋白質の3D構造と動特性に及ぼすアミノ酸突然変異の影響を調べた。結果では,アミノ酸残基突然変異により,静的構造が,蛋白質の突然変異残基周辺に加え離れた部分でも変化させられることを示した。更に,ほんの1つのアミノ酸突然変異でさえ,蛋白質の構造柔軟性を変化させ,基質認識や酵素活性に影響することを示した。結果では,突然変異CYP1A2の酵素活性変化を理解するために静的3D構造に加え動特性を調べることが必要であることを示唆した。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.

シソーラス用語： チトクロームP450 ,  遺伝子多型 ,  対立遺伝子 ,  薬物動力学 ,  *野生型 ,  *突然変異体 ,  *アミノ酸残基 ,  構造 ,  立体配座 ,  *柔軟性 ,  計算機シミュレーション ,  薬物代謝酵素 ,  個体差 ,  *動特性 ,  分子認識 ,  酵素活性度 ,  プログラムパッケージ
準シソーラス用語： *チトクロームP-450CYP1A2 ,  *遺伝多型 ,  突然変異種 ,  *三次元構造 ,  *分子動力学シミュレーション ,  基質認識 ,  酵素活性 ,  AMBER

分類 (5件)： 酵素一般  (EB09010D) ,  分子構造  (EB03020Y) ,  遺伝的変異  (EC01030Y) ,  アミノ酸  (CF10070V) ,  分子の電子構造  (BH05010Q)

タイトルに関連する用語 (4件)： 野生型 ,  変異型 ,  分子動力学シミュレーション ,  予測